收藏本站
《中南大学学报(自然科学版)》 2010年02期
收藏 | 投稿 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于极大团扩展的蛋白质复合物识别算法

李敏  王建新  刘彬彬  陈建二  
【摘要】:针对蛋白质复合物识别工具CFinder容易识别出超大复合物的缺陷,提出一种基于极大团扩展的蛋白质复合物识别算法(IPC-MCE)。将极大团看作蛋白质复合物的核,通过考查核的邻居顶点与核内顶点的作用概率决定邻居顶点是否属于该复合物。基于酵母蛋白质相互作用网络平台的实验结果表明:与CFinder相比,提出的IPC-MCE算法在相同条件下能够更精确地标识已知蛋白质复合物;在最优参数设置下,IPC-MCE算法标识的已知蛋白质复合物数量是CFinder标识数量的2倍多,说明IPC-MCE算法具有更强的蛋白质复合物识别能力。

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李妍;张霞;;蛋白质相互作用的研究方法及进展[J];长春大学学报;2007年04期
2 王磊,郭政,李霞,屠康,喻辉,李雪森,王辰光;互作蛋白质与复合物亚基的基因表达相关性比较分析[J];生物信息学;2004年04期
3 卢宏超;石秋艳;石宝晨;张治华;赵屹;唐素勤;熊磊;王强;陈润生;;基于蛋白质网络功能模块的蛋白质功能预测[J];生物化学与生物物理进展;2006年05期
4 林亚静;刘志杰;龚为民;;蛋白质结构研究[J];生命科学;2007年03期
5 储钟稀,许春辉,毛大璋,赵福洪,戴云玲;植物叶绿素-蛋白质复合物的研究——Ⅰ.阳生植物向日葵、阴生植物—叶兰的叶绿素-蛋白质复合物[J];植物生理与分子生物学学报;1980年02期
6 曹祖华;;补体替代活化途径的命名—IUIS/WHO命名委员会分会的报告[J];国际免疫学杂志;1982年05期
7 姜淮春;研究核酸-蛋白质系统的-种凝胶电泳方法[J];生物化学与生物物理进展;1989年03期
8 王晋泉;;前庭终器的碳水化物[J];国际耳鼻咽喉头颈外科杂志;1991年06期
9 黄娟;李振坤;霍劲;;基于链接分析的结构挖掘算法在信用评定中的应用与研究[J];中国科技信息;2006年18期
10 孙宇;贾凌云;任军;;蛋白质相互作用的研究方法[J];分析化学;2007年05期
中国重要会议论文全文数据库 前4条
1 吴俊;邓宏钟;朱大智;谭跃进;;蛋白质相互作用网络的度秩函数与度分布[A];2006全国复杂网络学术会议论文集[C];2006年
2 李春华;陈慰祖;王存新;;蛋白质与蛋白质软对接的方法研究[A];第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集[C];2002年
3 狄军艳;夏凤笑;冯甲棣;;丁香酚对LPS处理大鼠肝微粒体细胞色素含量的影响[A];中国生理学会第21届全国代表大会暨学术会议论文摘要汇编[C];2002年
4 周明;王鲁;郑雷;赵开弘;;藻红蓝蛋白连接/异构酶重组体系[A];第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集[C];2002年
中国重要报纸全文数据库 前1条
1 青云;硒酸酯多糖的药理研究[N];中国医药报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 梁治;蛋白质相互作用网络的比较生物学分析及其应用[D];中国科学技术大学;2006年
2 李春华;蛋白质—蛋白质对接方法的研究[D];北京工业大学;2003年
中国硕士学位论文全文数据库 前7条
1 刘洋;大肠杆菌膜间质蛋白不易聚集现象的发现及其研究[D];清华大学;2004年
2 李翔;用决策树方法预测酵母蛋白质复合物[D];上海师范大学;2005年
3 谢宝刚;酞菁—蛋白质复合物及其作为抗癌光敏剂的研究[D];福州大学;2003年
4 王宁;基于时序和极大团的关联规则数据挖掘方法的研究[D];云南师范大学;2006年
5 孙静;平面图中关于丁国力猜想的证明[D];华中师范大学;2006年
6 刘洪艳;褐藻色素蛋白复合物的分离及特性研究[D];辽宁师范大学;2002年
7 于永辉;配体—受体相互作用与识别的研究[D];北京工业大学;2003年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026