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萝卜中一未知dsRNA全长cDNA克隆及其序列

刘莉  陈集双  喻珊  王冲  
【摘要】:采用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)分析法,发现杭州市近郊的部分萝卜植株及其子代含有约1·8kbp的dsRNA;在聚丙烯酰胺凝胶上可分离为大小接近的dsRNA1和dsRNA2。以dsRNA1为模板,采用单引物扩增法获得其全长cDNA;克隆测序确认为1866nt;预测其最大开放阅读框ORF(Open Reading Frame)为574个氨基酸,与双分病毒属(Partitivirus)中部分病毒的RdRp(RNA dependent RNA polymerase)氨基酸序列具有一定的同源性。推测此dsRNA可能为萝卜黄边病毒(radish yellow edge virus,RYEV)感染所致。

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