| | | | | 支原体基因组中ori和ter位点的松弛平衡 | | | 郑鑫;刘树林 | | | 支原体(Mycoplasma)是一类没有细胞壁的特殊细菌,其基因组较小,公认支原体经历了较大规模的消减进化.在消减进化中基因组复制起点(ori)和终点(ter)之间的平衡很可能被破坏.由于支原体基因组中的复制起点和终点用常规方法如GCSkew等不易确定,因此本研究采用Z曲线检加以测,并据此计算出支原体基因组中复制起点和终点的距离.我们发现,支原体基因组多数处于不平衡的状态.这可能是由于支原体的特殊生存环境所致.在其生存环境中,竞争压力较小,基因组无需快速复制以争夺生存资源,从而在长期进化后复制起点和终点之间失去了平衡. 【作者单位】:北京大学医学部病原生物学系 北京100083 【关键词】:Z曲线;支原体;基因组平衡;复制起点和终点;进化 【基金】:国家自然科学基金(批准号:30370774);北京大学医学部985经费;加拿大Natural Sciences and Engineering Research Council(216912-00)资助 【分类号】:Q93 【DOI】:CNKI:SUN:JCXK.0.2007-06-010 【正文快照】: 细菌基因组复制起于复制起点(ori),两个复制叉向两侧延伸并结束于复制终点(ter).在此过程中,复制起点和终点位于基因组的对称位点以及两个复制叉的同步延伸是双向复制同时结束的重要条件.如果基因组发生重排例如大片段的反转,那么复制起点和终点的相对位置将随之改变,双向复制 | | |
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