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广西狂犬病病毒M基因序列分析

周开姣  吴慧  陈敏玫  莫兆军  闭福银  莫毅  谭毅  韦增良  李浩  杨进业  唐青  
【摘要】:目的探讨广西13株狂犬病病毒M基因遗传变异特征及其与狂犬病在广西流行的关系。方法用直接免疫荧光法(DFA)检测2006~2008年广西地区收集到的3 961份犬脑组织标本,将检测结果为阳性的脑组织标本进行RT-PCR扩增,双向测序M基因核苷酸序列,进行生物信息学分析。结果 DFA法检测阳性率为8.84%(350/3 961),RT-PCR法检测阳性率为14.57%(51/350);获得相应区段的狂犬病病毒核苷酸序列13份;MP基因同源性分析表示,13株病毒核苷酸序列与氨基酸序列同源性范围为85.4%~100%和91.1%~99.5%,M基因氨基酸序列同源性普遍高于相应区段的核苷酸序列。种系发生分析显示,13株病毒标本均属于基因Ⅰ型,除GX16毒株与国际上野生动物病毒基因Ⅰ型分离株进化关系较近外,其他广西分离株与CTN疫苗株及宁夏街毒株进化关系较近。结论 13株狂犬病病毒株均属于基因Ⅰ型狂犬病毒,但其在某些功能位点发生了变异。

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