收藏本站
收藏 | 投稿 | 论文排版

儋州鸡体尺性状全基因组关联分析

姜宏正  杨德智  马中华  荀文娟  施力光  侯冠彧  
【摘要】:【目的】挖掘影响地方鸡体尺性状的有效SNP位点及功能基因,给儋州鸡育种工作提供有效的数据基础和理论支撑。【方法】共采集200只儋州鸡血样并提取基因组DNA,利用10×全基因组重测序技术获得全基因组SNP标记并对试验个体基因型进行分型。使用EMMAX软件基于混合线性模型对70日龄的儋州鸡体尺性状(胫长、胫围、体斜长、胸宽、髋骨宽、胸深、龙骨长)进行全基因组关联分析。【结果】共发现与胫长性状和胫围性状基因组水平显著相关的SNPs位点有12和8个,与胫长性状相关SNPs分别定位于1、2、4和8号染色体上;与胫围性状相关的SNPs定位于2、4、8和13号染色体上。预测与胫长相关的候选基因为KCNA1、TPK1、EZH2、FSTL5和AMY2A基因,与胫围相关的候选基因为TPK1、FSTL5、AMY2A、TGFBI、LECT2和IL-9。通过KEGG通路分析和GO注释发现,8个基因参与钾离子跨膜转运、硫胺素新陈代谢、细胞增殖、钙离子结合、骨骼肌卫星细胞维持与骨骼肌再生、细胞受体相互作用、生长因子活性等生物学进程。【结论】本研究发现了20个与儋州鸡体尺性状关联的SNPs位点,并筛选到8个目标性状候选基因,为儋州鸡育种提供候选的分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前17条
1 庄景杰;郜周阳;杨静;徐桂云;;蛋鸡体尺性状与产蛋性能相关性的研究进展[J];中国家禽;2021年11期
2 杨光维;李涛;刘建明;褚洪忠;陈春华;团勇;张梅;刘宜勇;马军;吐来力江;乃比江;;非遗传因素对新疆褐牛体尺性状的影响[J];畜牧与兽医;2020年01期
3 霍小凯;王加启;王建平;卜登攀;陈木真;雒秋江;刘开朗;;不同出生季节对犊牛体尺发育的影响[J];中国奶牛;2008年12期
4 陈明银;冉志平;叶胜强;王丽霞;杨宇;龚萍;喻婷;周华;童伟文;夏喻;华娟;代长云;邓兵;;黑羽肉鸭不同屠宰日龄体尺性状分析[J];湖北农业科学;2015年07期
5 彭兴;赵云翔;江科;谭岳华;朱琳;;种猪体尺校正系数研究[J];科学种养;2018年08期
6 李建江,骆庆雨,郑全,刘东燕;育成牛不同月龄配种对其体尺发育的影响[J];西北民族学院学报(自然科学版);2003年01期
7 蔡勇;王燕新;廖圆圆;刘翊忠;李海健;徐红伟;阿依木古丽;杨具田;;兰州大尾羊体重和体尺的相关性研究[J];家畜生态学报;2021年01期
8 唐爱发,连林生,李爱云;撒坝猪体尺性状的聚类与主成分分析[J];辽宁畜牧兽医;2000年03期
9 全瑞旺;梁翠萍;王润莲;杨明顺;何雪萍;;低磷饲粮中添加植酸酶对1~21日龄麒麟鸡生长性能、体尺性状及胫骨特性的影响[J];家禽科学;2021年03期
10 苗小猛;刘嘉;韩雪;李亮;周景瑞;吴仙;伍革民;张洁;徐景峨;蒲龄;陶宇航;;三穗鸭早期生长曲线拟合及10周龄体尺性状分析[J];四川农业大学学报;2020年06期
11 吴强;蹇慧;韦凤英;邓继贤;秦黎梅;黄英飞;杨秀荣;;“灵山土”黑羽鸡和麻羽鸡体尺及屠宰性状的比较研究[J];广西畜牧兽医;2020年03期
12 陈海军;;山猪体尺生长曲线拟合研究[J];猪业科学;2019年10期
13 王晓枫;王勇;王钊哲;王广龙;徐家付;戴剑涛;白文顺;杨亮宇;;大理剑川县青花鸡养殖状况调查及体尺性状分析[J];畜牧与兽医;2017年01期
14 张智慧;李伟;韩永胜;;牛体尺影响因素及其应用[J];中国畜牧杂志;2018年01期
15 沈曼曼;王克华;曲亮;郭军;马猛;窦套存;;徐海长距鸡体尺性状与屠宰性状间的典型相关分析[J];中国农学通报;2015年11期
16 文生萍;胡骁飞;高明艳;史胜利;;云南独龙鸡体尺性状和屠宰性能测定及相关性分析[J];浙江农业科学;2017年01期
17 王可;郭浩;刘威林;马钦;苏伟;朱德海;;基于点云旋转归一化的猪体体尺测点提取方法[J];农业工程学报;2017年S1期
中国重要会议论文全文数据库 前20条
1 白俊艳;董智豪;庞有志;杨又兵;吴胜军;茹宝瑞;刘贤;王之保;付凤云;申恒然;陈宇;李静云;李世豪;王乾昆;;河南毛驴的体重和体尺性状对年龄的回归分析[A];第六届(2020)中国驴业发展大会暨首届张家口特色牧业(阳原驴)发展研讨会论文集[C];2020年
2 肖海霞;玉山江;帕热哈提江·吾甫尔;尹庆贺;托乎提·阿及德;;新疆3个产区驴体尺和体重的相关性分析[A];中国畜牧兽医学会马学分会成立大会学术论文集[C];2014年
3 范佳英;邓红雨;;淮南麻鸭体重和体尺性状的测定与分析[A];中国家禽科学研究进展——第十四次全国家禽科学学术讨论会论文集[C];2009年
4 王润莲;江新生;杜炳旺;曹宁贤;张国金;陈华栋;董其欢;王效京;李树军;;珍禽贵妃鸡的体尺性状及骨骼特性分析[A];安全优质的家禽生产——第十五次全国家禽学术讨论会论文集[C];2011年
5 乌仁套迪;巴拉;张文彬;宝迪;照日格图;白俊艳;苏含;刘茜;钟自然;翟亚格;袁文华;王静;杨峰;张春豪;贾百威;高森岩;楚猛;;双峰驼体尺性状的聚类分析乌仁套迪1巴拉1张文彬1宝迪1照日格图1白俊艳2苏含2刘茜2钟自然2翟亚格2袁文[A];第四届(2015)中国骆驼大会论文汇编[C];2015年
6 马铭龙;贾汝敏;巨向红;王润莲;刘铀;;狮头鹅体尺性状与精液品质间的关联研究[A];中国畜牧兽医学会家禽学分会第九次代表会议暨第十六次全国家禽学术讨论会论文集[C];2013年
7 李敏;姚新奎;;竞赛用马速度与体尺的相关性研究[A];中国畜牧兽医学会马学分会成立大会学术论文集[C];2014年
8 李菊峰;曾乐平;蒋月娣;赵文锋;;体尺资料的聚类分析结果作为种猪选择辅助指标的探讨[A];中国畜牧兽医学会养猪学分会2009年学术年会“回盛生物”杯全国养猪技术论文大赛论文集[C];2009年
9 许恒勇;宋浪;陈玲;赵开强;杨俊;刘贺贺;韩春春;李亮;王继文;;钢鹅体尺性状与屠宰性能的相关分析[A];第六届(2015)中国水禽发展大会论文汇编[C];2015年
10 龚萍;杨永平;杨宇;张弘毅;钱运国;叶胜强;王丽霞;邓兵;喻婷;龚炎长;;鸭MSTN基因外显子1的多态性检测及其与体尺性状的关联分析[A];中国畜牧兽医学会家禽学分会第九次代表会议暨第十六次全国家禽学术讨论会论文集[C];2013年
11 肖海霞;帕热哈提江·吾甫尔;王岳强;努尔古丽·塔力甫汗;托乎提·阿及德;;新疆不同产区驴体重与体尺相关性研究[A];第三届(2017)中国驴业发展大会暨第七届驴产业发展高峰论坛论文集[C];2017年
12 杨阳;嵇传良;李菲菲;李桢;孙玉江;;德州驴体重与体尺回归分析[A];第三届(2017)中国驴业发展大会暨第七届驴产业发展高峰论坛论文集[C];2017年
13 肖海霞;帕热哈提江·吾甫尔;王岳强;努尔古丽·塔力甫汗;托乎提·阿及德;;应用R语言分析疆岳驴体尺和体重的相关性[A];第三届(2017)中国驴业发展大会暨第七届驴产业发展高峰论坛论文集[C];2017年
14 杨雪梅;黄锡霞;田可川;谭世新;许建标;;不同品种、年龄、性别对肉羊体尺体重的影响[A];第十六届(2019)中国羊业发展大会暨庆阳农耕文化节论文集[C];2019年
15 张军;吕佳;叶建超;罗淑英;陈有才;朱攀华;;四川麻鸭体尺性状和生产性能测定[A];第六届(2015)中国水禽发展大会论文汇编[C];2015年
16 吴占福;马旭平;李文海;王海云;吴淑琴;李寸欣;;塞北兔成年体重与体尺、耳型的通径分析[A];2007中国兔文化节“康大杯”兔业优秀科技论文、科普作品集[C];2007年
17 初芹;张剑;陶士军;王海宏;耿爱莲;刘华贵;;北京油鸡、贵妃鸡及杂交后代体尺与屠体性能研究[A];第二届中国黄羽肉鸡行业发展大会会刊[C];2010年
18 肖海霞;帕热哈提江·吾甫尔;王岳强;努尔古丽·塔力甫汗;托乎提·阿及德;;吐鲁番驴体尺和体重的R语言分析及最优回归模型的建立[A];第三届(2017)中国驴业发展大会暨第七届驴产业发展高峰论坛论文集[C];2017年
19 佟荟全;刘丽仙;荣华;豆腾飞;徐志强;谷大海;赵素梅;黄英;葛长荣;贾俊静;李琦华;;云南地方鸡IGFlR基因多态性与体重及体尺性状相关性分析[A];遗传多样性:前沿与挑战——中国的遗传学研究(2013-2015)——2015中国遗传学会大会论文摘要汇编[C];2015年
20 王克华;窦套存;曲亮;童海兵;高玉时;;20周龄如皋黄鸡公鸡体尺、屠宰、体脂、血脂的相关性研究[A];第五届(2011)中国蛋鸡行业发展大会会刊[C];2011年
中国博士学位论文全文数据库 前19条
1 张丽娜;基于跨视角机器视觉的羊只体尺参数测量方法研究[D];内蒙古农业大学;2017年
2 房健;不同体尺大型草食动物采食对松嫩草地植被特征的响应及作用研究[D];东北师范大学;2013年
3 刘永峰;牛13个体尺性状相关基因的克隆表达、序列特征及遗传效应分析[D];西北农林科技大学;2010年
4 王立刚;猪全基因组拷贝数变异草图构建及体尺性状全基因组关联分析[D];中国农业科学院;2013年
5 张莉;绵羊肉用性状全基因组关联分析[D];中国农业科学院;2013年
6 谈成;基于二代测序技术的猪基因组选择及全基因组关联分析研究[D];中国农业大学;2017年
7 吴晓平;基于SNP芯片和全测序数据的奶牛全基因组关联分析和基因组选择研究[D];中国农业大学;2014年
8 闫奕源;鸡基因组遗传变异的检测分析和蛋鸡基因组选择的研究[D];中国农业大学;2017年
9 黄爱霞;浙江省主要鸡种肉品质分析及Leptin receptor基因对鸡脂肪代谢影响分子机制的研究[D];浙江大学;2011年
10 章峰;肉牛剩余采食量及其组成性状的全基因组关联分析和基因组选择研究[D];江西农业大学;2017年
11 房灵昭;奶牛复杂性状基因组特征模型分析及基因组选择研究[D];中国农业大学;2017年
12 尹立林;一种利用机器学习策略提高复杂性状全基因组预测准确性及计算效率的方法开发[D];华中农业大学;2020年
13 郭同军;去势影响西门塔尔牛脂肪沉积的生理机制研究[D];新疆农业大学;2015年
14 周正奎;全基因组关联分析和全基因组预测法解析犬髋关节疾病[D];西北农林科技大学;2011年
15 程笃学;猪肉质性状的全基因组关联研究[D];中国农业科学院;2012年
16 李严;猪拷贝数变异全基因组检测及与脐疝有关联的染色体区域鉴定[D];华中农业大学;2015年
17 李勇;不同SNP分型技术在猪基因组选择中效果评估及全基因组关联研究[D];华中农业大学;2020年
18 姚新奎;伊犁马、新吉马及其杂交马乳理化指标、泌乳特性初步研究[D];新疆农业大学;2011年
19 段忠意;鸡蛋壳超微结构与晶体结构的测定及全基因组关联分析[D];中国农业大学;2017年
中国硕士学位论文全文数据库 前20条
1 刘伟;基于深度学习的牛体尺测量方法研究[D];内蒙古科技大学;2020年
2 武尧;母猪体尺、体重检测评估系统开发研究[D];山西农业大学;2019年
3 文博;基于Mask R-CNN的牛体尺测量方法研究[D];内蒙古科技大学;2020年
4 单慧丽;MC4R基因多态性与湖羊体重、体尺性状的关联分析[D];南京农业大学;2019年
5 王乐乐;体尺外貌表型测定在种猪生产中的应用研究[D];河北农业大学;2015年
6 古丽孜议娜·阿斯哈尔;新疆褐牛生长发育规律、体尺与体重相关性分析[D];新疆农业大学;2018年
7 董梦宇;GHRL及其受体GHSR基因的多态性与秦川肉牛体尺性状的关联性分析[D];西北农林科技大学;2016年
8 杨东树;伊犁地区杂交肉用马的体重体尺和屠宰性状及肌肉组织学的研究[D];新疆农业大学;2016年
9 康慕思;牛GDF10基因的多态性及其与体尺性状的关联性分析[D];西北农林科技大学;2011年
10 吴强;广西四种地方鸡屠体、体尺和蛋品质性状比较研究[D];广西大学;2020年
11 马荣暖;奶山羊α-乳清蛋白基因、β-乳球蛋白基因多态性及其与产奶及体尺性状的关联分析[D];西北农林科技大学;2010年
12 张海斌;杂交群体中基因组选择应用效果研究[D];华南农业大学;2016年
13 唐洲;内源性反转录病毒在主要农业动物基因组上分布及其特征的研究[D];华中农业大学;2016年
14 刘艳斌;野牦牛基因组组装及牦牛泛基因组的构建[D];兰州大学;2020年
15 叶昌;杂交奶水牛体尺和体重及乳房性状与产奶性能的相关分析[D];华中农业大学;2013年
16 薛佳;猪基因组预选择的优化研究[D];四川农业大学;2013年
17 董林松;通过预选标记法进行基因组选择[D];山东农业大学;2012年
18 付东海;牦牛部分生长性状与血常规指标的全基因组关联分析和基因组选择研究[D];中国农业科学院;2020年
19 李建柱;淮南麻鸭消化器官发育及其与体重、体尺增长关系研究[D];河南农业大学;2008年
20 张善芝;肉牛杂交组合对生长性能的影响及调查[D];中国农业大学;2005年
中国重要报纸全文数据库 前2条
1 记者 杨朝晖;我国启动世界首个驴基因组项目[N];科技日报;2014年
2 王方;科学家破译德州驴基因组[N];中国科学报;2020年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978