基于16S rRNA基因测序的陕西商洛区五灵脂菌群结构分析

【摘要】：为分析中药材五灵脂中菌群微生物结构特点,本研究以陕西省商洛市复齿鼯鼠仿野生养殖地采集的10份复齿鼯鼠干燥粪便为研究对象,采用Illumina高通量测序技术对10份样品中微生物16S rRNA基因V3-V4区进行测序及生物信息学分析,并以COG和KEGG数据库为基础进行菌群功能预测分析。实验共获得285 218条长度分布在400～450 bp的高质量序列,经分析发现10份样本中微生物分布于不同的8个门、28个科、75个属共120种细菌。在门水平上,厚壁菌门(87.68%±2.68%)、拟杆菌门(7.62%±3.74%)为优势菌门,所有样本均显示出丰富的微生物多样性。功能预测表明菌群与能量代谢密切相关。实验结果说明五灵脂中携带的有益菌群可能为其有效成分之一,且样本中未检出致病菌。