从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记

【摘要】：通过对5800条大豆疫霉菌EST进行电子查询, 在369条EST中发现415个SSR. 在筛选的EST序列中SSR平均密度为每 8.9 kb含有1个SSR. 在鉴定的SSR中, 三核苷酸重复基元的SSR类型最多, 占鉴定总数的50.1%, 四核苷酸重复基元的SSR类型最少, 为8.2%. 设计40个SSR引物对对5个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR扩增, 有33个引物对扩增出SSR特征条带, 其中有28个引物对扩增出在预期片段大小范围之内的条带. 在33个功能性引物对中, 有15个引物对在5个大豆疫霉菌菌株间扩增出多态性, 多态性引物对占45.5%. 基于SSR标记进行聚类分析, 可将5个检测大豆疫霉菌菌株划分为不同的3个组. 本研究建立了大豆疫霉菌的SSR标记, 为大豆疫霉菌及相关属种的鉴定、遗传变异、分子作图等研究提供了一种更加有效的分子标记系统.

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前20条

1	徐静静;蔺宇;董立明;王晓鸣;武小菲;朱振东;;用SSR标记和巢式PCR快速检测大豆疫霉菌[J];中国农业科学;2009年05期
2	徐静静;王晓鸣;段灿星;武小菲;朱振东;;大豆疫霉基因组SSR标记开发[J];中国农业科学;2009年09期
3	徐静静;董立明;王晓鸣;武小菲;朱振东;;新疆大豆疫霉的来源分析[J];新疆农业大学学报;2009年02期
4	朱振东,霍云龙,王晓鸣,黄俊斌,武小菲;从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记[J];科学通报;2004年17期
5	韩丽娟,刘文洪;大豆疫霉病及其遗传多样性的研究方法[J];分子植物育种;2004年06期
6	王良华;丁国云;王源超;郑小波;;大豆疫霉菌检测技术研究进展[J];植物检疫;2006年06期
7	朱振东,王化波,王晓鸣,武小菲;黑龙江省主要栽培大豆品种(系)对大豆疫霉根腐病的多抗性评价[J];植物遗传资源学报;2004年01期
8	郭玉莲,张荣芳,郑铁军,李宝英,翟喜海,潘亚清;杀菌剂及其复配对大豆根腐病菌的室内毒力测定[J];黑龙江农业科学;2004年06期
9	朱振东,王晓鸣,田玉兰,武小菲;防治大豆疫霉根腐病的药剂筛选[J];农药学学报;1999年03期
10	朱振东,王化波,王晓鸣,常汝镇,武小菲;中国大豆疫霉菌分布及毒力多样性研究[J];中国农业科学;2003年07期
11	臧忠婧,左豫虎,刘惕若,于培芝;大豆疫霉菌的分离、鉴定及菌株致病力的测定[J];黑龙江八一农垦大学学报;2000年01期
12	李宝笃,彭友付,沈崇尧;大豆疫霉菌对甲霜灵(Metalaxyl)的敏感性及变异性[J];植物病理学报;1995年01期
13	陈长卿;左豫虎;康振生;;大豆疫霉菌单游动孢子囊的分离方法[J];植物保护;2006年04期
14	兰成忠;陈庆河;赵健;邱荣洲;李本金;吕新;翁启勇;;诱导大豆疫霉菌大量产生游动孢子囊的最佳方法研究[J];江西农业大学学报;2007年04期
15	王良华;丁国云;吴翠萍;王源超;郑小波;;大豆疫霉卵孢子致死温度的测定[J];植物检疫;2008年06期
16	左豫虎,薛春生,刘惕若;杀菌剂对大豆疫霉菌生长的抑制作用[J];黑龙江大学自然科学学报;2002年01期
17	;科技博览[J];农药市场信息;2002年24期
18	刘春来;李新民;杨明秀;;大豆疫霉菌检测鉴定方法[J];大豆科学;2008年03期
19	董立明;王晓鸣;郭庆元;战勇;朱振东;;新疆大豆疫霉菌毒力及大豆品种抗病性[J];新疆农业大学学报;2008年04期
20	何龙;王伯初;吴红;雷开荣;;玉米粗缩病抗性基因SSR标记初步研究[J];广东农业科学;2008年08期

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前10条

1	崔友林;王晓鸣;朱振东;彭德良;;大豆疫霉菌在我国的适生性风险分析[A];生物入侵与生态安全——“第一届全国生物入侵学术研讨会”论文摘要集[C];2007年
2	张立付;高智谋;潘月敏;代玉立;叶晨晨;曹舜;;安徽省大豆疫霉菌的分离、鉴定及其致病型分布研究[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
3	王蕾;王秦虎;单卫星;;大豆疫霉菌小RNA通路核心组件的识别分析及突变体筛选[A];2010年中国菌物学会学术年会论文摘要集[C];2010年
4	范勇;陈庆河;赵健;兰成忠;李本金;翁启勇;;SSR和SRAP标记揭示大豆疫霉菌遗传多样性的差异分析[A];第二届全国生物入侵学术研讨会论文摘要集[C];2008年
5	徐静静;王晓鸣;武小菲;朱振东;;基于半巢式PCR扩增的大豆疫霉菌分子检测方法[A];植物保护与现代农业——中国植物保护学会2007年学术年会论文集[C];2007年
6	哈霞;胡中慧;王蕾;权军利;单卫星;;大豆疫霉菌的EMS化学诱变[A];中国植物病理学会2009年学术年会论文集[C];2009年
7	王宝华;郑玉珠;鲁国东;王宗华;;利用SSR标记定位稻瘟病菌无毒基因簇的初探[A];中国植物病理学会2004年学术年会论文集[C];2004年
8	郑义;马鸿翔;陆维忠;陈建民;洪义欢;;大麦赤霉病新抗源鄂啤1号抗性QTL的SSR标记分析[A];江苏省遗传学会第七届二次代表大会暨学术研讨会论文摘要汇编[C];2008年
9	李岩;李永刚;杨明秀;叶楠;文景芝;;大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)孢子囊形成过程的基因差异表达研究[A];中国菌物学会2009学术年会论文摘要集[C];2009年
10	朱振东;王晓鸣;;大豆疫霉根腐病菌研究进展[A];“植物保护21世纪展望”——植物保护21世纪展望暨第三届全国青年植物保护科技工作者学术研讨会文集[C];1998年

中国博士学位论文全文数据库

前9条

1	孙果忠;非寄主对大豆疫霉菌抗性的分子机理[D];中国农业科学院;2007年
2	王振华;玉米抗矮花叶病遗传分析及数量性状基因定位[D];东北农业大学;2002年
3	张帆;玉米穗粒腐病遗传效应分析及抗性QTL定位[D];四川农业大学;2006年
4	于佰双;黑龙江省主要大豆抗源对胞囊线虫的抗病特性及线虫防治体系研究[D];沈阳农业大学;2009年
5	顾彪;植物病原卵菌和真菌效应蛋白转运机制研究[D];西北农林科技大学;2012年
6	武晓玲;大豆疫霉根腐病抗性评价、基因定位及抗性相关基因的筛选[D];南京农业大学;2009年
7	李爱宁;大豆疫霉促有丝分裂原蛋白激酶PsSAK1和PsMPK1的功能分析[D];南京农业大学;2009年
8	李爱丽;小麦抗白粉病基因同源序列的分离鉴定及分子标记的研究[D];河北农业大学;2002年
9	任翔;水稻抗褐飞虱基因遗传分析与分子功能图谱构建[D];武汉大学;2003年

中国硕士学位论文全文数据库

前10条

1	蔺宇;大豆疫霉病EST-SSR标记的开发和利用[D];吉林大学;2006年
2	李勇;小麦EST-SSR标记作图及抗白粉病基因Pm2和Pm21的SSR标记研究[D];河北农业大学;2003年
3	徐静静;大豆疫霉分子检测及SSR标记的开发[D];中国农业科学院;2008年
4	严引娣;三个中国小麦条锈菌鉴别寄主的抗条锈性遗传研究[D];西北农林科技大学;2008年
5	张英春;小冰麦33抗叶锈性鉴定及SSR和TRAP分析[D];河北农业大学;2008年
6	林静;大豆疫霉菌群体遗传结构的时空动态研究[D];福建师范大学;2012年
7	张伟;大豆疫霉菌和寄生疫霉菌中小RNA的初步鉴定和分析[D];西北农林科技大学;2011年
8	王化波;中国大豆疫霉菌遗传多样性和大豆种质抗病性研究[D];中国农业科学院;2001年
9	胡中慧;大豆疫霉菌EMS突变体库的构建及microRNA生物合成相关基因DCL的识别[D];西北农林科技大学;2010年
10	曹华;感大豆疫霉菌拟南芥突变体的遗传分析[D];西北农林科技大学;2011年

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