收藏本站
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用

成斌  许伟  胡从从  贺学礼  赵丽莉  
【摘要】:采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性。结果表明,应用NGS共鉴定AM真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定2纲2目2科5属,形态学鉴定1纲2目2科3属。AM真菌分类等级越低,NGS、DGGE和形态学鉴定结果差异越大,尤其在属水平上差异显著。与NGS技术相比,形态学和DGGE方法所反映AM真菌种类主要为优势菌种,显著低估了AM真菌物种组成并高估其丰度,分子测序是对形态学分类的补充和完善。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 成斌;许伟;胡从从;贺学礼;赵丽莉;;比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用[J];菌物学报;2018年09期
2 ;谢晓亮院士研发出单细胞测序新技术[J];化学分析计量;2013年01期
3 ;测序方法影响小RNA测序结果[J];农业生物技术学报;2012年04期
4 周华;张新;刘腾云;余发新;;高通量转录组测序的数据分析与基因发掘[J];江西科学;2012年05期
5 孙海冰;蔡柏岩;;AM真菌对植物防御性蛋白的影响:研究进展[J];中国农学通报;2018年11期
6 李爱花;唐小利;;美、英及我国政府对单细胞测序研究及应用领域的基金资助[J];中华医学图书情报杂志;2017年09期
7 徐鹏昊;;高通量测序中拼接问题的研究现状[J];山东农业工程学院学报;2016年01期
8 阿娜;张文广;;基因组重测序深度的计算[J];内蒙古农业大学学报(自然科学版);2014年03期
9 谢俊;胡智强;;探索部分测序的基因组对元基因组分类的影响[J];基因组学与应用生物学;2015年07期
10 王云生;聂飞;林顺权;;果树高通量测序的最新研究进展[J];基因组学与应用生物学;2015年09期
11 陈冠舟;张白鹭;纪梦梦;吴晓刚;周君仪;陈家楠;王芸;田浩;张晓君;;高通量测序探究啮食聚苯乙烯泡沫塑料黄粉虫的肠道菌群结构[J];微生物学通报;2017年09期
12 秦巧平;张岚岚;李南羿;崔永一;徐凯;;下一代测序cDNA样品制备及优化技术探讨[J];遗传;2010年09期
13 郑珂晖;温永仙;;生物二代测序数据的压缩算法研究进展[J];福建电脑;2015年03期
14 崔东亚;杨美玲;;降解组测序与剪切位点分析研究进展[J];江苏农业科学;2014年07期
15 宋琳琳;顾朝辉;韦朝春;陈赛娟;;Illumina-Solexa测序数据质量评估系统的构建[J];现代生物医学进展;2009年15期
16 ;美国科学家发明DNA快捷廉价测序机器[J];生物学教学;2012年06期
17 陈大洋;甄贺富;刘萍;邱咏;谢林;刘弘泰;陈芳;;低深度测序在检测单细胞染色体微小变异中的应用探索[J];生物技术通报;2016年12期
18 杨婧;黄原;;线粒体基因组的高通量测序策略[J];生命科学;2016年01期
19 窦锦壮;赵熙强;付晓腾;焦文倩;王南南;张玲玲;胡晓丽;王师;包振民;;测序错误和重复序列对无参照基因组单核苷酸多态性分型的影响[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2013年05期
20 温龙平,陈亚兵,俞春东,蔡毓,曾桂生,曾定;Bak基因的克隆、测序及表达[J];高技术通讯;1995年11期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 于军;王绪敏;武会娟;任鲁风;李宝明;李越;章张;钱嘉林;吴双秀;安云鹤;;基于新一代测序分析技术的基因组学方法研究及应用[A];中国分析测试协会科学技术奖发展回顾[C];2015年
2 王小薇;;QIAGEN创新二代测序解决方案——助推病原体快速检测[A];新发传染病研究热点研讨会论文集[C];2013年
3 沈玉梅;龚兵;邵志峰;江敏;汤道年;赵小东;李小卫;黎庆;伍新燕;;酸敏感连接单元在DNA测序中的应用[A];第八届全国化学生物学学术会议论文摘要集[C];2013年
4 陆祖宏;吕华;肖鹏峰;白云飞;葛芹月;周东蕊;;基于生物芯片的高通量低成本DNA快速测序及其在系统生物学研究中的应用[A];2007年全国生化与生物技术药物学术年会论文集[C];2007年
5 薛伟艳;李菊荣;孙啸;;用于再测序的基因组序列重建策略[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
6 张宁;田苗苗;杨丽;;基于光漂白进样-毛细管电泳技术的多肽羧基端的在线自动测序[A];中国化学会第十一届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会(色谱基础研究分会)论文摘要集[C];2016年
7 陈平;李选文;曹锐;孙亚兰;谢锦云;梁宋平;;磺基异硫氰酸苯酯化学辅助MALDI-TOF-PSD de novo测序方法对SDS-PAGE分离的蛋白质进行鉴定[A];中国蛋白质组学第二届学术大会论文摘要论文集[C];2004年
8 沈玉梅;汤道年;江敏;李小卫;伍新燕;龚兵;赵小东;邵志峰;;四色荧光标记二硫键可逆终端在DNA测序中的应用[A];中国化学会第29届学术年会摘要集——第22分会:化学生物学[C];2014年
9 王猛;王璐;;FTA卡DNA样品在高通量测序中的应用[A];遗传多样性:前沿与挑战——中国的遗传学研究(2013-2015)——2015中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2015年
10 李丽潇;黄涛宏;端裕树;;一种基于微流控芯片电泳的高效、快速的对下一代测序基因文库质控的方法[A];第二十届全国色谱学术报告会及仪器展览会论文集(第三分册)[C];2015年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 蒋胜竞;几种环境因子对高寒草甸AM真菌群落结构与功能的影响研究[D];兰州大学;2018年
2 曹唱唱;混合测序实验设计及数据分析[D];东南大学;2017年
3 安小平;利用高通量测序筛查未知病毒的相关技术研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2014年
4 刘程智;耐辐射奇球菌转录组测序数据发掘及抗性相关基因功能研究[D];浙江大学;2014年
5 卢戌;基于第二代测序的转录组组装软件比较研究[D];兰州大学;2013年
6 吕鸣;人类基因组复杂序列区域的扩增与测序策略研究[D];上海交通大学;2009年
7 李宗玮;基于高通量测序的微生物辨识、进化与耐药性生物信息学分析[D];中国人民解放军军事医学科学院;2016年
8 邱源;两种RNA测序文库制备方法的构建及其应用[D];甘肃农业大学;2017年
9 李粤;microRNA深度测序数据分析的生物信息学算法及应用[D];苏州大学;2012年
10 洪胜君;基于转录组测序数据的基因共表达网络研究[D];复旦大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 成斌;塞北荒漠羊柴AM真菌群落结构和物种多样性研究[D];河北大学;2017年
2 夏超;高通量测序误差模型分析及解码方案设计[D];东南大学;2015年
3 宾浪漫;转录组测序深度对表达基因检测影响的初步研究[D];湘潭大学;2015年
4 刘松梅;重复序列的特征对测序结果的影响分析[D];大连理工大学;2015年
5 张睿雄;两核苷酸实时合成测序的数据处理及解码算法[D];东南大学;2016年
6 甘秋云;利用深度测序定位拟南芥突变基因[D];福建农林大学;2011年
7 黄勇;基于高通量测序的微生物基因组学研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2013年
8 陈溪;两种不同测序方法对胡萝卜软腐果胶杆菌全基因组测序结果的初步比较[D];南京农业大学;2015年
9 孙业鹏;盐碱胁迫下羊草转录组测序及分析[D];吉林农业大学;2012年
10 张琳;拟南芥种子发育过程转录组深度测序数据的分析[D];福建农林大学;2011年
中国重要报纸全文数据库 前6条
1 记者 聂翠蓉;首次太空DNA测序与地球上的结果“完美匹配”[N];科技日报;2016年
2 记者 张梦然;科学家进行大规模古代DNA测序分析[N];科技日报;2015年
3 记者 陈云芬;植物DNA短序列测序新技术问世[N];云南日报;2010年
4 李贽;中国加入国际测序俱乐部背后[N];大众科技报;2000年
5 记者 张梦然;“抗病基因”可延长树木寿命[N];科技日报;2018年
6 记者 张梦然;环境DNA测序能收集种群遗传信息[N];科技日报;2016年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978