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基于C-mii工具的长春花miR156序列及前体序列识别与预测

刘起睿  于放  
【摘要】:MicroRNA是一种18~22 nt的内源性非编码RNA,在植物的诸多代谢途径中起到调控作用,其中,miR156家族是植物生长发育及次生代谢过程重要调控因子。本研究采用C-mii工具,利用药用植物基因组资源数据库提供的长春花转录组数据,对潜在的成熟miR156序列及其前体结构进行识别和预测。最终得到21个miRNA家族的识别结果,共574条miRNA预测序列,其中miR156家族共4个成员,筛选得到2个miR156家族成熟序列和前体序列二级结构,分别命名为Cro-miR156a及Cro-miR156c。

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