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番茄FAR1/FHY3转录因子家族的全基因组鉴定及表达分析

陈渝  邓洁  陈君愉  曾亭  余婷婷  黄千华  陈培超  刘庆  简伟  杨星勇  
【摘要】:FAR1/FHY3是由转座酶衍生的一类转录因子家族,它通过调控下游基因表达,进而在植物光响应、生长发育及逆境胁迫应答过程发挥重要作用,但当前有关FAR1/FHY3家族的研究主要集中在模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中。为了探究番茄(Lycopersicon esculentum) FAR1/FHY3基因家族的进化和功能,该研究通过全基因组分析鉴定到27个FAR1/FHY3基因,并利用生物信息学手段和荧光定量PCR技术(qRTPCR)对其展开分析。结果表明,该基因家族可分为7个亚家族,与拟南芥和玉米(Zea mays)具有相似分类,不同亚族之间基因结构存在显著差异;该家族成员在4、5和12号以外的所有染色体上均呈现不均衡分布,并且存在4个串联重复的基因簇;组织表达分析表明,个别亚族之间存在组织表达相似性,多数组织中均存在相对高表达基因,特别是第I亚族基因在果实发育及成熟过程特异高表达; qRT-PCR结果表明大多数成员能被NaCl、PEG6000胁迫诱导表达,而被ABA处理所抑制,特别是SlFAR1-22、SlFAR1-23和SlFAR1-25基因能够分别被PEG6000胁迫诱导上调表达28.06、14.25和9.09倍,暗示FAR1/FHY3家族在胁迫应答过程具有重要作用。该研究结果可为进一步解析该家族成员在番茄生长发育及胁迫应答过程中的功能机制奠定基础。

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