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《云南农业大学学报(自然科学版)》 2010年03期
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高等植物F3′HcDNA及其氨基酸序列的生物信息学分析

苏丽  赵昶灵  杨晓娜  李会容  李云  
【摘要】:用生物信息学方法对GenBank中拟南芥、油菜、大豆、矮牵牛和高梁等的类黄酮3′-羟化酶基因的cD-NA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行了初步预测和分析。结果表明:不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列的相似性为69.5%,其起始密码子均为ATG,终止密码子均为TAA、TAG或TGA,包括5,′3′非翻译区和一个开放阅读框;不同植物类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列编码的氨基酸序列的理化性质基本一致,相似性为72.5%,含有6段保守氨基酸序列,是"PPGR"、"AGTDT"、"RPPN"、"AYNY"、"IKALLL"、"TPLS";在进化关系上可划分为两大类;不同植物类黄酮3′-羟化酶具有一个跨膜结构域、定位于内质网上,并有一段与细胞色素P450功能区相匹配的功能域;类黄酮3′-羟化酶属具转运肽的亲水性稳定分泌蛋白,其二级结构为α-β型,α-螺旋和无规卷曲为最主要的结构元件,延伸链和β-转角散布于整个结构。可为类黄酮3′-羟化酶基因的克隆和遗传操作提供理论参考。

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9 特约记者 高尚潮 周庆洪 本报记者 徐烽;傅立国与巨著《中国高等植物》[N];大众科技报;2005年
10 文君;专家称保持生物多样性有助于减缓疾病传播[N];大众科技报;2005年
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9 张伟伟;抗感染过程中海带组织化学信号及植物抗毒素的研究[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2003年
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