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水稻雄配子体发育过程中tRNA片段的生物信息学分析

刘魏  童永鳌  白洁  
【摘要】:tRNA片段(t RF)是t RNA通过非随机剪切产生的RNA片段,其产生和功能机制尚不明确;而在水稻(Oryza sativa)雄配子体发育过程中,人们对t RNA更是知之甚少。通过高通量测序,在水稻雄配子体发育过程中发现了长度范围较大的t RFs;进一步采用logo对t RFs两端的序列进行分析,发现了4个有序列特征(其中3个未见报道)和1个无序列特征的酶切位点;通过NCBI Blast预测了t RF靶基因,发现其大多靶向转座因子。研究结果对揭示t RF产生机制以及水稻雄配子体发育研究有一定的参考价值。

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