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RNA 二级结构预测算法及图形表示

孙建华  
【摘要】:在生物大分子RNA序列二级结构预测的算法中使用了回溯算法,并对RNA二级结构预测的结果实现图形表示。RNA二级结构预测部分,可以给出万个碱基的预测结果,使原来只能预测几百个碱基的结果提高了一步。这为生物学家从中挑选最符合生物意义的结构提供了更好的条件。在实现的过程中,讨论了回溯过程,并描述了部分编程思想。二级结构的作图部分,可在监视器上给出二级结构的图形,并且提供了若干屏幕操作手段,如:图形的放大,缩小,移动,旋转,屏幕硬拷贝以及对预测多样性的处理。全部系统用C语言实现。具有较好的扩展性。

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