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中国狂犬病病毒的分群和进化特征

陶晓燕  李浩  焦文涛  唐青  梁国栋  
【摘要】:目的为全面掌握我国狂犬病病毒的遗传进化特征和分群特点。方法对GenBank上具有明确时间、地域及宿主信息的中国街毒株G基因全序进行汇总,并结合本实验室获得的中国流行株G序列,利用BEAST软件,进行系统的时间进化分析。结果中国狂犬病流行株G基因的时间进化分析显示,我国流行株明显分为6群:ChinaⅠ群是我国的绝对优势群,数量占总数的80%以上,分布于19个省(自治区、直辖市);ChinaⅡ群,包括来自7个省(自治区、直辖市)的49个流行株;ChinaⅢ、Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ群数量较少,分布地域也较为局限。中国流行株的最近共同祖先(TMRCA)可追溯至392年前。结论 ChinaⅠ群是我国目前优势毒株群,同时应注意防范ChinaⅡ群和ChinaⅣ群野生动物来源的狂犬病流行。

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