收藏本站
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

猪let-7a靶基因预测及生物信息学分析

张家庆  王献伟  李文嘉  何俊丹  白红杰  陈俊峰  任巧玲  魏成斌  邢宝松  
【摘要】:旨在通过对ssc-let-7a进行靶基因预测及生物信息学分析,探究其调控猪卵泡发育和闭锁的作用机制。利用荧光定量PCR技术对猪卵泡期不同状态的3种中等(3~5 mm)卵泡(健康卵泡(H)、早期闭锁卵泡(EA)和晚期闭锁卵泡(PA))的颗粒细胞中ssc-let-7a表达变化进行比较研究,利用过表达let-7a检测其对H_2O_2诱导颗粒细胞氧化损伤的保护作用;应用JASPAR、PROMO、Cytoscape等生物信息学软件和miRBase、Ensembl、NCBI等数据库对ssc-let-7a进行转录因子结合位点预测、保守性分析、靶基因预测、GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。结果表明:随着卵泡闭锁程度的加深,ssc-let-7a在颗粒细胞中的表达水平发生显著下调;过表达ssc-let-7a对H_2O_2诱导猪颗粒细胞氧化损伤具有保护作用;ssc-let-7a在各物种间非常保守,其启动子区域有FoxO1/3等多个转录因子结合位点,278个靶基因主要参与细胞增殖、凋亡和分化生物学过程,其主要参与MAPK、TP53和TGF-β等信号通路。由此推测,ssc-let-7a受到FoxO等多个转录因子调控,它可能通过参与MAPK、TGF-β和TP53等通路的调节从而影响颗粒细胞的增殖或凋亡,进而影响猪卵泡发育。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前17条
1 张金璧;林飞;潘增祥;马雪山;李齐发;刘红林;;猪不同程度闭锁卵泡判定方法的比较研究[J];南京农业大学学报;2013年01期
2 曹贵方,张涌;动物细胞凋亡与卵泡闭锁[J];动物医学进展;1997年04期
3 张海峰;汪琳仙;;鸡促性腺激素释放激素对鸡卵泡颗粒细胞孕酮分泌的影响[J];北京农业大学学报;1994年02期
4 王虹;陈晓云;宁静;刘欣;田春莲;刘明春;;黄酮类化合物对免疫相关信号通路的调控作用研究进展[J];动物医学进展;2019年12期
5 史琳琳;赵锋;高学军;李庆章;;乳蛋白合成信号通路的研究进展[J];中国畜牧兽医;2013年01期
6 王玉恒;索朗斯珠;强巴央宗;徐业芬;牛家强;姚一龙;王英杰;;西藏林芝地区牦牛卵泡颗粒细胞体外分离培养和形态观察[J];畜牧与兽医;2018年05期
7 宫碧霜;任曼;靳二辉;胡倩倩;周金星;李升和;;硼对猪卵泡颗粒细胞形态、增殖和凋亡的影响[J];卫生研究;2017年06期
8 高庆华,周虚,王春清,韩春梅;牛卵泡颗粒细胞无血清培养的形态学观察[J];中国兽医学报;2005年06期
9 吴素芳;马涛;李健宇;李建平;张巧灵;;调控毛囊发育的Wnt信号通路研究进展[J];动物医学进展;2019年04期
10 汪琳仙,李莹辉,王海滨;GnRH促鸡卵泡颗粒细胞孕酮合成功能作用机制的研究[J];畜牧兽医学报;1999年03期
11 尚月丽;崔月明;韦英益;胡庭俊;;应激与糖皮质激素受体信号通路[J];畜牧与兽医;2014年01期
12 汪琳仙,刘金中,张才乔;同源GnRH对无血清培养鸡卵泡颗粒细胞孕酮分泌的作用[J];畜牧兽医学报;1996年04期
13 高庆华,蒋超祥,韩春梅;牛卵泡颗粒细胞无血清培养的形态学观察[J];中国草食动物;2004年03期
14 吴赛辉;;牛的卵泡颗粒细胞采集与培养[J];黑龙江农业科学;2006年01期
15 杜静;运用免疫受体基因进行RNA干扰对猪颗粒细胞发展的意义[J];国外医学(计划生育分册);2005年05期
16 周东蕊,杨利国,姜勋平,张书霞,杨灿锋;外源bcl-2基因和脂质体对鸡卵泡颗粒细胞体外分裂和凋亡的影响[J];南京农业大学学报;2001年02期
17 马丽珠;郑宇新;王立强;江中良;;牛卵泡颗粒细胞中生长相关基因的表达研究[J];家畜生态学报;2019年09期
中国重要会议论文全文数据库 前6条
1 张瑞乾;张国梁;刘雪莲;沈伟;李兰;;基于转录组水平探究玉米赤霉烯酮对小鼠颗粒细胞表达模式的影响[A];中国生理学会生殖科学专业委员会—中国动物学会生殖生物学分会第二次联合学术年会暨“生殖科学专业委员会第二次学术交流会”和“生殖生物学分会第十六次学术年会”论文集[C];2017年
2 宫碧霜;任曼;靳二辉;周金星;金光明;李升和;;硼对猪卵泡颗粒细胞形态、增殖和凋亡的影响[A];中国畜牧兽医学会动物解剖及组织胚胎学分会第十九次学术研讨会论文集[C];2016年
3 孙宏亮;许美花;王瑶;鲁文赓;;Wnt信号通路在牛胎盘发育过程中的功能[A];中国畜牧兽医学会兽医产科学分会第十三次学术研讨会论文集[C];2016年
4 林金杏;贾玉东;曾卫东;张才乔;;碱性成纤维细胞生长因子对鸡等级前卵泡颗粒细胞发育的影响[A];全国动物生理生化第十一次学术交流会论文摘要汇编[C];2010年
5 李婷;马爱团;张英杰;刘月琴;段春辉;;RNA干扰INHα基因对绵羊颗粒细胞周期及凋亡相关基因表达的影响[A];2017年全国养羊生产与学术研讨会暨养羊学分会第七次全国会员代表大会论文集[C];2017年
6 庞训胜;王子玉;应诗家;张艳丽;严益波;王锋;;高繁殖力黄淮山羊大卵泡颗粒细胞上调表达基因的研究[A];中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会第十五届学术研讨会论文集(上册)[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 林欣;蛋鸡退化卵泡衰退的机制及其功能的研究[D];浙江大学;2018年
2 赵璠;Luman在小鼠颗粒细胞和子宫内膜基质细胞功能调节中的作用研究[D];西北农林科技大学;2018年
3 陈洋;牛卵泡发育相关基因筛选及SIRT1、INHBA基因功能研究[D];吉林农业大学;2018年
4 陈树雄;脑源性神经营养因子对牛卵泡颗粒细胞增殖和类固醇激素分泌的影响[D];吉林大学;2018年
5 孟凯;WT1基因调控牛卵泡颗粒细胞和膜细胞类固醇激素生成的研究[D];西北农林科技大学;2019年
6 刘卓;全反式视黄酸对小鼠卵泡颗粒细胞KK-1孕酮合成和分泌的影响[D];吉林大学;2019年
7 杨盟;白介素-6对奶牛卵巢颗粒细胞排卵相关基因表达的调节机制[D];中国农业科学院;2017年
8 马莉;Shh信号通路在梅花鹿鹿茸软骨细胞分化过程中的作用及调控机理[D];吉林大学;2019年
9 白龙;BMP2调控卵泡排卵相关基因表达及其机理的研究[D];西北农林科技大学;2017年
10 王静;FOXL2对鸡卵泡颗粒细胞分化的作用及机制研究[D];华中农业大学;2017年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 杜长琬;猪早期闭锁卵泡基因表达芯片分析[D];南京农业大学;2012年
2 梁丹阳;SIRT1调节线粒体自噬对猪肠上皮细胞氧化损伤的影响[D];华中农业大学;2018年
3 杨佳;镉诱导猪肾PK-15细胞氧化损伤及N-乙酰基半胱氨酸的保护作用研究[D];山西大学;2018年
4 张深;miR-458b-5p调控基因CTNNB1对鸡卵泡颗粒细胞增殖的影响[D];山东农业大学;2019年
5 文冬梅;E_2与FSH对水牛卵泡颗粒细胞/内膜细胞增殖和凋亡的影响[D];广西大学;2019年
6 庞惠文;鸡FOXL2对卵泡颗粒细胞维持的作用及其异位表达对睾丸支持细胞的影响[D];华中农业大学;2019年
7 乔同;INH和AMH对小鼠卵泡发育的协同调控作用及机制研究[D];华中农业大学;2019年
8 骆薇;敲低鸡FOXL2对颗粒细胞基因表达的影响[D];华中农业大学;2019年
9 李牧宇;促性腺激素对鸡卵泡颗粒细胞中4种miRNA表达的影响[D];四川农业大学;2018年
10 黄思嘉;AMHR2对鸡卵泡选择过程中颗粒细胞孕酮合成的影响[D];西北农林科技大学;2019年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978