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PPARGC1A通过影响肿瘤微环境中免疫成分改善肾透明细胞癌的预后

储昭阳  朱向明  江峰  刘表虎  李国杰  龚儒杰  马平川  徐凯慧  
【摘要】:目的通过分析肿瘤微环境(TME),确定与肾透明细胞癌(KIRC)关键基因相关的肿瘤浸润免疫细胞(TICs)的组成,揭示关键基因的独立预后价值。方法应用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中计算了611例KIRC患者免疫和基质成分的数量和TICs的比例。通过对差异表达基因(DEGs)进行了分析并进行Cox回归分析和构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)。然后,通过单因素Cox与PPI的交集分析,确定过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子-1A(PPARGC1A)为预后因子。进一步对PPARGC1A的表达进行差异分析、生存分析、临床相关性分析、基因集富集分析(GSEA)、TICs组成比例及相关性分析。结果 PPARGC1A的表达与临床病理特征(临床分期、远处转移)呈负相关,与KIRC患者的生存呈正相关。GSEA显示,高表达PPARGC1A组的基因主要富集于代谢途径和免疫相关活性。对TICs比例的CIBERSORT分析表明,幼稚B细胞、巨噬细胞M2与PPARGC1A表达呈正相关,但调节性T细胞(Treg)和T细胞滤泡辅助因子(Tfh)与PPARGC1A表达呈负相关,提示PPARGC1A可能负责调控TME的免疫成分。结论 PPARGC1A的表达水平可能有助于改善KIRC患者的预后,特别可能通过影响TME的免疫成分发挥作用,同时也揭示了PPARGC1A作为免疫治疗发展的潜在靶点和生物标志物。

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1 刘鹏;赵海玲;马亮;申正日;邱新萍;李平;;PPARGC1A基因多态性与中国汉族人群2型糖尿病患者肾脏疾病风险的研究[J];中国中西医结合肾病杂志;2020年10期
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