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拟南芥冷害胁迫下基因表达谱的统合分析

徐兆华  吴为人  
【摘要】:对4套不同来源的拟南芥冷胁迫芯片试验数据进行了统合分析,并与各试验单独分析的结果进行了比较.结果表明,那些在2个或2个以上试验中被同时检测到的"较可靠的"差异表达基因(Differentially expressed gene,DEG)大多数都能被统合分析检测出来,而那些只在1个试验中被检测到的"较不可靠的"DEG则大约只有1/4被统合分析检测到,说明统合分析适合于检测"较可靠的"DEG.在统合分析检测到的DEG中,约有9%是未被单独分析检测到的,其中包含6个与冷害胁迫直接相关的基因,说明统合分析还可以检测到被单独分析忽略的DEG.基因本体和启动子基序分析显示,统合分析检测到的DEG确实与冷胁迫有着密切的关系.

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