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玉米BSKs基因家族生物信息学分析

胡雪微  杨克军  李佐同  张海燕  刘鑫  赵莹  聂江山  韩雨  赵长江  
【摘要】:油菜素内酯信号激酶(BSKs)是一类参与油菜素内酯(BR)信号转导的植物特异受体类胞质激酶。本研究采用生物信息学的方法在玉米基因组水平鉴定玉米BSKs基因家族,对基因结构、启动子元件、蛋白质结构和性质、基因表达模式及候选互作蛋白等进行分析。鉴定的14个玉米BSKs基因分别定位在玉米的1、2、4、5和9号染色体上,1号染色体上多达6个;编码蛋白包含典型的PKc和TPR结构域,N端由延长链和螺旋结构组成,定位于叶绿体,多为亲水性、酸性蛋白,可能与热激蛋白、含CS结构域蛋白及受体BRI1互作。玉米BSKs基因在从种子萌发到成熟的整个生长发育期,以及不同组织和器官呈现不同的表达模式;基因启动子上含有大量激素和非生物逆境诱导的顺式作用元件,其中激素SA及Na Cl诱导相关元件数量最多,表明玉米BSKs基因可能在不同生育期受多种激素调控,并参与玉米对多种逆境的应答调控。该研究有助于解析单子叶C4作物玉米BSKs基因在生长发育及逆境胁迫响应中的功能。

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