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植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000中分泌蛋白信号肽分析

黄俊丽  吴金钟  肖崇刚  李常军  王贵学  
【摘要】:利用SignalP3.0、TMHMM2.0、TargetP1.01、LipoP1.0和PSORTb蛋白分析软件并结合L值计算,对植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000菌株基因组中的全部3440个ORFs进行了分析预测,确定其中186个ORFs所编码蛋白质的N-端有信号肽序列,且它们的氨基酸残基相对保守。其中134条具有分泌型信号肽,22条具有RR-motif型信号肽,30条具有信号肽酶Ⅱ型信号肽。对各类信号肽及其结构域的长度作了系统的分析。未发现Prepilin-like信号肽和细菌素和信息素信号肽。

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