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甘蓝型油菜FAF基因家族鉴定并挖掘分枝形成相关成员

蒋先润  罗桂林  梁峰豪  黄莎  肖华贵  张超  代文东  
【摘要】:FAF基因家族是植物界特有的转录因子之一,具有调节分生组织大小的作用。为研究甘蓝型油菜(Brassica napus)中FAF基因对分枝形成的影响,本研究对甘蓝型油菜FAF家族成员进行了全基因组鉴定和生物信息学分析;以3个多分枝材料和3个少分枝材料为研究对象,提取不同生育期组织部位的总RNA,利用qPCR对BnFAF基因进行了表达模式分析。结果显示,甘蓝型油菜中共有17个BnFAF基因,分布在13条染色体上;基于氨基酸序列的相似度,参考拟南芥(Arabidopsis) FAF基因将BnFAF基因分为Ⅰ~Ⅳ共4个亚家族;基因结构、蛋白结构鉴定表明Ⅳ家族成员的分化较大,而其余亚家族内成员相对保守。qPCR分析发现,BnFAF4-4和BnFAF4-7的表达模式一致,且在多分枝材料薹期茎、上部腋芽和中部腋芽中的相对表达量显著高于少分枝材料,推测这些基因可能影响分枝的形成。本研究为进一步利用FAF基因改良甘蓝型油菜分枝性状提供了理论指导。

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