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基于主成分分析优化参数预测水解酶的亚类

王莹  程薇薇  
【摘要】:本文基于前人建立的数据库,以氨基酸组分、氨基酸紧邻组分、预测的二级结构、低频功率谱密度值和MEME模体及功能模体频数组成向量来表示序列信息,用主成分分析对序列向量进行分析,选取20个主要成分。将每条序列由20维向量来表示。用SVM算法对水解酶的亚类分别进行分类预测,在Jack-knife检验下的预测总精度为96.9%。

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