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基于miRNA表达谱解析细粒棘球蚴病患者体内Th17/Treg失衡机制

鲁迪  宋佳卉  马子建  张鹏越  许磊  韦川  陈颖  周莎  朱继峰  李娅琳  赵嘉庆  朱明星  赵瑞  王海  陈晓军  赵巍  苏川  
【摘要】:目的 观察细粒棘球蚴病患者血清微小RNA(mi RNA)表达水平、探讨mi RNA对辅助性T细胞17(Th17)/调节性T细胞(Treg)失衡的影响,以阐明细粒棘球蚴慢性感染并长期致病的机制。方法 提取细粒棘球蚴病患者与健康对照者血清总RNA,采用Illumina测序平台进行高通量测序。分别采用mi RBase数据库和mi RDeep2工具进行已知mi RNA注释和新mi RNA预测,并进行差异分析。采用mi Randa软件和Target Scan软件分别预测差异表达mi RNA靶基因后取交集,进行基因本体(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。在差异表达变化倍数居前20位的mi RNA中,匹配可靶向决定Th17细胞和Treg细胞生成的关键转录因子(RORC和FOXP3)或重要调控通路(PI3K-Akt和m TOR通路)相关基因的miRNA。结果 细粒棘球蚴病患者与健康对照血清中共有53个差异表达mi RNA,其中47个上调表达mi RNA、6个下调表达mi RNA。GO富集分析显示,差异表达miRNA功能涉及DNA转录翻译、细胞成分、细胞形态、神经发育及代谢分解等过程。KEGG富集分析显示,这些差异表达mi RNA靶基因涉及的主要信号通路包括MAPK、PI3K-Akt、mTOR等信号通路。在差异表达变化倍数居前20位的mi RNA中,有3个潜在靶向调控RORC的mi RNA、15个潜在靶向PI3K-Akt、mTOR信号通路的miRNA。结论 细粒棘球蚴感染后可使患者血清mi RNA表达谱出现明显改变,差异表达mi RNA可能通过靶向Th17/Treg关键转录因子或PI3K-Akt、mTOR通路而导致Th17/Treg免疫失衡,进而利于细粒棘球蚴在宿主体内长期寄生并慢性致病。

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