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应用于多个沉香属物种鉴定的DNA条形码序列筛选

康勇  刘杨  杨云  冯剑  郑希龙  魏建和  
【摘要】:目的本实验旨在从常用DNA条形码序列中筛选出有效的序列,从而实现沉香属内常见物种的快速鉴别。方法本实验以8个不同国家5种常见的沉香属物种为材料,对其核基因ITS2,叶绿体基因matK、rbcL和trnH-psbA的序列特征进行评估,并通过构建系统进化树分析不同序列及组合对沉香属物种的鉴别效率。结果 4种序列均具有较优的PCR扩增成功率及测序成功率,其中matK序列变异位点和SNPs最多,trnH-psbA最少,Barcoding gap检验结果表明,鉴定效果最优序列依次是matK ITS2 rbcL trnH-psbA,matK片段具有明显的遗传变异间隔区域;通过计算平均节点支持率及同质性检验,matK+ITS2+rbc L组合构建进化树可将多个沉香属物种分别聚为一支,且具有最高的节点支持率;基于Taxon DNA的BBA方法验证,matK序列与其他序列组合的鉴定效果最好。结论使用DNA条形码技术鉴定沉香属物种,单一片段中鉴别成功率最高的为matK序列,应用matK+ITS2+rbc L的序列组合可以实现沉香属不同物种的准确鉴别。

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