收藏本站
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

早期和晚期肺腺癌的差异基因和信号通路富集分析

王桂平  韦敏  廖洪映  周琼  王妍  林竹贞  张彦焘  
【摘要】:[目的]分析早期和晚期肺腺癌的差异基因和信号通路。[方法]从美国国立生物信息中心(NCBI)的GEO数据库下载GSE10072数据集,去除临床指标缺失的样本,按照TNM分期将肺腺癌样本分为早期(Ⅰ期,共16例)和晚期(Ⅲ~Ⅳ期,共15例)两组。原始数据经dChip进行质量检验、标准化,然后进行差异基因分析。从MsigDB数据库获得344个生物信号基因集,通过GSEA进行信号通路富集分析。[结果]获得SEMA3、PLAU、CDKN2A等14个明显差异基因,获取的差异基因主要与细胞凋亡、细胞黏附等过程密切相关。选取MsigDB中来源于Bicarta、KEGG、GenMAPP三大数据库的344个基因集进行富集分析,结果发现Death pathway、Leukocyte transendothelial migration和Focaladhesion等22条信号通路在晚期肺腺癌中明显富集,富集通路主要涉及细胞凋亡、细胞黏附和迁移等过程。[结论]早期与晚期肺癌中存在一些明显的差异表达基因,有部分信号通路在晚期肺腺癌中明显富集。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 叶云;王桂平;杨晓勤;尹曦;梁爽;郑文岭;马文丽;;不同分化程度卵巢癌细胞中胚胎干细胞相关通路的基因集富集分析[J];中国组织工程研究与临床康复;2010年27期
2 王桂平;叶云;杨晓勤;陈新美;梁爽;郑文岭;马文丽;;基于基因表达谱的途径筛选肺腺癌治疗药物[J];中国临床药理学与治疗学;2010年03期
3 杨梅怀;刘延序;张岩峰;;肺腺癌癌胚抗原计量学的研究[J];中国肿瘤临床;1993年02期
4 鲁继斌,李亚明,王明武,张旭东,尹兴家,石文君,谷文生;~(99m)Tc标记单克隆抗体对荷肺腺癌裸鼠的放射免疫显像研究[J];中国肿瘤临床;1995年02期
5 王鹏,甘恒芳,李澄,石得仁;红皮病伴发肺腺癌一例[J];中华皮肤科杂志;1995年02期
6 于世辉,邢小平,徐世东,徐明旭,刘定干,张贵寅,李载平,李璞;肺腺癌肿瘤抑制基因p53突变位点的研究[J];中华医学遗传学杂志;1995年02期
7 刘景坤;王曼;张哲;;肺腺癌凝集素受体定位观察及意义[J];沈阳部队医药;1996年06期
8 陈家林,张燕萍;不同分子量细胞角蛋白联合检测在肺腺癌及鳞癌鉴别诊断的应用[J];中国肿瘤临床;2001年04期
9 梁静英;异环磷酰胺、阿霉素和顺铂联合方案治疗肺腺癌的临床观察[J];广西中医学院学报;2001年03期
10 何胜利,董竞成,王中吉,陶莉;促血管生成素1、2及Tie-2受体mRNA在肺腺癌中的表达[J];中华结核和呼吸杂志;2003年05期
11 金焰,阎承慧,吴焱,刘艳,张贵寅,李璞,傅松滨;外源性野生型p53基因在两个肺腺癌细胞系中表达及对p16和p21基因的调控[J];中华医学遗传学杂志;2003年05期
12 王征,归嘉伟,郭志强;脾平滑肌肉瘤肺转移并肺腺癌1例[J];中华胸心血管外科杂志;2004年01期
13 王欢;杨柏林;彭军;;肺腺癌脑膜转移1例[J];江西医药;2005年S1期
14 王志举;樊红琨;李敏;闫明;乔鹏;赵国强;董子明;;海嘧啶对肺腺癌多药耐药细胞A549/T及其亲代细胞的作用观察和机制的初步研究[J];河南医学研究;2006年01期
15 蒋磊;陈福康;吴建彬;黄吟华;潘祖军;黄海峡;吴科峰;;健康体检发现肺腺癌31例X线分析[J];实用放射学杂志;2006年01期
16 谭敏华;雷伟华;;肺高分化胎儿型腺癌1例[J];诊断病理学杂志;2006年03期
17 郭燕;王俊;章必成;陈正堂;;蒿甲醚对人肺腺癌A549细胞体外生长的影响[J];医学研究生学报;2007年03期
18 张文峰;喻磊;李玉;张林;陈东义;;肺腺癌肺及纵隔淋巴结转移规律与淋巴结广泛廓清术的临床意义[J];中国医科大学学报;2007年04期
19 段林灿;李高峰;黄云超;金重国;;血清SYK水平和肺腺癌淋巴结受累的关系[J];现代肿瘤医学;2009年08期
20 刘丹;刘伦旭;袁泉;李晓亮;黄娜;杨小东;;运用激光解析电离飞行时间质谱技术检测肺腺癌的血清蛋白表达[J];四川大学学报(医学版);2010年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 林明群;张宗粱;;巨噬细胞免疫调变信号-PKA与PKC对MAPK信号通路的调节研究[A];中国细胞生物学学会第七次会议论文摘要汇编[C];1999年
2 高方;张琪;郑敏化;韩骅;;Notch信号通路对神经干细胞增殖分化的调控作用[A];中国遗传学会“发育、遗传和疾病”研讨会论文汇编集[C];2007年
3 韩家淮;;p38信号通路与炎症反应[A];第六届全国免疫学学术大会论文集[C];2008年
4 杨丽霞;郭瑞威;齐峰;苗贵华;王先梅;石燕昆;李明秋;;MIF/AP-1/MMP-9信号通路血浆表达水平与冠状动脉病变程度的相关性研究[A];中华医学会心血管病学分会第十次全国心血管病学术会议汇编[C];2008年
5 胡勇;郭庆;曾凡钦;唐增奇;林燕辉;汤红峰;;TGF-B信号通路关键因子LTBP-1和TGF-βRⅡ与尖锐湿疣发病的相关性研究[A];中华医学会第14次全国皮肤性病学术年会论文汇编[C];2008年
6 李菊香;丁浩;洪葵;万磊;苏海;吴延庆;吴清华;程晓曙;;ERK1/2信号通路介导心肌营养素-1对心肌细胞缺氧复氧损伤的保护作用[A];中华医学会第11次心血管病学术会议论文摘要集[C];2009年
7 张维溪;李昌崇;贺孝良;戴欢;方丽;赵瑞雪;;TGF-β 1/Smad信号通路在哮喘气道重塑中的作用[A];第六届江浙沪儿科学术会议暨儿科学基础与临床研究进展学术班论文汇编[C];2009年
8 李卓娅;;细胞骨架系统与细胞信号通路-Actin参与跨膜型TNF激活TNFR2凋亡信号通路[A];中国病理生理学会受体、肿瘤和免疫专业委员会联合学术会议论文汇编[C];2010年
9 杨艺敏;张颖;冯加纯;;Notch信号通路对大鼠脑缺血后神经再生调控作用的实验研究[A];中华医学会第十三次全国神经病学学术会议论文汇编[C];2010年
10 倪鑫;唐晓露;侯月;;PKC信号通路通过cAMP反应元件促进胎盘CRH基因转录[A];中国生理学会第五届全国心血管、呼吸和肾脏生理学学术会议论文摘要汇编[C];2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郑华;筛选肺腺癌相关血清自身抗体标志物[D];北京市结核病胸部肿瘤研究所;2010年
2 李峰生;辐射对肺腺癌细胞侵袭能力的影响及其分子机制研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2011年
3 冯林;1.从人胚胎肺发育研究人原发性肺腺癌预后相关基因表达谱 2.深测序和基因芯片技术用于mRNA表达谱检测的比较研究[D];中国协和医科大学;2010年
4 孙志华;双靶点抑制剂BEZ235克服Gefitinib耐药的肺腺癌H1975细胞的作用及其机制研究[D];华中科技大学;2012年
5 孙强;四环素调控SV40Tag转基因小鼠成神经管细胞瘤模型构建和表达谱分析[D];上海医药工业研究院;2005年
6 代金明;小鼠骨髓辐射后基因表达差异分析及SIRT1功能研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2006年
7 刘海荣;ER、PR、C-erB-2与肺腺癌的相关性研究[D];山东大学;2012年
8 刘求真;鼻咽癌干细胞的初步研究[D];第一军医大学;2006年
9 黎联;基质金属蛋白酶-26在非小细胞肺癌中的表达、临床意义及调控机制[D];重庆医科大学;2009年
10 彭丽华;腹泻型肠易激综合征及溃疡性结肠炎大肠黏膜全基因组及MicroRNA表达谱研究[D];中国人民解放军军医进修学院;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 周坚;益肺汤联合吉非替尼治疗气阴两虚痰瘀毒结型晚期非小细胞肺腺癌的临床研究[D];湖南中医药大学;2011年
2 李晓燕;支气管上皮细胞基因组DNA拷贝数异常对周围型不吸烟肺腺癌患者鉴别诊断价值的初步探讨[D];中国协和医科大学;2010年
3 吴维栋;eIF4E及PTEN在肺腺癌组织中的表达及相关性研究[D];福建医科大学;2010年
4 宫琳琳;候选抑癌基因Fez1在肺癌中的表达[D];大连医科大学;2004年
5 张志学;肺腺癌中血管内皮生长因子及其受体的表达与血管生成及预后的关系[D];青岛大学;2001年
6 陈董明;细胞周期调控因子CyclinD1、CDK4在肺腺癌、鳞癌中的表达及其临床意义[D];中国医科大学;2003年
7 刘志艳;反义表皮生长因子受体对人肺癌细胞系放射敏感性影响的实验研究[D];天津医科大学;2006年
8 何伟伟;SELDI筛选的肺腺癌血清标志蛋白和传统肿瘤标志物的比较研究[D];上海交通大学;2007年
9 陈园园;肺腺癌多层螺旋CT表现及其病理基础与胸内增大淋巴结关系探讨[D];广州中医药大学;2009年
10 姜振宇;后程加速超分割放疗联合紫杉醇化疗治疗肺腺癌研究[D];山东大学;2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 高原;或与MiR-21分子有关[N];广东科技报;2009年
2 ;我发现细胞内信号通路“对话”机制[N];上海科技报;2004年
3 刘海英;美发现两种细胞信号通路互动机制[N];科技日报;2009年
4 海飞鱼;探索肺癌突变基因[N];医药经济报;2008年
5 ;三氧化二砷对肺腺癌化学治疗敏感性的影响及其机制[N];中国医药报;2003年
6 ;《细胞》发表裴钢院士最新研究成果[N];上海科技报;2009年
7 ;“细胞信号传递”新发现[N];上海科技报;2007年
8 ;电针能激活老年痴呆大鼠海马蛋白激酶信号通路[N];中国中医药报;2005年
9 健康时报记者 王志胜;一样的肿瘤,不一样治法[N];健康时报;2009年
10 记者 许琦敏;减肥信号受控于脑中“通讯员”[N];文汇报;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978