《新疆农业科学》2008年03期 加入收藏    获取最新 
 均匀设计优化喜盐鸢尾ISSR-PCR体系
 杜欣;董玉芝;陈虹
   以新疆野生喜盐鸢尾DNA为模板,采用U20(54)和U12(34)均匀设计表,通过4因素5水平和4因素3水平两轮均匀优化试验,对影响ISSR-PCR扩增结果的一些因素如Mg2+、dNTP、引物以及TaqDNA聚合酶浓度以及循环数和退火温度等进行优化筛选,建立了适合喜盐鸢尾的最佳ISSR-PCR反应体系:在25μL反应体系中,包括2.5μL 10×PCRBuffer,2.0mmol/L Mg2+,250μmol/L dNTP,0.1μmol/L引物,0.5UTaqDNA聚合酶,40 ng模板DNA。扩增程序为:94℃预变性3 min;接着进行40个循环:94℃变性45 s,52.1℃退火30 s,72℃延伸1.5 min;循环结束后,72℃延伸5 min,4℃保存。
【作者单位】:新疆农业大学林学院;新疆农业大学林学院;新疆农业大学林学院 乌鲁木齐830052;乌鲁木齐830052;新疆农业大学农业生物技术重点实验室/新疆大学农学院;乌鲁木齐830052;乌鲁木齐830052
【关键词】:喜盐鸢尾;均匀设计;ISSR-PCR
【基金】:国家环保总局项目[二-(一)-3-2号]
【分类号】:S682.19
【DOI】:CNKI:SUN:XJNX.0.2008-03-004
【正文快照】:
  我国具有丰富的鸢尾属(Iris.L.)植物种质资源,关于鸢尾属植物,从种子的休眠与萌发[1~2],开花结实特性[3],抗性生理[4],组织培养[5]等方面都有诸多报道,所研究的鸢尾属植物也有较多种,例如德国鸢尾(I.germanica)、黄菖蒲(I.pseudacaorus)、蝴蝶花(I.japonica Thunb)、马蔺(I.lac
 
 推荐 CAJ下载           PDF下载
 CAJViewer7.0阅读器支持所有CNKI文件格式,AdobeReader仅支持PDF格式
 Optimization of ISSR-PCR System of Iris halophila by Uniform Design
 DU Xin1;DONG Yu-zhi1;2;CHEN Hong1 (1.College of Forestry;Xinjiang Agricultural University;Urumqi 830052;China;2.Key Laboratory of Agricultaral Biological Technique of Xinjiang Agricultural University;College of Agronomy;Urumqi 830052;China)
  U20(54)and U12(34)uniform design diagrams were amplified to optimize the influencing factors of ISSR-PCR system,including Mg2+,dNTP,primer and TaqDNA polymerase.The suitable ISSR-PCR system and ISSR-PCR procedure for Iris halophila of Xinjiang were established as follows:each 25 μL ISSR-PCR amplification reaction solution was consisted of 2.5 μL PCRBuffer,2.0 mmol/L Mg2+,250 μmol/L dNTP,0.1 μmol/L primer,0.5U TaqDNA polymerase and 40ng template DNA.The suitable ISSR-PCR procedure was 1 cycle of denaturing for 3 min at 94℃,40 cycles of denaturing for 45 s at 94℃,annealing for 30 s at 52.1℃,extending for 1.5 min at 72℃ and the last cycle of extending for 5 min at 72℃.
【Keyword】:Iris Halophila;uniform design;ISSR-PCR
 【参考文献】 共(13)篇 
 中国期刊全文数据库找到 10 条
 
1张萍,董玉芝,魏岩,胡成志; 利用ISSR标记对新疆梭梭遗传多样性的研究 [J]; 西北植物学报; 2006年07期
2穆丹,王玲,卓丽环; 长白鸢尾开花的生物学特性及花粉生活力 [J]; 东北林业大学学报; 2006年04期
3穆立蔷,刘赢男,冯富娟,杨国亭; 紫椴ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J]; 林业科学; 2006年06期
4程中平,陈志伟,胡春根,邓秀新,罗正荣; 利用分子标记对桃属植物种的识别及其亲缘关系分析 [J]; 华中农业大学学报; 2001年03期
5胡薇,黄儒珠,孙端,饶春荣,李锦凤; 均匀设计优化建兰ISSR-PCR体系 [J]; 生命科学研究; 2007年01期
6张金政,石雷,王平,孙国峰; 有髯鸢尾“常春黄”的组织培养 [J]; 植物生理学通讯; 2004年02期
7张敏,黄苏珍,仇硕,孙延东; 鸢尾属植物遗传多样性的RAPD和ISSR分析 [J]; 植物资源与环境学报; 2007年02期
8黄苏珍,韩玉林,谢明云,郭维明,顾姻; 中国鸢尾属观赏植物资源的研究与利用 [J]; 中国野生植物资源; 2003年01期
9孙晋科,罗淑萍,李疆,曾斌; 巴旦杏RAPD-PCR反应体系的正交优化 [J]; 新疆农业科学; 2007年05期
10赵杨,陈晓阳,李桐森,胡冬南; 胡枝子属ISSR-PCR反应体系的建立与优化 [J]; 西南林学院学报; 2006年02期
 西文参考文献找到 1 条
 
1WOLFE A D, XIANG Q Y, KEPHART S R; Assessing hybridization in natural population of Penstemon (Scrophulariaceae) using hypervariable intersimple sequence repeat ( ISSR)bands [M];Molecular Ecology; 1998年
 【共引文献】 共(80)篇 
 中国优秀硕士学位论文全文数据库找到 10 条
 
1王珂; 桃属不同种花芽分化特性及遗传倾向的研究 [D];河南农业大学; 2005年
2王富荣; 桃野生种质资源亲缘关系的AFLP分析 [D];南京农业大学; 2006年
3高丽; 湖北野生春兰资源的遗传多样性研究 [D];中国科学院研究生院(武汉植物园); 2006年
4郭朝铭; 龙舌兰属麻类种质资源遗传多样性的AFLP分析与抗病性鉴定 [D];华南热带农业大学; 2006年
5王志刚; 油桃(Prunus persica var. nectarina)肉色性状分子标记的研究 [D];西北农林科技大学; 2006年
6谭卫萍; 龙眼种质资源遗传多样性的分子评价及分类研究 [D];湖南农业大学; 2002年
7陈妙金; 桃新品系遗传鉴别及七个品种果实采后主要生理与品质变化比较 [D];浙江大学; 2007年
8王洪梅; 红松种子园优良无性系遗传结构研究 [D];东北林业大学; 2006年
9曾柏全; 冰糖脐橙的主要性状及遗传分析研究 [D];湖南农业大学; 2003年
10石丽雪; 苹果矮化基因Md连锁标记的筛选及染色体定位 [D];山东农业大学; 2006年
 中国博士学位论文全文数据库找到 4 条
 
1杨艳秋; 多重PCR及微卫星标记技术用于深部病原真菌感染的快速诊断 [D];吉林大学; 2007年
2蔡宇良; 野生樱桃种质资源的遗传分析及其栽培品种的DNA指纹鉴定 [D];西北大学; 2006年
3俞明亮; 桃性状遗传评价和分子标记技术研究 [D];南京农业大学; 2004年
4赵长增; DNA分子标记技术在甜瓜西瓜杂种优势利用和抗病育种中的应用 [D];华南热带农业大学; 2003年
 中国期刊全文数据库找到 10 条
 
1程中平; 硬肉桃种质资源分子生物学多态分析 [J]; 安徽农业大学学报; 2003年02期
2李靖,尚霄丽,张建鹏,莫红,王政,王珂; 桃分子标记研究进展 [J]; 北方园艺; 2005年06期
3程中平,陈志伟,胡春根,邓秀新; 利用RAPD技术对蟠桃品种的分析 [J]; 河北农业大学学报; 2003年01期
4邢建宏,陈存及,张国防,彭东辉,刘宝,陈碧华; 樟树ISSR-PCR反应体系优化研究 [J]; 福建林业科技; 2006年03期
5杨艳秋,贺丹,王爽,郭亮,张宇,横山耕治,王丽; 正交法用于真菌微卫星PCR体系优化 [J]; 吉林大学学报(医学版); 2006年06期
6俞明亮,马瑞娟,许建兰,沈志军,章镇; 桃种间亲缘关系的SSR鉴定 [J]; 果树学报; 2004年02期
7许玉凤,王文元,孙晓梅,李楠,王雷; 鸢尾属植物的研究概况 [J]; 安徽农业科学; 2006年24期
8赵长增,陆璐; RAPD标记在园艺作物品种鉴定中的应用 [J]; 甘肃农业大学学报; 2003年03期
9李文表,周先叶,李勇,张寿洲; 棕榈ISSR反应条件的筛选与优化 [J]; 广西植物; 2006年02期
10郑红军,孙明远,宋福林,魏海蓉,李勃; 核果类果树分子标记研究进展 [J]; 山东农业科学; 2006年04期
 中国重要会议论文全文数据库找到 3 条
 
1朱坚,林伯德,郑昭,熊芳,应正河,卢启泉,谢宝贵; 香菇ISSR-PCR扩增条件的优化 [A];首届全国食用菌中青年专家学术交流会论文集 [C]; 2006年
2杨红花,冯宝春,陈学森; DNA分子标记在核果类果树上的研究进展 [A];中国园艺学会第五届青年学术讨论会论文集 [C]; 2002年
3王俊,高亦珂; 天山鸢尾、准噶尔鸢尾种子的休眠与萌发 [A];2007年中国园艺学会观赏园艺专业委员会年会论文集 [C]; 2007年
 【二级参考文献】 共(86)篇 
 中国期刊全文数据库找到 10 条
 
1张鸿雁,王百田,邹丽玲; 半干旱黄土区保水剂使用浓度的研究 [J]; 北京林业大学学报; 2003年02期
2杨传平,潘华,魏志刚,姜静; 白桦ISSR-PCR反应体系的优化 [J]; 东北林业大学学报; 2005年06期
3张立荣,刘大群,徐大庆,杨文香,孔俊英; 小麦ISSR分析初探 [J]; 河北农业大学学报; 2004年01期
4胡薇,孙端,潘晓华,黄儒珠; 建兰DNA的快速提取 [J]; 福建师范大学学报(自然科学版); 2004年01期
5王军,贺普超; 山葡萄基因组DNA提取及RAPD鉴定 [J]; 果树科学; 2000年02期
6张吉宇,袁庆华,张文淑,鲁挺; 多花胡枝子基因组DNA提取与RAPD反应体系优化 [J]; 草地学报; 2004年03期
7谢运海,夏德安,姜静,林萍; 利用正交设计优化水曲柳ISSR-PCR反应体系 [J]; 分子植物育种; 2005年03期
8乔玉山,章镇,房经贵,沈志军,赵密珍; 李种质资源ISSR反应体系的建立 [J]; 果树学报; 2003年04期
9何桥,梁国鲁,谢江辉; 莲雾ISSR反应体系的优化与应用 [J]; 果树学报; 2005年02期
10王彦华,侯喜林,徐明宇; 正交设计优化不结球白菜ISSR反应体系研究 [J]; 西北植物学报; 2004年05期
 西文参考文献找到 10 条
 
1Mckersie B D,,Leshem Y Y; Stress and stress coping in cultivatedplants[D] [M];; 1994年
2Sea Gupta A,Webb R P,Holaday A S,et al; Overexpression ofsuperoxide dismutssc protects plants from oxidarivc stress Induction ofascorbate pcroxidase in superoxidc dismutase ovcxpressing plants[J]. [M];Plant Physiol; 1993年
3Dhindsa Rs,Matowe W; Drought tolerance lipid peroxidationn[J] [M];J.Exp.Bot; 1981年
4Wang B S,Zhao s q; The effect of drought on the mem brane-lipid pcroxidation and protective cnzymes in wheatsccdlings[J]. [M];Jouroal ofShandong Norma.Univcrsity(natural Science); 1987年
5Dong Y H,Shi J P,Li Gm,et al; The effcct of ABA or 6-BA onCO2assimilation in wheat seedlings under water stress[J] [M];Acta Agronom-ica Sinica; 1997年
6Smirnoff N; The role of active oxygen in theresponse of plants towater deficit and desiccation[J] [M];New Phytol; 1993年
7Zhuravlev Y N,Kozyrenko M M,Artyukova E V,et al; Fingerprinting genomes of the far eastern species of the genusIrisL byRAPD-PCR[J] [M];Russian Journal of Genetics; 1998年
8Rodionenko G I; The GenusIrisL.[M] [M];; 1987年
9Bruford M W; Microsatellites and their application to conservation genetics [M];Molecular genetic approaches in conservation; 1996年
10ROGERS S O, BENDICH A J; Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues [M];Plant Molecular Biology; 1985年
 【相似文献】 
 中国期刊全文数据库
 
1胡薇,黄儒珠,孙端,饶春荣,李锦凤; 均匀设计优化建兰ISSR-PCR体系 [J];生命科学研究; 2007年01期; 60-65
2刘彤,魏鹏,赵新俊,张元杭,魏凌基; 应用均匀设计优化香梨脱毒苗生根培养基 [J];果树学报; 2006年04期; 149-151