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《中国农业科学》 2011年13期
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人参单一基因微卫星标记的分析

吴天姝  梁翠  李宏博  朴钟云  
【摘要】:【目的】利用人参单一基因(unigene)序列,研究人参转录区SSR的分布特征;开发单一基因微卫星(UGMS)标记,并比较人参UGMS与基因组SSR标记(G-SSR)在分布频率、多态性及通用性等方面的不同,为人参等五加科药用植物的鉴定、遗传图谱的建立等研究奠定基础。【方法】利用NCBI公共数据库的7 649条人参EST序列,筛选出含有SSR的单一基因序列,并分析人参SSR的分布;根据这些序列以及包含SSR的人参基因组序列合成的引物扩增人参不同品种和其它五加科植物。【结果】检测到总长度为2.72 Mb的4 869个单一基因。其中,488个单一基因分布有724个SSR,占人参EST的10.02%,SSR的分布密度为3.75 Kb。一至三核苷酸重复分布频率分别为29.28%、48.06%和19.06%。非编码区和编码区重复序列分别以AT/TA和AAG/CTT为主。在合成的100对UGMS和44对G-SSR引物中,分别有86和44对能够扩增出人参的PCR产物,其多态率分别为42.0%和43.2%。人参UGMS对五加科西洋参、三七和刺五加植物的通用性分别为100%、87.2%和75.6%;G-SSR分别为95.5%、72.7%和40.9%。【结论】人参基因中SSR发生频率较高,并以二核苷酸重复为主。不同基因区域内的SSR分布具有非随机性。UGMS在揭示种内多态性方面不及G-SSR,但具有较高的种间通用性。
【作者单位】沈阳农业大学园艺学院;
【基金】:国家自然科学基金(30771468)
【分类号】:S567.51

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前7条
1 金基强;李素芳;龚晓春;卢美贞;姚艳玲;忻雅;崔海瑞;;茶树EST资源中SSR的信息分析[J];科技通报;2006年04期
2 杨成君;王军;穆立蔷;李绍臣;刘关君;胡长群;;人参EST-SSR标记的建立[J];农业生物技术学报;2008年01期
3 魏利斌;张海洋;郑永战;郭旺珍;张天真;;芝麻EST-SSR标记的开发和初步研究[J];作物学报;2008年12期
4 许静;王伟;柴宝峰;梁爱华;;八肋游仆虫一种富含三核苷酸重复序列的新基因GARP的克隆与序列分析[J];遗传;2007年01期
5 蔺宇;徐静静;王晓鸣;武小菲;李彦舫;朱振东;;适用于大豆疫霉菌遗传分析的新EST-SSR标记[J];中国农业科学;2008年08期
6 潘海涛;汪俊君;王盈盈;齐照良;李斯深;;小麦EST-SSR标记的开发和遗传作图[J];中国农业科学;2010年03期
7 杨成君;王军;;人参EST资源的SSR信息分析[J];植物生理学通讯;2008年01期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李汝玉;李群;张文兰;张晗;宋国安;王东建;;利用SSR标记进行小麦品种鉴定和新品种保护研究[J];山东农业科学;2007年06期
2 赵传志;李爱芹;李长生;刘波;夏晗;王兴军;贾文斌;;山羊EST资源的SSR分析[J];山东农业科学;2009年06期
3 张延明;曲敏;闫玉清;徐香玲;李集临;;EST-SSRs在小麦研究中的应用[J];安徽农学通报;2006年13期
4 畅喜云,陈志国,窦全文,刘瑞娟;小麦抗条锈病分子标记辅助育种研究进展[J];安徽农业科学;2005年09期
5 郭大龙;;植物微卫星引物开发方法[J];安徽农业科学;2007年18期
6 李建明;李洪杰;柴守诚;李秀全;李立会;;普通小麦Genomic-SSR和EST-SSR分子标记遗传差异[J];安徽农业科学;2007年26期
7 王念;何威;王文君;刘迎节;;AFLP分子标记在泡桐遗传育种中的应用与前景[J];安徽农业科学;2008年01期
8 赵永亮;傅体华;范巧佳;任正隆;;野生天麻·栽培天麻的RAPD和AFLP标记遗传多态性分析[J];安徽农业科学;2008年17期
9 郑伟;高大海;王留阳;;植物的杂交起源及研究进展[J];安徽农业科学;2009年22期
10 贾小平;王天宇;黎裕;宋燕春;石云素;;微卫星开发技术研究进展[J];安徽农业科学;2009年24期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 于红;牡蛎良种选育的遗传学基础研究[D];中国海洋大学;2010年
2 于海洋;牙鲆微卫星标记的筛选和美洲牡蛎抗病相关基因SNP的初步分析[D];中国海洋大学;2010年
3 白洁;太平洋牡蛎分子标记的开发与应用研究[D];中国海洋大学;2010年
4 黄明;分子标记与水稻遗传多样性及杂种优势的相关性研究[D];湖南农业大学;2010年
5 田清震;中国野生大豆与栽培大豆AFLP指纹分析及生态群体遗传关系研究[D];南京农业大学;2000年
6 林红;远缘杂交法结合RAPD技术对鲢、团头鲂遗传图谱的构建[D];南京农业大学;2000年
7 陈庆山;大豆灰斑病种质资源遗传多样性的RAPD和SSR分析[D];东北农业大学;2001年
8 杨俊品;玉米分子遗传图谱构建及数量性状基因定位[D];四川农业大学;2001年
9 马瑞燕;空心莲子草天敌——莲草直胸跳甲引进中国后的生态适应性研究[D];中国农业科学院;2001年
10 黎裕;玉米弯孢菌叶斑病抗性及其它农艺性状的QTL分析[D];中国农业科学院;2001年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 刘星吟,毛永真,陈建欢,李甘霖,金立培;大型纤毛虫总RNA的提取方法[J];动物学杂志;2004年05期
2 梁慧玲,梁月荣;植物分子标记技术原理及其在茶树育种中的应用[J];茶叶;2003年04期
3 王丽鸳,成浩,周健;茶树DNA分子标记及基因工程研究进展[J];茶叶科学;2004年01期
4 陈志辉;分子标记技术在茶树研究中的应用[J];福建茶叶;2004年03期
5 王化波,王晓鸣,朱振东;中国大豆疫霉菌遗传多样性的RAPD分析[J];菌物系统;2003年02期
6 ;Analysis of simple sequence repeats markers derived from Phytophthora sojae expressed sequence tags[J];Chinese Science Bulletin;2004年19期
7 ;CHARACTERIZATION, DEVELOPMENT AND EXPLOITATION OF ESTDERIVED MICROSATELLITES IN GOSSYPIUM RAIMONDII ULBRICH[J];Chinese Science Bulletin;2006年05期
8 金基强;李素芳;龚晓春;卢美贞;姚艳玲;忻雅;崔海瑞;;茶树EST资源中SSR的信息分析[J];科技通报;2006年04期
9 陈海梅,李林志,卫宪云,李斯深,雷天东,胡海洲,王洪刚,张宪省;小麦EST-SSR标记的开发、染色体定位和遗传作图[J];科学通报;2005年20期
10 李华盛,范术丽,沈法富;从棉花ESTs数据库中筛选微卫星标记的初步研究[J];棉花学报;2005年04期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李祥才;;采用新技术培植高档人参[J];农业科技通讯;2011年07期
2 杜韧强;;农田栽参技术要点[J];北京农业;2011年25期
3 余剑明;官振富;;人参榕加工及出口检验和包装[J];中国花卉园艺;2011年10期
4 龚冰凌;;林下人参栽培技术[J];农村实用科技信息;2011年08期
5 王健;张连学;赵岩;陈文学;杨琦;王寅秀;;长白山地区不同海拔人参挥发油含量及其成分变化规律[J];安徽农业科学;2011年14期
6 宋春彦;;中药材增产窍门[J];农民致富之友;2010年09期
7 钱永盛;侯志广;刘建国;孙慧;刘晓旭;逯忠斌;;拟除虫菊酯类农药在人参中的多残留方法研究[J];中国农学通报;2011年18期
8 赵英;王秀全;张明远;崔永柱;王义平;王英来;;施用秸秆堆肥对人参地上部分生长及产量的影响[J];现代中药研究与实践;2011年04期
9 许允成;王春伟;高洁;;乙撑硫脲在人参茎叶中的残留动态[J];农药;2011年08期
10 赵明安;;西洋参保值加工要领[J];新农村;2011年07期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 吴连举;尤伟;张亚玉;辜旭辉;关一鸣;逄世峰;;人参、西洋参土传病害生物防治研究进展[A];科技创新与绿色植保——中国植物保护学会2006学术年会论文集[C];2006年
2 黄璐琦;崔光红;李欣;唐晓晶;何希荣;王敏;;中药材锚定引物扩增多态性DNA(APAPD)的鉴别新方法研究[A];2007年中华中医药学会第八届中药鉴定学术研讨会、2007年中国中西医结合学会中药专业委员会全国中药学术研讨会论文集[C];2007年
3 汪庆平;;云南丽江参与东北参糖类物质的含量比较[A];云南省作物学会2004—2006年优秀论文选集[C];2006年
4 王绍林;邱丽娟;;微波干燥中的一项新工艺——微波钝化酶的机理及其影响[A];中国机械工程学会包装与食品工程分会第四届学术年会论文集[C];1995年
5 罗志勇;周钢;周肆清;胡维新;;AFLP法构建人参、西洋参基因组DNA指纹图谱[A];西部大开发 科教先行与可持续发展——中国科协2000年学术年会文集[C];2000年
6 张永利;;大黄、人参在临床上的应用[A];全国民族医药专科专病学术研讨会论文选编[C];2001年
7 花宝金;;人参及其有效成分抗肿瘤作用与机理研究[A];第九届全国中西医结合肿瘤学术研讨会论文集[C];2002年
8 武艳红;杜一平;郑翌;李青青;;利用近红外和红外光谱技术无损研究人参不同位点的差异[A];第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2009年
9 王金辉;李铣;李文;钟大放;;用2D-NMR技术测定Quinquenoside L_3的结构[A];第十届全国波谱学学术会议论文摘要集[C];1998年
10 高晓山;;“人参”名称试诠释[A];2002中药研究论文集[C];2002年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 ;任跃英:西洋参与人参的鉴别[N];吉林农村报;2008年
2 孙继和;西洋参有别于人参(二)[N];民族医药报;2003年
3 湖北 胡献国;人参洋参并不同[N];民族医药报;2002年
4 施震;如何科学选服人参[N];江苏科技报;2003年
5 顾亦棣(主任医师);人参:服用时应注意两点[N];上海中医药报;2004年
6 周止敬;功效不同的各种参[N];民族医药报;2009年
7 马宝山;夏天能吃人参吗?[N];中国中医药报;2000年
8 王德富;关于吃人参的五大误区[N];中国中医药报;2009年
9 李尤佳;人参洋参都是药选用进补应对证[N];健康报;2005年
10 孙继和;西洋参有别于人参(一)[N];民族医药报;2003年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张崇喜;人参、西洋参和三七化学成分的研究[D];吉林农业大学;2004年
2 任跃英;黄果、红果人参和西洋参种源的系统研究与鉴定[D];吉林农业大学;2002年
3 徐克章;人参、西洋参叶片光合作用特性的研究[D];南京农业大学;2003年
4 侯集瑞;国产及进口人参和西洋参药材质量的对比研究[D];吉林农业大学;2003年
5 朴希璥;中韩人参研究的系统比较[D];北京中医药大学;2002年
6 王建华;人参、西洋参发根体细胞胚胎发生及植株再生研究[D];吉林大学;2009年
7 柴程芝;人参药证研究[D];南京中医药大学;2007年
8 陈瑞战;超高压提取人参皂苷工艺及机理研究[D];吉林大学;2005年
9 刘丹;人参愈伤组织源性细胞系表达乙肝病毒表面抗原的研究[D];吉林大学;2004年
10 Frédéric Ngezahayo;中国人参(Panax ginseng C.A.Meyer)野生和栽培类型的遗传多样性和DNA甲基化多态性研究[D];东北师范大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张厚君;人参、西洋参网络数据库系统的研究[D];吉林大学;2006年
2 彭非;我国人参、西洋参及其种植土壤有机氯农药污染状况调查研究[D];中国协和医科大学;2008年
3 霍丙全;基于计算机视觉技术的人参等级评定的研究[D];吉林大学;2005年
4 李波;人参陈皮及其配伍抗疲劳实验研究[D];辽宁中医学院;2001年
5 李超;人参配伍当归对小鼠化学性骨髓抑制、免疫抑制防治作用及其最佳配伍比例初筛的研究[D];辽宁中医学院;2004年
6 李德全;十九畏的本草文献考证和人参五灵脂配伍的实验研究[D];北京中医药大学;2005年
7 孙炳欣;人参CLASSⅢ几丁质酶基因克隆、序列分析及原核表达[D];吉林农业大学;2006年
8 Lo Aissata Mamadou;胶陀螺和人参多糖在小鼠体内的抗疟活性[D];东北师范大学;2007年
9 闫喜焕;人参在方剂配伍中性能改变的历史文献考察[D];黑龙江中医药大学;2007年
10 韩辉;人参川芎注射液对大鼠局灶性脑缺血疗效及机制的研究[D];湖北中医学院;2004年
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