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用SRAP标记研究根际土壤微生物的遗传多样性

李春楠  崔海瑞  王伟博  
【摘要】:将近年来新建立的分子标记技术——相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)应用于土壤微生物遗传多样性研究。采用22对引物组合对20种植物根际土壤微生物进行了分析,共获得237个扩增位点,其中多态性位点221个,占93.2%。平均每对引物组合的多态位点比例(PPL)、多态信息含量(PIC)、等位基因单体型(Ah)和遗传杂合度(He)分别为93.78%、0.94、18.05和0.92,说明SRAP对根际土壤微生物具有较强的鉴别能力,也反映了本研究中20种不同植物的根际土壤微生物具有丰富的遗传多样性。水稻的2个不同种植地和4个不同发育时期间的根际土壤微生物遗传距离差异极显著,但2个不同水稻品种间的差异不显著。Shannon多样性指数揭示,水稻根际土壤微生物的遗传多样性最低,莴苣的最高。按照非加权类平均法(UPGMA)聚类,在遗传距离0.454的水平上,可将20种植物根际土壤微生物分为三类:第一类是水稻根际土壤微生物,第二类是种植于大棚温室的芹菜根际土壤微生物,第三类为其余18种旱作植物根际土壤微生物。本研究结果证明SRAP是分析土壤微生物遗传多样性的有效手段。

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