| | | | | 诺如病毒RT-PCR检测及进化树分析 | | | 王作虪;韩悦;安淑一;郭军巧 | | | 目的:了解辽宁省儿童诺如病毒感染情况。方法:用RT-PCR的方法对131份粪便标本进行检测。扩增出的目标片段克隆于T载体上测定序列,用Mega3.1软件、邻位相连法构建进化树。结果:共有22份粪便标本诺如病毒RT-PCR检测阳性。通过核苷酸碱基序列比对发现这22株诺如病毒碱基序列与2006~2007年在匈牙利、荷兰和日本引起流行的参考株碱基序列高度同源,进化树分析表明它们共同构成GII.4的一组新变异群;与欧洲食源性病毒监测网络诺如病毒数据库比较,发现它们与欧洲GII.4新变异株2006b同源性最高。结论:辽宁地区检测到的22株诺如病毒均属于GII.4新变异株2006b。
【作者单位】：辽宁省疾病预防控制中心 沈阳110005
【关键词】：诺如病毒;RT-PCR;进化树分析
【基金】：辽宁省博士科研基金项目(20052135)
【分类号】：R450
【DOI】：CNKI:SUN:ZWJZ.0.2008-05-005
【正文快照】：
诺如病毒(Norovirus)属于人类杯状病毒(Hum an Calic ivir-us),是导致人类急性胃肠炎的重要病原体之一。诺如病毒主要通过人与人直接传播[1,2],也可通过食品与水间接传播[3~5]。诺如病毒有5个遗传群(Gene group,G):G I,G II,G I-II,G IV和GV[6,7],其中G I、G II和G IV群诺如病 | | |
| | |  推荐 CAJ下载  PDF下载 | | | CAJViewer7.0阅读器支持所有CNKI文件格式，AdobeReader仅支持PDF格式 | | | | Detection of norovirus by reverse transcription polymerase chain reaction and its phylogenetic analysis | | | Wang Zuo-shu;Han Yue;An Shu-yi;Guo Jun-qiao(Liaoning Center for Disease Control and Prevention;Shenyang 110005;China) | | | Objective:To investigate norovirus infection of children in Liaoning Province.Methods:A total of 131 stool samples were detected by reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR).The RT-PCR-products were cloned to T vector and sequenced and phylogenetic tree was constructed by Neighbor-joining method in Mega3.1.Results:A total of 22 norovirus strains were detected by RT-PCR.Nucleotide sequence comparison showed these strains were highly identical to those which prevalent in Hungary,Netherlands and Japan in 2006~2007.Phylogenetic analysis revealed that they constructed a new variant cluster of Norovirus GII.4 and using norovirus database of foodborne virus in Europe Network showed that they also had the highest identity to one new variant of Norovirus GII.4 2006b.Conclusion:Twentytwo norovirus strains from Liaoning Province belong to new variants of Norovirus GII.4 2006b.
【Keyword】：Norovirus;RT-PCR;Phylogenetic analysis |
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