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《计算物理》 2013年01期
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基于JASMIN三维势场快速多极子算法的并行实现

左风丽  刘旭  张宝印  胡晓燕  
【摘要】:在JASMIN上,基于进程/线程两级并行实现策略,研制三维Laplace核函数FMM(fast multipole method)的解法器模块"JASMIN-3DLapFMM".该解法器已成功应用于三维静电场远场势的并行计算.固定单机问题规模,在上万个处理器核上运行百亿粒子的大规模问题,获得进程级几乎线性的并行可扩展性.固定总的问题规模和1 024个进程,4个线程时,获得大约3倍的加速.
【作者单位】北京应用物理与计算数学研究所;
【关键词】JASMIN 三维Laplace核函数 JASMIN-DLapFMM 并行可扩展性
【基金】:国家自然科学基金重点项目(61033009);国家自然科学基金(60873005) 国家重点基础研究发展计划(2011CB309702) 国家高技术研究发展计划(2012AA01A309,2010AA012303)资助项目
【分类号】:O411
【正文快照】:
0引言在恒星动力学,生物学,流体力学和分子动力学等应用领域中均需估计粒子间的相互作用势.如,静电场势Φ(xj)=ΣNi=1i≠jqi‖xj-xi‖,(1)其中,Φ(xj)为点电荷xi,(i≠j,i=1,2,…,N)对点电荷xj的作用势,N为电荷粒子数,x1,x2,…,xN∈R3为电荷粒子在空间中的位置,其携带的电荷量

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