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用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位

李江英  白雪娟  梁艳  张俊仙  阳幼荣  赵卫国  吴雪琼  
【摘要】:目的预测Rv1410c结核分枝杆菌(MTB)的抗原表位。方法利用DNAStar软件包中Editseq软件将Rv1410c MTB氨基酸序列进行编辑保存,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,预测Rv1410c MTB的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位,然后再用BLAST分析其与人类抗原表位的同源性。结果 Rv1410c具有丰富的二级结构,含有较多潜在的B细胞抗原肽表位,主要位于1~10、67~77、129~137、189~205、222~235、253~267、296~306、330~338、359~367、462~467、494~517氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高;也含有较多潜在的T细胞表位,主要位于16~37、84~102、108~115、137~160、202~207、219~222、245~263、321~325、355~362、387~391、417~445、486~494氨基酸残基或其附近。结论 Rv1410c MTB既含有较多潜在的B细胞抗原表位,也含有较多潜在的T细胞抗原表位。

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