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肝癌免疫细胞浸润模式及与预后的相关性分析

程熠  吴莹莹  刘东伯  郭秋云  
【摘要】:目的研究肝癌免疫细胞的浸润模式,探索免疫细胞浸润与预后的关系。方法从TCGA数据库下载肝细胞癌转录本数据及相关临床数据,通过Cibersort软件的反卷积法计算22种免疫细胞的占比。采用K-M生存分析Log-Rank法计算每种免疫细胞与生存的相关性。结果从TCGA数据库中得到基因转录本数据共424例,包含肝癌组织374例、正常肝组织50例。每个样本检测基因位点60483个,包含mRNA 19658个。数据校正后使用Cibersort软件"反卷积法"得到22种免疫细胞的占比数据,采用P0.05筛选样本,得到肝细胞癌组织40例、正常肝组织2例。K-M生存分析显示活化的肥大细胞、未活化的自然杀伤细胞、嗜酸性粒细胞组成比例高者预后差,活化的自然杀伤细胞比例高者预后更好。结论肝癌中存在各类免疫细胞不同程度的浸润,浸润性免疫细胞可以作为影响肝癌患者预后的因素。

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