收藏本站
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于单分子实时测序技术的3个当阳广椒样品细菌多样性研究

王玉荣  孙永坤  代凯文  孙京新  沈馨  郭壮  
【摘要】:本文采集了3个鲊广椒样品,使用单分子实时测序技术对其细菌微生物多样性进行了评价。在属水平上,乳酸杆菌属(Lactobacillus)的相对含量为94.25%;在种水平上,相对含量大于1.0%的种分别为隶属于乳酸杆菌属(Lactobacillus)的破布子乳杆菌(L.pobuzihii)、食品乳杆菌(L.alimentarius)、费斯莫尔德乳杆菌(L.versmoldensis)、类短乳杆菌(L.parabrevis)、短乳杆菌(L.brevis)、朝鲜乳杆菌(L.koreensis)和类食品乳杆菌(L.paralimentarius),其平均相对含量分别为32.31%、23.17%、22.01%、8.90%、3.31%、1.63%和1.05%,隶属于魏斯氏菌属(Weissella)的类肠膜魏斯氏菌(W.paramesenteroides)的平均相对含量为1.05%。在分类操作单元(Operational taxonomic units,OTU)水平上,发现6个核心OTU,包含的序列数占所有质控后合格序列数的29.58%。由此可见,当阳地区鲊广椒中的细菌微生物主要隶属于乳酸杆菌属(Lactobacillus),且样品间共有大量的核心菌群。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 刘小凤;罗勇;傅俊英;;DNA测序技术的专利计量研究[J];现代生物医学进展;2010年06期
2 于聘飞;王英;葛芹玉;;高通量DNA测序技术及其应用进展[J];南京晓庄学院学报;2010年03期
3 解增言;林俊华;谭军;舒坤贤;;DNA测序技术的发展历史与最新进展[J];生物技术通报;2010年08期
4 傅俊英;赵蕴华;;DNA测序技术领域的相关政府投入分析[J];现代生物医学进展;2012年05期
5 刘振波;;DNA测序技术比较[J];生物学通报;2012年07期
6 刘朋虎;林冬梅;林占熺;李晶;;DNA测序技术及其应用研究进展[J];福建农业学报;2012年10期
7 任鲁风;于军;;解读生命密码的基本手段——DNA测序技术的前世今生[J];生命科学;2012年12期
8 曹婷;张立岭;侯冠彧;周汉林;施力光;荀文娟;;高通量测序技术的发展及其在畜禽上的应用[J];家畜生态学报;2013年01期
9 孟广震;;DNA测序技术又一个新突破[J];生物工程学报;1987年01期
10 张晓丹;武海萍;周国华;;焦测序技术及其在遗传分析中的应用[J];分析化学;2006年04期
11 ;第三代测序技术简介[J];生物医学工程与临床;2011年02期
12 占爱瑶;罗培高;;DNA测序技术概述[J];生物技术通讯;2011年04期
13 Kevin Davies;李升伟;;半导体芯片测序技术:下一代测序技术的研发进程[J];生物技术世界;2011年06期
14 李亦学;李轩;;新一代测序技术的发展和应用[J];中国科技投资;2012年07期
15 周怀军;;新一代测序技术的发展与挑战[J];中国家禽;2012年23期
16 张春兰;;高通量测序技术在分子生物学中的应用[J];潍坊学院学报;2012年06期
17 张得芳;马秋月;尹佟明;夏涛;;第三代测序技术及其应用[J];中国生物工程杂志;2013年05期
18 曹盈;;高通量测序技术在植物转录组研究中的应用[J];北京农业;2013年06期
19 蔡晓静;朱煌;孔繁琪;冯婕妤;赵立全;牛宗镇;;DNA测序技术的进展和挑战[J];现代生物医学进展;2013年20期
20 刘佶;刘贺;;DNA测序技术进展及其应用[J];科技风;2013年16期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 何彪;涂长春;;下一代测序技术的应用及展望[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第八届全国会员代表大会暨第十五次学术研讨会论文集[C];2013年
中国博士学位论文全文数据库 前4条
1 张钊;植物miRNA及其靶标发掘相关的生物信息学工具开发[D];浙江大学;2014年
2 浦丹;两核苷酸实时合成测序技术及其应用研究[D];东南大学;2015年
3 李定辰;基于高通量测序平台的未知病原微生物检测系统[D];中国人民解放军军事医学科学院;2016年
4 邱源;两种RNA测序文库制备方法的构建及其应用[D];甘肃农业大学;2017年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 宾浪漫;转录组测序深度对表达基因检测影响的初步研究[D];湘潭大学;2015年
2 林晶晶;基于Hadoop的人类全基因组重测序数据处理技术的研究及实现[D];东北石油大学;2015年
3 林楚瑜;实用的细菌基因组组装策略:混合组装[D];华南理工大学;2015年
4 毛成光;两核苷酸实时合成测序信息分析[D];东南大学;2015年
5 张翠媛;高通量测序技术应用于野生动物粪便中病毒的发现与分析[D];湖南师范大学;2016年
6 李海涛;基于二代测序数据的癌症驱动通路识别方法[D];曲阜师范大学;2016年
7 杨秀峰;基于高通量测序的狼和家犬血液转录组研究[D];曲阜师范大学;2016年
8 刘松梅;重复序列的特征对测序结果的影响分析[D];大连理工大学;2015年
9 胡世贤;基于二代测序的多重竞争性PCR方案的建立及应用[D];东华大学;2017年
10 马晓玲;采用高通量测序技术发现和鉴定抗卵泡刺激素受体骆驼纳米抗体[D];新疆大学;2016年
中国重要报纸全文数据库 前2条
1 本报记者 许琦敏;个性化医疗离我们有多远[N];文汇报;2009年
2 记者 刘传书;华大科技推出微量转录组测序技术服务[N];科技日报;2012年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978