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慢性肾脏病5期患者血管通路的蛋白质组学分析

梁钧泽  张静  孙月  黄上嘉  黄思博  高桂彬  梁晓玲  黄盛玲  
【摘要】:目的运用蛋白质组学的方法分析伴与不伴有糖尿病的慢性肾脏病5期(chronic kidney disease 5, CKD5)患者动静脉内瘘吻合口处静脉血管的蛋白表达及信号网路的差异,探究糖尿病患者血管狭窄率高的致病机制。方法从Proteomexchange数据库中选出伴有与不伴有糖尿病的慢性肾脏病5期患者血管通路的蛋白质谱原始(RAW)文件。采用Proteome Discoverer对RAW文件重新搜库。通过生物信息学分析其差异表达蛋白。结果通过文献检索及数据质量评估,对iTRAQ定量比较伴与不伴有糖尿病的CKD5患者蛋白质谱数据(PXD010883)进行重新挖掘研究。经重新搜库与差异表达蛋白分析,共筛选出120个差异蛋白,其中89个上调,31个下调。通过对差异蛋白进行GO富集分析、IPA分析及KEGG通路富集分析,发现伴糖尿病CKD5组患者的ATP/AMP明显降低,具体表现为氧化呼吸链活动减弱以及腺嘌呤核糖核苷酸合成增强;另外伴糖尿病CKD5组患者的肌肉系统进程明显降低,这影响着血管平滑肌的正常功能。进一步分析发现,ATP/AMP与肌肉系统进程呈负相关。结论通过定量蛋白质组分析发现,伴糖尿病CKD5患者的ATP合成代谢减弱,AMP合成代谢增强,血管平滑肌的肌肉系统进程减弱,导致血管平滑肌功能失调。这可能是伴糖尿病CKD5患者内瘘失功的机制之一。

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