《新疆农业科学》2008年03期 加入收藏    获取最新 
 新疆盐生植物猪毛菜逆向运输蛋白基因SaNHX1 3’-RACE的克隆及序列分析
 张雨良;罗淑萍;杨峰山;魏岩;袁辉;郭长奎
 　　以新疆盐生植物猪毛菜(Salsola collina Pall.)为材料提取总RNA,根据NHX1家族同源序列保守区设计1对简并引物,进行RT-PCR扩增,得到猪毛菜逆向运输蛋白基因cDNA中间一段619 bp序列。再用快速扩增cDNA 3’末端(3’RACE)方法,得到约1 000 bp 3’末端序列。将两段序列进行拼接,得到猪毛菜长为1 585bp(Gen Bank登陆号为EU072932)的逆向运输蛋白基因(SaNHX1)cDNA序列,编码370个氨基酸,其编码序列、氨基酸序列与同科耐盐植物盐角草相应序列同源性为85%和87%,研究为进一步克隆猪毛菜NHX1全基因序列和研究其功能打下基础。
【作者单位】：新疆农业大学 乌鲁木齐830052(张雨良;罗淑萍;魏岩;袁辉;郭长奎);黑龙江大学生命科学学院 哈尔滨150080(杨峰山)
【关键词】：猪毛菜;逆向运输蛋白;SaNHX1基因;3’-RACE;克隆
【基金】：国家自然科学基金项目(30660033);新疆高校创新研究群体基金项目(XJEDU2004G07)
【分类号】：Q943.2
【DOI】：CNKI:SUN:XJNX.0.2008-03-029
【正文快照】：
　　高盐环境严重影响植物的生长发育,是造成农作物减产的主要原因之一。新疆是中国荒漠化大区,也是中国最大的盐土区,盐渍面积达1 100×104hm2,约占全国盐渍土面积的三分之一和新疆土地面积的6.6%,现有耕地三分之一次生盐渍化。轻度、中度盐渍地粮食减产10%~50%,重度盐渍地则颗粒
 
 推荐 CAJ下载           PDF下载
 CAJViewer7.0阅读器支持所有CNKI文件格式，AdobeReader仅支持PDF格式
 Clone and Sequence Analysis of 3'RACE of Antiporter Protein Gene SaNHX1 in Xinjiang Halophytes Plant Salsola collina Pall.
 ZHANG Yu-liang1;LUO Shu-ping1;YANG Feng-shan2;WEI Yan1;YUAN Hui1;GUO Chang-kui1(1.College of Agronomy;Xinjiang Agricultural University;Urumqi 830052;China;2.College of Life Science Department;Heilongjiang University;Harbin 150080;China)
 　Total RNA in this experiment was extracted from Xinjiang halophytes plant Salsola affinis(Salsola collina Pall.).According to NHX1 family homologous sequence conservative region,.one pair of degenerate primers was used for RT-PCR amplification.The results showed that a partial middle 619 bp fragment of SaNHX1 antiporter protein was obtained.The 3' end sequence was obtained by 3' RACE method.These two fragments were overlapped,getting SaNHX1 3'terminal fragment 1 585 bp sequence encoding 370 amino acid residues.The codon sequence and amino acid sequence of the 3'ends of SaNHX1 gene were shared by 85% and 87% identity with those of the same family halophytes SeNHX1 gene respectively.This research provided a basic foundation to clone the whole NHX1 sequence and study its structure and function.
【Keyword】：Salsola collina Pall.;antiporter protein;SaNHX1 gene;3'RACE;clone
 【参考文献】 共（7）篇 
 中国期刊全文数据库找到 4 条
 
1蔡小宁,杨平,贲爱玲,沈志花,王敏; 盐芥ThNHX1基因的3′RACE [J]; 安徽农业科学; 2006年21期
2唐克轩,开国银,张磊,潘征,赵凌侠,孙小芬,郑金贵; RACE的研究及其在植物基因克隆上的应用 [J]; 复旦学报(自然科学版); 2002年06期
3李金耀,马纪,蔡伦,王艳,张富春; 灰绿藜和碱蒿NHX基因3'-UTR序列的差异性分析 [J]; 植物生理学通讯; 2005年02期
4李金耀,张富春,马纪,蔡伦,鲍勇刚,王宾; 采用RT-PCR扩增方法从犁苞滨藜中扩增NHX基因 [J]; 植物生理学通讯; 2003年06期
 西文参考文献找到 3 条
 
1Apse M P, Aharon G S, Snedden W A, et al; Salt tolerance conferred by overexpression of a vacuolar Na+/H+ antiporter in Arabidopsis [M];Science; 1999年
2Quintero FJ, Blatt MR, Pardo JM; Functional conservation between yeast and plant endosomal Na+/H+ antiporters [M];FEBS Lett; 2000年
3Transgenic salt-tolerant tomato plants accumulate salt in foliage but not in fruit [M];Nature Biotechnology; 2001年
 【共引文献】 共（28）篇 
 中国优秀硕士学位论文全文数据库找到 8 条
 
1淡明; 白腐菌D1漆酶基因的克隆及其表达载体的构建 [D];华南热带农业大学; 2006年
2张珊珊; 玉米DEAD-box RNA解旋酶基因的克隆及分析 [D];华中农业大学; 2006年
3宋小双; 白腐菌漆酶基因的克隆及序列分析 [D];东北林业大学; 2004年
4黄新杰; 三个小麦抗条锈病相关基因的全长cDNA克隆及生物信息学分析 [D];西北农林科技大学; 2007年
5余宇; 小麦类甜蛋白TLP基因的克隆与原核表达 [D];西北农林科技大学; 2007年
6刘睿杰; 应用RACE技术克隆月见草△～6-脂肪酸脱氢酶基因cDNA [D];内蒙古大学; 2007年
7粟霞; 苹果抗坏血酸过氧化物酶基因的克隆及其植物表达载体的构建 [D];西北农林科技大学; 2007年
8邵培; 玉米profilin3基因的克隆表达分析及其启动子的分离 [D];华中农业大学; 2007年
 中国博士学位论文全文数据库找到 5 条
 
1刘志华; 球毛壳菌（Chaetomium globosum）功能基因克隆及表达研究 [D];哈尔滨工业大学; 2006年
2韩春来; 鸡干扰素与干扰素受体重组蛋白的生物学特性及其相互作用 [D];中国农业大学; 2005年
3刘思秀; 应用生物技术对植物材料抗冷胁迫的研究 [D];复旦大学; 2004年
4孙晓红; 草菇冷诱导相关基因的克隆及分析 [D];南京农业大学; 2006年
5陈观水; 甘薯抗病相关基因的克隆与分析 [D];福建农林大学; 2007年
 中国期刊全文数据库找到 10 条
 
1蔡小宁,杨平,贲爱玲,沈志花,王敏; 盐芥ThNHX1基因的3′RACE [J]; 安徽农业科学; 2006年21期
2梁锦锋,于红卫,叶国平; 植物新基因克隆策略和技术进展 [J]; 安徽农业科学; 2007年23期
3刘志华,杨谦; 球毛壳菌二烯醇内酯水解酶基因克隆及序列分析 [J]; 东北林业大学学报; 2005年04期
4赵红娟,张博,李培英,陈爱萍; 农杆菌介导犁苞滨藜NHX基因转化苜蓿的影响因素 [J]; 草地学报; 2007年05期
5蔡小宁,杨平,贲爱玲,续晨,王敏,Wu Yajun; 盐芥ThHKT1基因的克隆 [J]; 江苏农业科学; 2006年06期
6王飞; 甘薯类胡萝卜素合成酶基因pds全长cDNA的克隆 [J]; 安徽理工大学学报(自然科学版); 2007年01期
7郝敏,谷守芹,韩建民,董金皋; cDNA末端扩增技术的研究进展 [J]; 河北林果研究; 2006年02期
8葛庆燕,吴凇,苏乔,安利佳; RLM-RACE法快速克隆盐角草胆碱单加氧酶cDN A5′末端全序列 [J]; 辽宁师范大学学报(自然科学版); 2005年03期
9张霞,曾幼玲,李金耀,赵干,张富春; 胡杨Na~+/H~+反向运输载体(PeNHX2)基因的克隆与序列分析 [J]; 生物技术; 2006年03期
10杨松杰,张富春,刘世贵; 盐渍化土壤改良利用新方法——植物耐盐基因的遗传转化 [J]; 世界林业研究; 2006年01期
 【二级参考文献】 共（31）篇 
 中国期刊全文数据库找到 7 条
 
1姚剑虹,孙小芬,唐克轩; 半夏凝集素基因的克隆(英文) [J]; 复旦学报(自然科学版); 2001年04期
2唐克轩,开国银,张磊,潘征,赵凌侠,孙小芬,郑金贵; RACE的研究及其在植物基因克隆上的应用 [J]; 复旦学报(自然科学版); 2002年06期
3陈渝萍,薛社普; 应用改进的SSP-抑制PCR技术扩增cDNA片段旁侧序列 [J]; 基础医学与临床; 1999年04期
4胡忠,曹军,庄东红; 耐盐性植物转基因工程的研究进展 [J]; 热带亚热带植物学报; 2006年02期
5邢桂春,张成岗,魏汉东,贺福初; 采用RACE技术获得全长人新基因MAGE-D1 [J]; 中国生物化学与分子生物学报; 2001年02期
6高峰,高强,岳桂东,杨爱芳,张举仁; 小盐芥(Thellungiella salsuginea)CBF1基因的克隆 [J]; 山东大学学报(理学版); 2005年05期
7李金耀,马纪,蔡伦,王艳,张富春; 灰绿藜和碱蒿NHX基因3'-UTR序列的差异性分析 [J]; 植物生理学通讯; 2005年02期
 西文参考文献找到 10 条
 
1BRESSAN RAY A,,ZHANG CHANGQING,ZHANG HUI,et al; Learning fromthe Arabidopsis experience The next gene search paradigm[J]. [M];Plant Physiolo-gy; 2001年
2TAJI TERUAKI,SEKI MMOTOAKI,SATOU MASAKAZU,et al; Comparative ge-nomics in salt tolerance between Arabidopsis and Arabidopsis-related halophytesalt cress using Arabidopsis microarray[J] [M];Plant Physiology; 2004年
3APSE MP; Salt tolerance conferred by overexpression of a vacuolar Na+/H+an-tiport in Arabidopsis[J] [M];Science; 1999年
4REN ZHONG-HAI,GAO JI-PING,LI LE-GONG,et al; A rice quantitative traitlocus for salt tolerance encodes a sodium transporter[J] [M];Nature Genetics; 2005年
5Reddy M K, Nair S, Singh B N, et al; Cloning and expression of a nuclear encoded plastid specific 33 kDa ribonucleoprotein gene (33RNP) from pea that is light stimulated [M];Gene; 2001年
6Quintero FJ, Blatt MR, Pardo JM; Functional conservation between yeast and plant endosomal Na+ /H+ antiporters [M];FEBS Lett; 2000年
7Schmidt W M, Muller M W; Controlled ribonucleotide tailing of cDNA ends (CRTC) by terminal deoxynucleiotidyl trasnferase: A new approach in PCR-mediated analysis of mRNA sequences [M];Nucleic Acids Res; 1996年
8Gaxiola RA, Rao R, Sherman A et al; The Arabidopsis thaliana proton transporters, AtNhx1 and Avp1, can function in cation detoxification in yeast [M];Proc Natl Acad Sci USA; 1999年
9Apse MP, Aharon GS, Snedden WA et al; Salt tolerance conferred by overexpression of a vacuolar Na+ /H+ antiport in Arabidopsis [M];Science; 1999年
10Gevaudant F, Petel G, Guilliot A; Differential expression of four members of the H+-ATPase gene family during dormancy of vegetative buds of peach trees [M];Planta; 2001年
 【相似文献】 
 中国期刊全文数据库
 
1辛明,贺答汉; 人工固沙区针毛收获蚁(Messor aciculatus F.Smith)自然蚁巢种子储藏格局研究 [J];宁夏农学院学报; 2003年01期; 10-14
2王磊,崔乃然; 新疆野生观赏植物 [J];新疆农业大学学报; 1984年01期; 57-65
3贺达汉,辛明,长有德,李秋霞; 宁夏荒漠草原针毛收获蚁对植物种子的觅食作用 [J];生态学报; 2003年06期; 37-44
4王怡; 柴达木盆地荒漠地区生态位研究初报 [J];四川林业科技; 2005年05期; 93-95
5王彦芹,罗晓霞,刘陈,李霞,陈良,杨剑; 改进的CTAB法提取盐生植物基因组DNA [J];塔里木大学学报; 2007年02期; 66-68
6赵震宇; 新疆沙生植物的寄生菌 [J];新疆农业大学学报; 1980年03期; 63-73
7张鸿铎; 沙生植物巧繁的本领 [J];新疆林业; 1983年03期; 48
8裘同才; 探索利用植物净化~(90)Sr、~(137)Cs污染的土壤 [J];农业环境科学学报; 1988年05期; 16-19
9邓彦斌,姜彦成,刘健; 新疆10种藜科植物叶片和同化枝的旱生和盐生结构的研究 [J];植物生态学报; 1998年02期; 69-75
10陈钧，罗文英，杨生明; 盘羊在甘肃的地理分布 [J];野生动物; 1994年03期; 21
 中国优秀硕士学位论文全文数据库
 
1张毅; 三种荒漠植物在不同水分条件下的生存适应研究 [D];新疆大学; 2004年
2高瑞如; 四种藜科植物生物生态学特性初步研究 [D];新疆大学; 2004年
3张振琦; 内蒙古温带典型草原八种植物的资源分配策略及其对氮素水平的响应 [D];内蒙古大学; 2006年
4蒋霞; 西北干旱区多种植物地理分布与气候的相关性及其可能潜在分布预测 [D];中国科学院研究生院（植物研究所）; 2003年
5孙小五; 几种被子植物幼苗的结构、分化与演化 [D];中国农业大学; 2005年
6孟玉萍; 放归普氏野马食源植物、食性选择及采食对策的研究 [D];北京林业大学; 2007年
7李满良; 北京湿地主要植物群落对水因子的响应 [D];首都师范大学; 2006年
8于海芹; 松嫩草地七种藜科植物中几类生物活性成分研究及常规营养成分的积累动态 [D];东北师范大学; 2005年
9李昌龙; 民勤连古城自然保护区物种多样性与群落稳定性研究 [D];西北师范大学; 2005年
 中国重要会议论文全文数据库
 
1杨维康,乔建芳,姚军,高行宜; 新疆木垒鹅喉羚(Gazella subgutturosa sairensis)的采食地选择 [A];中国动物学会兽类学分会第六届会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集 [C]; 2004年
2高行宜,OliverCombreau,乔建芳,杨维康,MarkLawence,姚军,MahamedSaleh,许可芬; 波斑鸨、大鸨繁殖生态研究 [A];野生动物生态与管理学术讨论会论文摘要集 [C]; 2001年
 中国重要报纸全文数据库
 
1记者唐开文; 植物家底摸清了 [N];北京日报; 2002年