收藏本站
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

实时荧光定量PCR分析中毛果杨内参基因的筛选和验证

苏晓娟  樊保国  袁丽钗  崔秀娜  卢善发  
【摘要】:实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术具有高灵敏性、高保真性和高特异性,被广泛应用于基因表达的分析。在数据处理过程中,选用稳定表达的基因作为内参基因对准确分析实验结果非常关键。以毛果杨(Populus trichocarpa)的不同组织以及锌胁迫下的组培苗为材料,使用荧光定量PCR方法分析了TUA8、TUB6、ubiquitin、GAPDH、actin、18S rRNA和EF1α7个看家基因的表达情况。通过geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个程序的综合分析,发现actin、ubiquitin、EF1α和18S rRNA的稳定性较好,可用作毛果杨基因表达研究的内参基因;而TUB6在不同组织中稳定性最差;GAPDH在锌胁迫下的组织中稳定性最差,因此不适宜作为内参基因。毛果杨NAC基因的表达分析,进一步验证了上述结果。该研究对采用qRT-PCR方法分析毛果杨基因表达过程中内参基因的选择具有指导作用,同时对揭示NAC基因的功能也有一定的意义。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 李磊;罗杰;李红;罗志斌;;毛果杨全基因组铵转运蛋白家族成员及其序列分析[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);2011年02期
2 王策;秦静静;甘红豪;李红;罗志斌;;毛果杨全基因组磷酸根转运蛋白家族成员序列分析[J];浙江农林大学学报;2012年04期
3 吴大强;蔡诚;魏国;项艳;;毛果杨全基因组NBS类型抗病基因分析[J];林业科学;2009年02期
4 刘立辉;李成浩;杨静莉;夏德安;;毛果杨1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸合酶(HDS)基因的生物信息学分析[J];安徽农业科学;2012年03期
5 刘立辉;李成浩;杨静莉;夏德安;;毛果杨1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸合酶(HDS)基因的生物信息学分析(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2012年01期
6 崔秀娜;袁丽钗;苏晓娟;吴祥云;王海英;卢善发;;miR1444a参与毛果杨对锌胁迫的响应[J];中国科学:生命科学;2012年10期
7 袁丁;李红;郝文芳;罗志斌;;毛果杨全基因组硝酸根转运蛋白家族(NRT2s)序列分析[J];西北林学院学报;2012年05期
8 李春艳;李成浩;;毛果杨(Populus trichocarpa)中ZINC-INDUCED FACILITATOR1(ZIF1)同源基因的生物信息学分析[J];安徽农业大学学报;2013年03期
9 邵龙婷;郑唐春;臧丽娜;李爽;曲冠证;;毛果杨Eukaryotic translation initiation factor 5A(eIF5A)同源基因的生物信息学分析[J];安徽农业大学学报;2014年01期
10 车小红;李岩;赵德刚;;遗传转化KN1基因促进毛果杨外植体再生[J];基因组学与应用生物学;2010年04期
11 黄婷;徐刚标;;毛果杨WND1B基因启动子的克隆与缺失初步分析[J];中南林业科技大学学报;2012年04期
12 龙甜甜;张红梅;王婕;项艳;;毛果杨全基因组ANK基因的鉴定及表达分析[J];安徽农业大学学报;2013年02期
13 陈仲;王佳;安新民;;毛果杨PtrAP1-2基因启动子的克隆及其瞬时表达分析[J];植物生理学报;2013年06期
14 李岩;赵德刚;王新俊;车小红;;转KN1毛果杨细胞分裂素、赤霉素含量及其相关形态结构[J];基因组学与应用生物学;2010年06期
15 吴翔宇;许志茹;曲春浦;李蔚;孙琦;刘关君;;毛果杨NLP基因家族生物信息学分析与鉴定[J];植物研究;2014年01期
16 程玉祥;杨茹;;毛果杨NADP-苹果酸酶基因家族分析[J];植物生理学报;2011年03期
17 王昱堃;魏弘宜;陆海;;毛果杨腺苷酸合成酶基因ACS-1的克隆和酶学分析[J];西北林学院学报;2014年05期
18 王晓桐;李昊阳;徐吉臣;;毛果杨HMA基因家族的生物信息学分析[J];植物生理学报;2014年07期
19 苏万凯;管李萍;李印军;陆海;;毛白杨抗坏血酸过氧化物酶启动子克隆与分析[J];南方农业学报;2012年06期
20 朱煜;谭梦月;邹爱兰;张文举;戚金亮;杨永华;;拟南芥、水稻和毛果杨中CesA基因的进化和表达分析[J];南京林业大学学报(自然科学版);2013年03期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 吴大强;项艳;;毛果杨全基因组NBS类型抗病基因分析[A];第六届全国林木遗传育种大会论文集[C];2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 崔秀娜;毛果杨微小RNA 1444a的克隆、胁迫表达分析及遗传转化研究[D];辽宁工程技术大学;2013年
2 管李萍;四个毛白杨APX基因及启动子克隆与催化特性分析[D];北京林业大学;2010年
3 苏晓娟;毛果杨内参基因的筛选和验证及其miR164e的克隆、表达和转化[D];山西师范大学;2013年
4 温素芳;毛果杨MYB-like1转录因子调控花青素合成代谢的研究[D];东北林业大学;2012年
5 董亚茹;毛果杨HDAC基因家族与低温胁迫反应关系的初步研究[D];东北林业大学;2013年
6 黄婷;毛果杨WND1B基因启动子克隆与缺失分析[D];中南林业科技大学;2012年
7 姜晓玲;溃疡病菌侵染过程中毛果杨类甜蛋白基因的时空表达分析[D];河北农业大学;2012年
8 杨茹;毛果杨NADP-ME基因家族鉴定及其特性的研究[D];东北林业大学;2011年
9 李娜;741毛白杨APX基因的克隆及表达分析[D];北京林业大学;2011年
10 王昱堃;毛果杨半胱氨酸蛋白酶基因PtCP1的克隆及酶学研究[D];北京林业大学;2014年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978