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《生物信息学》 2007年01期
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基于分组重量编码的蛋白质功能预测

王秀鹤  王正华  王勇献  张振慧  
【摘要】:从蛋白质序列出发,采用分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight,简记EBGW),并结合最近邻居算法对蛋白质功能进行预测。对酵母(Saccharomyces cerevisiae)蛋白质的1826条序列进行预测,整体预测准确率与其他基于序列信息的蛋白质功能预测方法相当。实验结果表明基于EBGW编码方案的新方法可有效地应用于蛋白质功能预测。
【作者单位】国防科技大学计算机学院 国防科技大学计算机学院 国防科技大学计算机学院 国防科技大学理学院
【基金】:国家自然科学基金资助项目(NO.60603054)
【分类号】:Q51-33
【正文快照】:
人类基因组计划的实施和推进,产生了大量有关分子生物学的原始数据,对这些数据进行计算和分析,探索其中蕴含的生物学意义和生物学规律是当前研究的热点问题。蛋白质功能预测成为后基因时代研究的核心内容之一。蛋白质功能预测综合氨基酸序列信息、氨基酸物化特性和蛋白质结构

【同被引文献】
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1 张绍武,潘泉,张洪才,张云龙,王海瑜;基于支持向量机和贝叶斯方法的蛋白质四级结构分类研究[J];生物物理学报;2003年02期
2 张婧;杨炳儒;;基于混合遗传算法的聚类模式数据挖掘方法[J];微计算机信息;2006年18期
3 胡德华,张洁,方平;生物信息学数据库调查分析及其利用研究[J];生物信息学;2005年01期
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1 张振慧;蛋白质分类问题的特征提取算法研究[D];国防科学技术大学;2006年
2 刘惠;蛋白质序列数据的分类预测研究[D];上海交通大学;2007年
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1 王秀鹤;基于序列和相互作用的蛋白质功能预测[D];国防科学技术大学;2006年
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1 王秀鹤;基于序列和相互作用的蛋白质功能预测[D];国防科学技术大学;2006年
2 刘昊;基于聚类算法和相互作用网络的蛋白质功能预测研究[D];湖南大学;2009年
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