收藏本站
收藏 | 投稿 | 论文排版

主要伞形科蔬菜Trihelix基因家族的鉴定及生物信息分析

吴彤  杨启航  冯书燕  张雨  于彤  沈绍琴  宋小明  
【摘要】:三螺旋转录因子是植物中一类非常重要的转录因子,在调节生长发育过程和响应各种逆境胁迫中发挥着关键作用。然而到目前为止,还没有对伞形科物种的三螺旋转录因子基因家族进行全面的分析。本研究在三种伞形科物种香菜、芹菜、胡萝卜和其它模式或近缘物种拟南芥、莴苣、葡萄全基因组范围内,分别鉴定出39、38、38和27、41、36条三螺旋转录因子。通过系统发育分析和保守基序的分析,这些转录因子被分为五组,即GT-1、GT-2、GTγ、SIP1和SH4五个亚家族。其中,SIP1亚家族成员最多。通过保守基序分析,本研究推测Motif1和Motif10是导致三螺旋的重要因素。香菜、芹菜和胡萝卜的一些三螺旋转录因子基因在不同组织及不同生长发育时期具有较高的表达水平,表明这些基因在组织形成和生长发育过程中起到重要的作用。本研究对进一步探索该家族调控植物的生长的分子机制和逆境响应机制奠定了基础,同时为伞形科植物其它基因家族的研究提供了指导。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前8条
1 郑玲;李梦丹;;甜瓜Trihelix转录因子的鉴定与生物信息学分析[J];江苏农业科学;2022年16期
2 丁亚东;舒黄英;高崇伦;郝园园;成善汉;朱国鹏;汪志伟;;中国辣椒热激蛋白HSP70基因家族分析[J];植物科学学报;2021年02期
3 张春利;袁岐;赵婷婷;许向阳;;辣椒Trihelix转录因子家族的生物信息学分析[J];中国农学通报;2017年17期
4 王萱;吴波;程春振;姜波;钟广炎;;甜橙乙烯诱导酯酶基因家族的进化[J];广东农业科学;2014年10期
5 王紫彤;周倩怡;田洁;;干旱胁迫下大蒜叶绿素合成基因家族鉴定分析[J];植物资源与环境学报;2022年03期
6 高馨悦;严理;刘头明;;苎麻和大蒜FLOWERING LOCUS T基因家族比较和进化分析[J];中国麻业科学;2021年03期
7 阚东扬;冉秋月;唐玉凤;杨润森;;苹果糖转运蛋白基因家族筛选鉴定[J];现代食品;2021年21期
8 张波;李鲜;陈昆松;;基于EST库的猕猴桃脂氧合酶基因家族成员的克隆[J];园艺学报;2008年03期
中国重要会议论文全文数据库 前11条
1 刘志鑫;孙宇;叶子;罗睿雄;李忠;刘晓妹;蒲金基;张贺;;杧果钙调蛋白转录激活因子基因家族鉴定及分析[A];植物病理科技创新与绿色防控——中国植物病理学会2021年学术年会论文集[C];2021年
2 黄鑫;方远鹏;王琪;李云洲;;番茄双链RNA绑定蛋白(SlDRB)基因家族鉴定及抗TYLCV防御反应分析[A];植物病理科技创新与绿色防控——中国植物病理学会2021年学术年会论文集[C];2021年
3 陈华涛;陈新;顾和平;张红梅;袁星星;崔晓艳;;菜用大豆铁蛋白基因家族的克隆与表达分析[A];中国园艺学会2012年学术年会论文摘要集[C];2012年
4 张梦玲;王立新;薛超玲;赵锦;刘志国;刘孟军;;枣MAPKKK家族基因鉴定及其响应枣疯病表达分析[A];中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集[C];2019年
5 张上隆;;柑橘转化酶基因家族新成员的克隆和序列分析[A];张上隆果树学文选[C];2006年
6 高洁;吴伯萍;张波;陈昆松;;柑橘UGT基因家族的克隆及表达分析[A];中国园艺学会2017年论文摘要集[C];2017年
7 朱海生;刘建汀;王彬;陈敏氡;张前荣;叶新如;林珲;李永平;温庆放;;普通丝瓜过氧化物酶(POD)基因家族的克隆及分析[A];中国园艺学会2017年论文摘要集[C];2017年
8 张靖国;胡红菊;罗正荣;;梨ACS基因家族鉴定及其在果实成熟中的表达分析[A];中国园艺学会2017年论文摘要集[C];2017年
9 曾文芳;丁义峰;王雁;王小贝;牛良;潘磊;鲁振华;崔国朝;王志强;;桃PME和PMEI基因家族的鉴定及其在果实成熟过程的表达分析[A];中国园艺学会2017年论文摘要集[C];2017年
10 冯立娟;尹燕雷;杨雪梅;唐海霞;焦其庆;;石榴F5H基因家族的鉴定与生物信息学分析[A];中国石榴研究进展(三)——第三届中国园艺学会石榴分会会员代表大会暨首届中国泗洪软籽石榴高峰论坛、国家石榴产业科技创新联盟筹备会论文集[C];2018年
11 毛景秀;李南羿;;双孢蘑菇PPO基因家族的生信分析及表达模式研究[A];多彩菌物 美丽中国——中国菌物学会2019年学术年会论文摘要[C];2019年
中国博士学位论文全文数据库 前5条
1 靳亚忠;甜瓜醇脱氢酶基因家族成员鉴定、分类及表达调控[D];沈阳农业大学;2014年
2 王洁;植物MAPK级联途径基因家族的进化分析及番茄SlMPK13的功能鉴定[D];浙江大学;2015年
3 丁安明;番茄与烟草PPR基因家族分析及育性相关基因功能研究[D];中国农业科学院;2014年
4 李甲明;梨糖转运蛋白基因家族分析及PbtMT4和PbSWEET基因功能研究[D];南京农业大学;2017年
5 曹仃仃;莲藕膨大的蛋白质组和磷酸化蛋白质组研究及莲CONSTANS-like基因家族分析[D];中国科学院大学(中国科学院武汉植物园);2020年
中国硕士学位论文全文数据库 前20条
1 李秋月;柑橘U-box基因家族的鉴定和CRISPR/Cas9编辑CcPUB4基因的研究[D];西南大学;2019年
2 冯坤;番茄SOD基因家族的全基因组鉴定及盐胁迫下表达分析[D];南京农业大学;2017年
3 孟纯阳;辣椒PSY基因家族分析及CaPSY1功能研究[D];郑州大学;2019年
4 张可为;番茄钙离子通道OSCA基因家族的鉴定及胁迫响应分析[D];东北农业大学;2019年
5 王晨阳;柑橘MIR156和MIR172基因家族成员在成花调控中的功能验证[D];华中农业大学;2018年
6 曾繁欢;白菜PGIPs基因家族的进化分析及BrPGIP4与BrPGIP2功能的初步研究[D];浙江大学;2017年
7 张春利;番茄PIN基因家族的全基因组分析及抗逆相关基因筛选鉴定[D];东北农业大学;2018年
8 徐龙;柑橘GRAS基因家族全基因组分析[D];华中农业大学;2016年
9 赵荣荣;梨TPS和HMGR基因家族鉴定及PcHMGR1基因功能研究[D];山东农业大学;2018年
10 吴栋雄;白菜TCP基因家族的鉴定及利用CRISPR-Cas9系统进行编辑的初步探索[D];福建农林大学;2017年
11 杜利莎;苹果TPS基因家族成员的克隆及其在‘长富2号’花芽孕育中的作用[D];西北农林科技大学;2017年
12 张涛;桃脂氧合酶基因家族cDNA全长克隆与功能分析[D];西北农林科技大学;2009年
13 王萱;甜橙乙烯诱导酯酶基因家族的进化和表达分析[D];西南大学;2014年
14 张帆;辣椒Aux/IAA基因家族的鉴定与表达分析[D];湖南大学;2019年
15 王婷;番茄RAV基因家族的鉴定及其功能研究[D];山东农业大学;2021年
16 吕红梅;梨磷酸果糖激酶基因家族鉴定与基因编辑体系初探[D];南京农业大学;2019年
17 熊婷婷;PpTOPP4基因家族成员鉴定及功能初探[D];河南农业大学;2019年
18 牛义岭;番茄GRAS基因家族生物信息学分析及部分抗性相关基因鉴定分析[D];东北农业大学;2017年
19 张凤;梨PbrVPE基因家族的鉴定及PpyVPE2的克隆与表达[D];南京农业大学;2020年
20 卢世雄;葡萄Trihelix转录因子家族鉴定及VvTrihelix5响应盐胁迫功能研究[D];甘肃农业大学;2021年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978