抗菌肽Arg-Ser-Ser与POPG膜相互作用的动力学模拟分析

【摘要】：目的进一步验证RSS的抗菌机理。方法本文通过分子动力学模拟系统探讨了肽膜质心距离、肽膜间的最小距离、肽膜之间形成的氢键数量以及脂膜的均方根偏差和脂膜有序参数这几个物理量的变化情况来反映RSS对细菌细胞膜的作用机理。结果抗菌肽最先与脂膜接触,由于静电作用力,带正电荷的N末端残基与带负电的脂膜相结合,最终RSS呈现倾斜的状态。随着RSS浓度的增加,增加了RSS与脂膜之间的相互作用,使得氢键数目增加,导致了脂膜的不均匀性,增强了脂膜磷脂分子的无序波动,这可能会使得细菌内组分泄露,直至死亡。结论 RSS可以通过作用于细胞膜,从而有效抑制铜绿假单胞菌的生长。该研究利用分子动力学模拟为RSS的抗菌机理提供一定的基础数据和理论支持。