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Val22对恶臭假单胞菌扁桃酸消旋酶催化活性的影响

梅卓航  刘击  于洪巍  
【摘要】:恶臭假单胞菌扁桃酸消旋酶的Val22位于20s环状结构上,是与底物结合相关的氨基酸之一。其中Val被替换为Arg后酶活性下降了75.9%。除了酶与底物疏水作用减弱以外,静电排斥作用增强也可能引起活性的下降。利用分子动力学模拟对酶与底物的米氏复合物进行分析,结果表明:突变后第22位氨基酸侧链与底物的静电势从0.036 kJ/mol升高至0.124 kJ/mol。这说明氨基酸侧链极性的改变增加了侧链与底物分子之间的静电排斥作用,因而静电排斥作用也是导致突变体活性下降的原因之一。同时,突变后系统势能增加了283 kJ/mol,进一步证实了第22位氨基酸侧链极性和带电性质的改变导致酶与底物结合状态的势能增大,从而引起活性大幅下降。因此,将来对酶的结合口袋区域进行理性设计时,除了考虑空间位阻效应外,还需考虑疏水作用和静电作用。

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