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《中国水产科学》 2007年03期
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合浦珠母贝遗传连锁图谱的构建

喻达辉  王小玉  黄桂菊  郭奕惠  龚世园  王爱民  
【摘要】:用AFLP标记构建了印度合浦珠母贝(Pinctada fucata)全同胞家系的遗传图谱。用经过筛选的36对引物组合对父母本和62个子代个体进行遗传分析,共得到1 547个标记,包括581个1∶1分离标记。母本分离标记294个,其中178个符合1∶1孟德尔分离规律;父本分离标记287个,其中182个符合1∶1孟德尔分离规律。雌性框架图包括33个遗传标记,分布在14个连锁群中,标记间平均间隔24.3 cM,有2个3联体,11个连锁对,图谱总长度为488.5 cM。雄性框架图包括53个遗传标记,分布在19个连锁群中,标记间平均间隔30.5 cM,有4个3联体,10个连锁对,图谱总长度为1 035.5 cM。雌雄两个框架图中AFLP标记的分布都较均匀。雌雄基因组估算长度分别为1 168.4 cM和2 037.1 cM,图谱覆盖率分别为41.8%和50.8%。本研究为进一步构建高密度遗传连锁图谱及QTL定位分析奠定了基础。
【作者单位】中国水产科学研究院南海水产研究所 中国水产科学研究院南海水产研究所 中国水产科学研究院南海水产研究所 中国水产科学研究院南海水产研究所 华中农业大学水产学院 海南大学海洋学院
【关键词】合浦珠母贝 遗传连锁图谱 AFLP标记
【基金】:国家863基础研究计划(2002AA603022) 广东省科技计划(2002B2150101) 广东省自然科学基金(037148)
【分类号】:S917.4
【正文快照】:
近年来,随着各种分子标记技术的开发,遗传连锁图谱构建逐渐成为遗传学领域的研究热点。遗传连锁图谱为数量性状位点(QTL)定位、功能基因克隆等提供了技术支持,是遗传改良与分子标记辅助选育技术(MAS)的重要基础,也是研究基因组结构与进化的重要工具。目前构建遗传连锁图谱常

【引证文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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2 姚韩韩;林志华;董迎辉;沈和定;;海洋经济贝类遗传图谱的相关研究进展[J];水产科学;2010年03期
3 卢建峰;白俊杰;李胜杰;李镕;;大口黑鲈选育群体遗传多样性的AFLP分析[J];淡水渔业;2010年03期
4 李小宁;张殿昌;朱彩艳;苏天凤;江世贵;;合浦珠母贝微卫星DNA标记分离与分析[J];福建水产;2009年01期
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中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 王爱民;马氏珠母贝生长相关杂种优势和EST序列分析[D];上海海洋大学;2011年
2 刘金;转Bar基因抗除草剂稻谷对小鼠的安全性评价[D];湖南师范大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 徐亘博;半滑舌鳎等九种海水鱼微卫星分子标记的开发和应用[D];中国海洋大学;2010年
2 朱东丽;文蛤(Meretrix meretrix)不同壳色花纹品系的分子标记及DNA甲基化分析[D];中国海洋大学;2011年
3 刘翠;史氏鲟微卫星克隆及其性别相关AFLP标记的筛选[D];哈尔滨师范大学;2011年
4 郭华阳;合浦珠母贝遗传选育及两种免疫基因研究[D];上海海洋大学;2011年
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7 陈金涛;华贵栉孔扇贝(Chlamys nobilis)不同壳色选育系的建立及其生长发育研究[D];广东海洋大学;2011年
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9 曲妮妮;合浦珠母贝微卫星DNA标记分离与遗传多样性研究[D];华中农业大学;2008年
10 熊小飞;斑节对虾群体种群结构与家系鉴定[D];华中农业大学;2008年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前5条
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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10 姚韩韩;林志华;董迎辉;沈和定;;海洋经济贝类遗传图谱的相关研究进展[J];水产科学;2010年03期
中国重要会议论文全文数据库 前3条
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 白洁;太平洋牡蛎分子标记的开发与应用研究[D];中国海洋大学;2010年
2 叶华;大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D];湖南农业大学;2010年
3 王丽鸳;基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D];中国农业科学院;2011年
4 李荣华;四种重要养殖贝类有效繁殖群体数量研究[D];中国海洋大学;2011年
5 王明玲;养殖皱纹盘鲍杂交种对土著群体遗传结构的影响及种间渐渗杂交的遗传分析[D];中国海洋大学;2011年
6 王爱民;马氏珠母贝生长相关杂种优势和EST序列分析[D];上海海洋大学;2011年
7 张秀杰;黄颡鱼微卫星标记的开发及其遗传连锁图谱的构建[D];华中农业大学;2010年
8 沈新莲;陆地棉纤维品质QTL的筛选、定位及其应用[D];南京农业大学;2004年
9 王忠卫;遗传标记在鱼类育种和生态研究中的应用[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2005年
10 黄福平;茶树遗传多样性分析与遗传图谱构建[D];浙江大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 尤卫艳;光皮桦分子遗传连锁图谱的构建[D];浙江农林大学;2009年
2 徐亘博;半滑舌鳎等九种海水鱼微卫星分子标记的开发和应用[D];中国海洋大学;2010年
3 刘婷婷;长梗黄精11个微卫星位点的筛选及跨种扩增[D];安徽师范大学;2010年
4 王宇;海湾扇贝近交衰退的遗传分子机理的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2011年
5 谢素霞;三个茶树防卫相关基因的克隆及鉴定[D];信阳师范学院;2011年
6 叶茂;日本蟳微卫星标记筛选及其群体遗传多样性的研究[D];浙江海洋学院;2011年
7 杨春勇;栽培石斛和白木香的遗传多样性分析[D];北京协和医学院;2011年
8 邹烈星;马氏珠母贝两个地理群杂交子代在不同养殖环境下的生长速度、贝壳强度及珍珠层颜色比较研究[D];海南大学;2011年
9 昭日格;应用RAPD技术进行白榆种群遗传多样性研究[D];内蒙古农业大学;2011年
10 王展林;重要经济海洋生物西施舌群体遗传学的研究[D];集美大学;2009年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 蔡海容,侯代荣;云南白药和白糖外敷治疗术后切口延期愈合13例[J];安徽中医临床杂志;2000年05期
2 孙秀俊;杨爱国;刘志鸿;周丽青;;2种壳色虾夷扇贝的形态学指标比较分析[J];安徽农业科学;2008年23期
3 唐建淮;简峰;;杂种优势原理新解[J];安徽农业科学;2008年28期
4 李金碧;龚世园;喻达辉;;温度和盐度对栉江珧耗氧率和排氨率的影响[J];安徽农业科学;2009年05期
5 李小宁;张殿昌;朱彩艳;苏天凤;江世贵;;合浦珠母贝微卫星DNA标记的分离与筛选[J];安徽农业科学;2009年15期
6 陈婵娟;窦红霞;许志强;丁淑燕;潘建林;葛家春;黄亚红;;江苏地区5个三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)种群的ISSR分析[J];安徽农业科学;2009年35期
7 葛长字;秦耿;彭小经;;河蚌滤水率对环境氨氮浓度的响应[J];安徽农业科学;2010年10期
8 邓陈茂;童银洪;符韶;;马氏珠母贝的研究进展[J];现代农业科技;2009年02期
9 吴俊,魏钦平,束怀瑞,徐凯,钟家煌;分子标记及其在果树种质资源研究中的应用(综述)[J];安徽农业大学学报;2002年02期
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中国重要会议论文全文数据库 前4条
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中国博士学位论文全文数据库 前10条
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9 淡瑞芳;用Real Time PCR和DGGE技术研究放牧藏系绵羊瘤胃微生物季节动态[D];甘肃农业大学;2006年
10 吕振明;栉孔扇贝和虾夷扇贝杂交过程中的细胞与分子遗传学分析[D];中国海洋大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 黄翠丽;扇贝裙边提取物抗动脉粥样硬化作用及其对血管平滑肌细胞增殖的影响[D];青岛大学;2001年
2 林静瑜;合浦珠母贝碱性磷酸酶的分离纯化和性质研究[D];厦门大学;2001年
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6 王伟;微卫星遗传标记在牙鲆群体遗传学和人工诱导雌核发育群体遗传变异分析中的应用[D];中国海洋大学;2005年
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10 王小玉;海水珍珠贝分子标记分析及遗传图谱构建[D];华中农业大学;2006年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张滔;刘相全;孙国华;刘丽娟;孙振兴;;大竹蛏AFLP分子标记反应体系的建立与优化[J];安徽农业科学;2011年29期
2 孙玉彤;胡伟;时甬沁;申琪;;SSR分子标记在花生上的应用[J];现代农业科技;2011年11期
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6 赵晓霞;邓岳文;杜晓东;王庆恒;黄荣莲;卢婧;;利用微卫星标记分析马氏珠母贝4个养殖群体遗传结构[J];基因组学与应用生物学;2010年05期
7 朱佳杰;林勇;李莉萍;陈忠;罗永巨;蒋和生;甘西;;吉富罗非鱼AFLP反应体系的建立与优化[J];基因组学与应用生物学;2010年05期
8 油九菊;黄桂菊;范嗣刚;陈飞飞;郝博飞;曲妮妮;喻达辉;;合浦珠母贝微卫星标记的家系筛选[J];广东农业科学;2012年13期
9 杨帆;姚琪;刁英;郑兴飞;胡中立;舒新亚;;克氏原螯虾AFLP反应体系的建立[J];湖北农业科学;2009年11期
10 郭华阳;张殿昌;李恒德;陈明强;吴开畅;李有宁;江世贵;;合浦珠母贝幼体生长性状的遗传力及其相关性分析[J];湖北农业科学;2011年21期
中国博士学位论文全文数据库 前9条
1 叶华;大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D];湖南农业大学;2010年
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3 王丽鸳;基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D];中国农业科学院;2011年
4 彭薇;仿刺参(Apostichopus japonicus)微卫星标记的开发与应用[D];中国海洋大学;2011年
5 王爱民;马氏珠母贝生长相关杂种优势和EST序列分析[D];上海海洋大学;2011年
6 卢霞;分子标记应用于文蛤遗传评价、图谱构建及QTL筛选的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2012年
7 初冠囡;许氏平鲉(Sebastes schlegelii)微卫星标记筛选及遗传连锁图谱构建[D];中国海洋大学;2012年
8 李纪勤;栉孔扇贝(Chlamys farreri)EST-SNP的开发及其应用[D];中国海洋大学;2012年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 徐亘博;半滑舌鳎等九种海水鱼微卫星分子标记的开发和应用[D];中国海洋大学;2010年
2 王景博;缢蛏群体遗传学研究[D];中国海洋大学;2010年
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4 邵丽;留兰香种质材料的超低温保存及遗传变异分析[D];河南大学;2011年
5 黄晓雪;北京引种抗寒棕榈的抗寒性初步研究[D];北京林业大学;2011年
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7 王展林;重要经济海洋生物西施舌群体遗传学的研究[D];集美大学;2009年
8 武祥伟;借助远缘杂交构建大黄鱼微卫星标记连锁图谱[D];集美大学;2011年
9 朱东丽;文蛤(Meretrix meretrix)不同壳色花纹品系的分子标记及DNA甲基化分析[D];中国海洋大学;2011年
10 董徐辉;日本鬼鲉同工酶组织差异、基于Cytb,COII的系统发育分析及微卫星多态性标记筛选[D];宁波大学;2011年
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10 王爱民,石耀华,周志刚;马氏珠母贝不同地理种群内自繁和种群间杂交子一代形态性状参数及相关性分析[J];海洋水产研究;2004年03期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张晓芬,王晓武,娄平,张晓伟,王永清,原玉香,赵建军,孙日飞;利用大白菜DH群体构建AFLP遗传连锁图谱[J];园艺学报;2005年03期
2 徐志;梅丽宏;李志英;段霞瑜;周益林;;利用AFLP分子标记和无毒基因构建小麦白粉菌遗传连锁图谱[J];植物病理学报;2009年01期
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4 王竹林;刘曙东;刘惠远;何中虎;夏先春;陈新民;;‘百农64’ב京双16’小麦遗传连锁图谱构建[J];西北植物学报;2006年05期
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6 刘卫东;鲍相渤;宋文涛;周遵春;赫崇波;虞星炬;;虾夷扇贝遗传连锁图谱的初步构建[J];遗传;2009年06期
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
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3 张希;喻达辉;邢孔武;黄桂菊;;术前处理对合浦珠母贝插核效果的影响[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学会分会第十四次学会研讨会论文摘要汇编[C];2009年
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8 陈美霞;祁建民;危成林;谢增荣;林培清;兰涛;;红麻5个质量性状在遗传连锁图谱中的初步定位研究[A];北方遗传资源的保护与利用研讨会论文汇编[C];2010年
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4 浙江国信证券研究部 黄宁;生物技术 二十一世纪投资新热点[N];金融时报;2000年
5 记者 左朝胜;我国肝豆状核变性研究获突破性进展[N];科技日报;2001年
6 王书磊 胡光安;生物育种突破发展瓶颈[N];中国渔业报;2010年
7 记者 郑北鹰;我林木遗传图谱构建取得重要进展[N];光明日报;2001年
8 东辰;Rutgers大学的科学家将绘制出复杂疾病的DNA连锁图[N];中国高新技术产业导报;2001年
9 本报记者 王威克 赵紫霞;我国水产生物研究进入基因组时代[N];中国渔业报;2009年
10 林益琳;古珠池焕发勃勃生机[N];北海日报;2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张立楠;鲢遗传连锁图谱的构建及精子竞争对性别间重组率差异的影响[D];中国海洋大学;2010年
2 宋文涛;半滑舌鳎、牙鲆微卫星遗传连锁图谱的构建[D];上海海洋大学;2012年
3 苗贵东;半滑舌鳎微卫星标记开发、应用及遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2010年
4 陈丽梅;刺参(Apostichopus japonicus)的遗传学研究[D];中国海洋大学;2008年
5 张秀杰;黄颡鱼微卫星标记的开发及其遗传连锁图谱的构建[D];华中农业大学;2010年
6 初冠囡;许氏平鲉(Sebastes schlegelii)微卫星标记筛选及遗传连锁图谱构建[D];中国海洋大学;2012年
7 段永红;高梁甲基化和微卫星标记遗传连锁图谱的构建[D];山西大学;2009年
8 周玉娟;合浦珠母贝TGFβ信号通路相关基因的克隆及功能研究[D];清华大学;2010年
9 叶华;大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D];湖南农业大学;2010年
10 李莉;长牡蛎的分子标记筛选和遗传图谱构建[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2003年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 田倩;合浦珠母贝肉抗氧化肽活性和应用研究[D];中国海洋大学;2012年
2 朱方捷;合浦珠母贝贝壳基质大分子对含镁方解石镁含量的调控[D];清华大学;2010年
3 郭华阳;合浦珠母贝遗传选育及两种免疫基因研究[D];上海海洋大学;2011年
4 杨慧英;合浦珠母贝寄生多毛类流行病学调查及生活史研究[D];上海海洋大学;2012年
5 赵红燕;石斛分子遗传连锁图谱的构建[D];杭州师范大学;2011年
6 郝博飞;合浦珠母贝家系选育与大珠母贝苗养殖试验研究[D];上海海洋大学;2012年
7 刘伟;香菇分子遗传连锁图谱的构建[D];华中农业大学;2011年
8 陈飞飞;合浦珠母贝群体选育及鳃结构研究[D];上海海洋大学;2012年
9 高峰涛;牙鲆微卫星遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2012年
10 徐艳虹;皱纹盘鲍遗传多样性的研究及遗传图谱构建[D];中国海洋大学;2007年
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