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水稻组蛋白脱乙酰化酶HD2 HDACs蛋白质的生物信息学分析

符稳群  林莹  黄惠玲  张云珊  池华  杨晓琦  张敏敏  张振华  
【摘要】:HD2 HDACs家族成员是植物特异性的组蛋白脱乙酰化酶并参与基因的转录调控.本研究利用生物信息学方法对水稻组蛋白脱乙酰化酶HD2 HDACs家族成员(HDT701、HDT702、HDT2201和HDT2202)的生物学功能进行研究.结果表明,HD2 HDACs家族成员位于不同的染色体上,分布于细胞的不同部位;它们编码的蛋白均含有依赖于cAMP-和cGMP的蛋白激酶、蛋白激酶C、酪蛋白激酶II与酰胺化4个相同的位点;它们均无跨膜区,都为不稳定的亲水性蛋白质,都无信号肽.多序列比对发现粳稻与籼稻HD2 HDACs的同源性非常高;水稻HD2 HDACs蛋白质的结构域比较特殊;这些蛋白可能参与植物的基因复制、信号传导、转录过程和免疫应答等过程.

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1 符稳群;吴克强;张美;段俊;;水稻组蛋白脱乙酰化酶SIR2的功能注释分析[J];安徽农业大学学报;2008年01期
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