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应用质谱技术检测结肠癌细胞DPYD和MTHFR基因单核苷酸多态性

陈宝安  张文静  张孝平  柏志斌  冯继峰  仲悦娇  丁家华  高冲  鲍文  彭苗新  程璐  陆祖宏  
【摘要】:目的:检测结肠癌细胞株中两种代谢相关基因DPYD和MTHFR的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)。方法:培养HT-29及Lovo两株结肠癌细胞,分别提取基因组DNA,PCR扩增DPYD和MTHFR基因相应目的片段,采用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术进行DPYD基因rs1801159(A/G)、rs1801160(G/A)、rs17376848(A/G),MTHFR基因rs1801131(A/C)、rs1801133(C/T)、rs2274976(G/A)的SNPs位点检测。结果:两种细胞的DPYD基因3个位点rs1801159、rs1801160及rs17376848基因型均为野生纯合型,即A/A、G/G及A/A型。HT-29细胞MTHFR基因rs1801131和rs1801133、rs2274976位点基因型分别为A/C、C/T杂合子和G/G纯合子,而Lovo细胞此3个位点依次为A/A、T/T纯合子和G/A杂合子。结论:本实验中HT-29及Lovo两种细胞株的DPYD基因所测3个SNP位点基因型均相同,而这两种结肠癌细胞株MTHFR基因所测的各SNP位点基因型均不相同。

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