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生物被膜态和游离态临床耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌转录组的差异分析??

刘巍巍  国果  吴兆颖  毛成菊  李忠旬  贾利娜  尚小丽  彭建  ??  吴建伟  ??  
【摘要】:目的 了解临床分离的耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌(CRAB)生物被膜态和游离态的转录组差异,探究生物被膜形成的机制。方法 从住院病人痰液或血液样本分离CRAB 4、55、78及117菌株,挑取单菌落分别培养生物被膜态菌(A组)和游离态菌(B组),采用Trizol法提取2组细菌核糖核酸(RNA)样本进行转录组测序;使用DESeq软件进行差异表达基因(DEGs)分析,通过GOSeq R软件进行基因本体(GO)富集分析,通过KO?BAS软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;选择8个DEGs,利用实时荧光定量PCR(qRT?PCR)验证转录组测序分析结果。结果 RNA样品完整无污染满足测序要求,测序数据错误率不超过

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