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SD大鼠肠道菌群多样性对金黄色葡萄球菌检出率影响的探析

刘丽达  刘丽  黄伟峰  豆捷雄  蒋勇  陈兵  
【摘要】:目的 探讨SD大鼠肠道菌群多样性对金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)检出率的影响。方法 无特定病原体(SPF级)初断乳SD大鼠和成年SD大鼠各30只,采集其回盲部肠道内容物,进行SA分离鉴定和肠道菌群16 s区域扩增子测序,使用Qiime和R软件进行多样性及丰度分析,找出组间差异,分析肠道菌群多样性对SA检出率的影响,以P0.05为差异有统计学意义。结果 SA检出率初断乳SD大鼠为16.7%,成年SD大鼠为3.3%;肠道菌群中最大丰度物种一致,但初断乳SD大鼠肠道菌群可操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs)有1 231个,成年SD大鼠1 415个;初断乳SD大鼠的肠道菌落组成结构差异比成年SD大鼠更大,物种多样性指数小于成年SD大鼠,差异有统计学意义(P0.05),在门水平疣微菌门、脱铁杆菌门、生氧光细菌初断乳SD大鼠丰度大于成年SD大鼠(q均小于0.05),软壁菌门初断乳SD大鼠丰度低于成年SD大鼠(q0.05)。初断乳SD大鼠中检出SA大鼠分出697个OTUs,未检出SA大鼠分出934个OTUs;检出SA大鼠肠道菌群物种多样性指数小于未检出SA大鼠,有统计学意义(P0.05),厚壁菌门丰度大于未检出大鼠,变形菌门丰度低于未检出大鼠(q0.05)。结论 大鼠肠道菌群多样性与SA检出率有一定联系,肠道菌群越丰富,菌群结构越稳定SA检出率越低。

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