| | | | | 日本七鳃鳗(Lampetra japonica)肝脏ESTs分析与比较转录组研究 | | | 朱丽娜;戴雅丽;马飞;李庆伟 | | | 以日本七鳃鳗(Lampetra japonica)肝脏为材料构建cDNA文库,在文库中随机挑选克隆子进行测序共得到10077条有效ESTs(expressed sequencetags)序列.ESTs序列分析显示,8515条ESTs拼成648条片段重叠群,共得到2210条转录本,其中47.06%的转录本预测为全长序列;利用BLAST程序在GenBank数据库中进行同源性搜索发现2053条转录本有同源序列匹配,占总转录本的92.9%.更进一步对这些基因产物进行GeneOntology注释,结果发现,在日本七鳃鳗肝脏中与有颌类免疫、凝血和代谢相关的基因大量表达,并预测了8个新基因.通过对日本七鳃鳗与底鳉(Fundulus heteroclitus)、鼠(Mus musculus)、牛(Bos taurus)和人(Homo sapiens)肝脏转录组的比较分析,发现日本七鳃鳗肝脏中比其他物种优势表达的是甲壳质酶和多糖代谢等相关的基因,这些基因可能在日本七鳃鳗免疫中发挥重要作用.此外,也利用TargetScan软件对日本七鳃鳗肝脏转录组中3'UTR区进行microRNA靶标识别,结果发现了与人类癌症基因调控同源的microRNA靶标,这为研究人类癌症提供了有益的线索.上述结果将为七鳃鳗功能基因和蛋白组学的研究以及脊椎动物的基因组进化提供重要的理论基础.
【作者单位】：辽宁师范大学生命科学学院 大连116029(朱丽娜;马飞;李庆伟);安徽农业大学生命科学学院 合肥230036(戴雅丽)
【关键词】：日本七鳃鳗(Lampetra japonica);肝脏;EST;转录组比较
【基金】：国家高技术研究发展计划(863计划)项目(批准号:2007AA09Z428);国家自然科学基金项目(批准号:60575005);教育部科学技术研究重点项目(批准号:206032);大连市科技计划项目(批准号:2006E11SF068);大连市优秀青年科技人才基金项目资助
【分类号】：Q953
【DOI】：CNKI:SUN:JCXK.0.2007-06-002
【正文快照】：
日本七鳃鳗(Lampetra japonica)属圆口纲,七鳃鳗目,七鳃鳗科,七鳃鳗属,是最原始的脊椎动物类群,是联系无脊椎动物与脊椎动物之间的重要桥梁.最近的考古发现,现代的七鳃鳗与3.6亿年前的祖先没有太大的变化,是名副其实的“活化石”[1],因此七鳃鳗是研究脊椎动物起源和进化的首选材料.目前,对日本七鳃鳗的研究大多局限于形态结构、生态分布等方面[2],而关于基因组学和蛋白组学方面的研究则较少报道.国内外现已有海七鳃鳗肠[3]以及日本七鳃鳗口腔腺[4]转录组的研究报道,但尚未见最大的消化腺—肝脏的相关基因的报道.本文对日本七鳃鳗肝脏转录组… | | |  推荐 CAJ下载  PDF下载 | | | CAJViewer7.0阅读器支持所有CNKI文件格式，AdobeReader仅支持PDF格式 |
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