胃癌及其癌前病变相关新基因GP1的生物信息学分析

【摘要】：目的利用生物信息学方法对新克隆的GP1基因和蛋白序列进行分析,推测其在胃癌发生、发展过程中的作用。方法以人类基因组数据库为基础,利用Megablast工具和SAGE数据库对GP1进行染色体定位和组织表达分布分析;应用BLAST进行GP1的基因结构分析和相似序列搜索;应用ORF finder对GP1编码的蛋白进行序列预测;应用ProParam、TMPRED等软件分析GP1编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位及结构域等信息。结果 GP1基因全长1 362 bp,其最长开放读码框为801 bp,编码267个氨基酸,相似性搜索发现GP1基因片段与人AF083246基因片段具有很高的相似性(100%)。在GP1蛋白上有一个与真核起始因子5C(eIF5C)具有低度同源性的结构域。SAGE结果显示GP1在多种组织中都有表达。RT-PCR验证了基因的组织表达谱。结论生物信息学的分析表明GP1是一个胃癌相关基因,可能在胃癌的发生发展过程中起一定的作用。

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前20条

1	邹叶青;张善忠;刘川;王梦龙;;胃癌及癌前病变组织中hMLH1基因启动子甲基化与MSI的关系[J];江西医学院学报;2008年03期
2	李梅;姚乐;惠起源;;Survivin在人胃癌及癌前病变中表达的研究[J];现代肿瘤医学;2009年03期
3	杨朝阳;汤桂芹;;胃癌及癌前病变组织中Hp感染与C-myc基因蛋白表达及相关性研究[J];安徽预防医学杂志;2006年02期
4	肖冰;高枫;符兆英;;环氧合酶-2在胃癌与癌前病变和其他胃黏膜组织中表达的研究[J];现代肿瘤医学;2009年04期
5	郑洁;周风华;付新华;郭文君;;胃癌及其癌前病变相关基因差异表达的研究[J];潍坊医学院学报;2006年05期
6	肖玉平;吴东瑛;杨君;武洋;张肖肖;辛彦;;Survivin蛋白表达与胃癌发生发展的关系及意义——组织芯片技术研究[J];解剖科学进展;2006年01期
7	詹建生;谭永港;赵素芳;刘新民;;胃癌及其癌前病变胃黏膜蛋白质组双向电泳图谱的差异分析[J];深圳中西医结合杂志;2010年02期
8	耿明;曹永成;邰艳红;付质杰;朱明华;;端粒酶基因在胃癌、胃黏膜异型增生和肠上皮化生组织中的表达及意义[J];中国肿瘤生物治疗杂志;2007年01期
9	杨立;朱晓玲;景士兵;刘瑞雪;任秋华;;胃癌组织、癌前病变及正常胃黏膜组织中EphB2的表达及病理学意义[J];中国肿瘤临床与康复;2008年04期
10	钱安平;赵晶;肖玉平;辛彦;;胃癌组织中RUNX3与mP53表达的关系及意义[J];解剖科学进展;2009年04期
11	付刚;;MK因子在不同病理类型胃癌组织的表达及临床意义[J];中国医疗前沿;2010年03期
12	苗新普;韦红;;鸟氨酸脱羧酶对早期胃癌的诊断意义[J];实用预防医学;2010年04期
13	蓝菁;幽门螺杆菌致胃癌的作用机制研究[J];肿瘤学杂志;2001年06期
14	梁启廉;陈小东;李建文;郑朝晖;黄冰;张英;张远起;;胃癌及癌前病变组织中Endoglin标记的微血管密度表达意义[J];肿瘤研究与临床;2006年02期
15	徐兴兴;常文军;翟羽佳;林丽萍;刘小康;马立业;张宏伟;曹广文;;PPP4R1基因与肿瘤相关性的生物信息学预测及在胃癌组织中的初步验证[J];第二军医大学学报;2009年03期
16	叶新青;陈发龙;林思彤;韦常宏;;Survivin和VEGF在胃癌和癌前病变中的表达及临床意义[J];华夏医学;2010年02期
17	梁晓萍;张丽秀;张多强;张建芳;张娟;罗晓慧;罗荣;陈根;韩俭;;河西走廊中段地区上消化道疾病患者幽门螺杆菌感染状况[J];中国病原生物学杂志;2011年04期
18	董洁;尹晓燕;崔铮;刘希双;刘华;毛涛;鞠辉;;组蛋白去乙酰化酶1对人胃癌发生发展的影响[J];中国医药指南;2011年17期
19	孙迪文;陈启;;Survivin在早期胃癌及癌前病变组织中的表达及其与PTEN表达的关系[J];实用癌症杂志;2008年01期
20	周英发;胡君平;沈琼;;胃粘膜不同类型肠化及胃癌组织中DBA受体的表达[J];河南医学研究;1997年03期

中国重要会议论文全文数据库

前10条

1	杨立;朱晓玲;李胜昔;;胃癌组织、癌前病变及正常胃黏膜组织中EphB2的表达及病理学意义[A];中华医学会第七次全国消化病学术会议论文汇编（下册）[C];2007年
2	黄智铭;沈萍萍;林若阳;王良兴;郑建建;;胃癌及癌前病变粘膜组织中SLPI的表达及其临床意义[A];第二届浙江省消化病学术大会论文汇编[C];2009年
3	廖谦和;;胃癌及癌旁黏膜组织中CK7、CK20和Ki67表达的临床意义[A];2009年浙江省病理学学术年会论文汇编[C];2009年
4	朱人敏;张晓华;许小兵;吴晓尉;孙泉;李敏利;郭美霞;季洪赞;;GABA_B受体在人胃癌组织中的免疫组织化学研究[A];第二十一届全国中西医结合消化系统疾病学术会议暨国家级中西医结合消化系统疾病新进展学习班论文汇编[C];2009年
5	季峰;胡裕耀;焦春花;徐勤伟;王子微;陈岳亮;;胃癌组织FAT10与突变型p53表达及其相互关系的研究[A];第二届浙江省消化病学术大会论文汇编[C];2009年
6	姚宏;;胃癌组织Twist和E-钙粘蛋白的表达及临床病理意义[A];中华医学会病理学分会2010年学术年会日程及论文汇编[C];2010年
7	孙元水;叶再元;施敦;;胃癌组织乙酰肝素酶蛋白表达及其临床意义[A];2004年浙江省外科学学术年会论文汇编[C];2004年
8	李霞;李瑜元;胡建国;聂玉强;杜艳蕾;周永健;;抗凋亡基因GW112在胃癌组织中的表达及其临床意义[A];中华医学会第七次全国消化病学术会议论文汇编（下册）[C];2007年
9	侯智勇;张研;房学东;;胃癌组织中MVD计数及CD44v6,VEGF表达的意义[A];中华医学会急诊医学分会第十三次全国急诊医学学术年会大会论文集[C];2010年
10	阮洪军;陶厚权;赵仲生;;胃癌组织中微血管密度的测定及其临床意义[A];首届浙江省消化病学术大会论文汇编[C];2008年

中国博士学位论文全文数据库

前10条

1	王宁;ABCG2基因在胃癌中的表达和胃癌侧群细胞的初步研究[D];中国人民解放军军医进修学院;2008年
2	蒋敬庭;协同刺激分子B7-H4在胃癌组织中的表达及其临床意义[D];苏州大学;2011年
3	韩竞春;胃癌相关基因表达与Wnt，NF-κB和Stat3信号途径活化的相关性[D];大连医科大学;2007年
4	陆以霞;APC、bcl-2和c-met基因在胃癌及癌前病变中表达和APC基因在胃癌组织中突变的研究[D];吉林大学;2007年
5	罗清;人核诱导凋亡因子1（NAIF1）基因在胃癌及乳腺癌中的差异表达及功能研究[D];北京协和医学院;2011年
6	刘骥;胃癌S100基因表达的生物信息学分析及S100A3与胃癌相关性研究[D];第四军医大学;2009年
7	黄罡;趋化因子MDC/CCL22-CCR4轴在胃癌腹膜乳斑转移中的作用[D];大连医科大学;2010年
8	陈鑫;Cdx2在胃黏膜肠上皮化生中作用机制的研究[D];天津医科大学;2009年
9	孙抒;利用基因芯片和组织芯片研究办癌发生的分子机制及与细胞调亡的关系[D];延边大学;2005年
10	赵晔;S-腺苷蛋氨酸对胃癌增殖和c-myc、uPA基因甲基化的影响[D];郑州大学;2010年

中国硕士学位论文全文数据库

前10条

1	潘存伟;胃癌、癌前病变组织中Survivin和BAG-1的表达及临床意义[D];广西医科大学;2007年
2	徐晋珩;胃癌形成过程中hTERT启动子甲基化状态变化分析研究[D];天津医科大学;2009年
3	贡明才;胃癌组织端粒酶逆转录酶（hTERT）、Rb基因表达及其临床意义[D];苏州大学;2002年
4	王文军;胃癌前病变和胃癌组织局部T淋巴细胞亚群及IFN-γ mRNA、IL-10mRNA表达的研究[D];大连医科大学;2005年
5	李霞;胃癌组织自噬基因Beclin 1和survivin的表达及意义[D];广西医科大学;2010年
6	王珣;胃癌DNA甲基化差异片段的筛选及生物信息学分析[D];南华大学;2006年
7	潘光松;实时荧光定量RT-PCR对胃癌组织中hMLH1及hPMS2 mRNA的检测及临床意义[D];青岛大学;2010年
8	柳亚娟;胃癌组织中Ghrelin和Obestatin表达相关性及临床意义[D];青海大学;2011年
9	毕小刚;DcR3在胃癌中的表达及临床意义[D];山西医科大学;2005年
10	朱晓峰;Skp2与p27在胃癌中的表达与意义[D];南华大学;2005年

中国重要报纸全文数据库

前10条

1	衣晓峰通讯员李晓莲;中药抑制萎缩性胃炎癌前病变[N];健康报;2007年
2	李霞;中药可防治肝癌癌前病变[N];中国中医药报;2006年
3	陈媛媛;女性朋友需要注意的三种癌前病变[N];家庭医生报;2008年
4	;胃部“癌前病变”调理四要领[N];医药导报;2007年
5	健康时报记者李梅浠;三大癌症会传染[N];健康时报;2010年
6	记者傅冬红;癌前病变加重胃癌发生增加[N];健康报;2001年
7	张中桥;别拿“不死的癌症”吓唬人[N];中国中医药报;2006年
8	;盲目“排毒”小心癌前病变[N];医药导报;2007年
9	张禹;胃癌癌前病变的病理特点[N];家庭医生报;2008年
10	余宏迢;肠息肉重要的癌前病变[N];健康报;2003年

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