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《畜牧兽医学报》 2005年12期
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鸡MHC B-LBⅡ新等位基因检测及多态性研究

徐日福  李奎  陈国宏  强巴央宗  莫德林  李长春  樊斌  刘榜  
【摘要】:在鸡的基因组中扩增了MHCB-LBⅡ基因第2外显子长度为374bp的片段,通过克隆、测序,发现了20个B-LBⅡ新等位基因。对第2外显子6个限制性酶切位点(AluⅠ、CaiⅠ、CfrⅠ、Hin1Ⅰ、HinfⅠ和RsaⅠ)的PCR-RFLP多态性进行分析,并运用在这6个位点所观测的纯合基因型组合对B-LBⅡ等位基因进行初步检测,结果显示,该方法的等位基因检出率可达65%,等位基因主型检出率为68.75%。对B-LBⅡ基因7个单倍型和20个等位基因第2外显子多态性分析表明,核苷酸的多态变异位点为63个,其中简约性信息位点48个,单变异位点15个;仅在中国地方鸡种所检测到的简约性信息位点13个,单变异位点11个。序列同源性达90.6%~99.5%;核苷酸异义替换率为14.64%±2.67%,高于同义替换率2.92%±0.94%。为鸡B-LBⅡ基因多态性进化机制研究提供了参考资料。

【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 张玉喜;重要海水养殖鱼类MHCⅡ基因克隆、表达及多态性分析[D];中国海洋大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 韦信贤;广西三黄鸡抗马立克氏病相关分子遗传学标记的筛选研究[D];广西大学;2007年
2 彭林泽;多浪羊和中国美利奴(新疆军垦型)羊MHC-DRB、DQB基因PCR-RFLP多态性分析[D];石河子大学;2007年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前5条
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2 吴艳,侯水生,刘小林,肖红卫;MHC及其在肉鸡和蛋鸡中的不同[J];动物科学与动物医学;2004年04期
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4 侯卓成,杨宁;家禽主要组织相容性复合体的研究进展[J];遗传;2002年01期
5 罗庆斌;任广彩;沈栩;;鸡MHC-B-F基因外显子3 PCR-RFLP-TasⅠ的多态分布[J];中国家禽;2005年20期
中国重要会议论文全文数据库 前2条
1 罗庆斌;任广彩;沈栩;张细权;;鸡MHC-B-F基因外显子3 PCR-RFLP-Tas Ⅰ的多态分布[A];第十次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2006年
2 罗庆斌;罗姝凤;冯秀燕;张细权;;鸡MHC-B-L基因Mse I位点的多态分布[A];中国家禽业——机遇与挑战——第十三次全国家禽学术讨论会论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前8条
1 吴信生;利用微卫星技术分析中国部分地方鸡品种遗传多样性及其与生产性能的关系[D];扬州大学;2004年
2 闫若潜;鸡BF2和β2m分子特征与二级结构及其复合体鉴定病毒表位的研究[D];中国农业大学;2005年
3 季从亮;鸡肉IMP含量相关候选基因SNP筛查及其用于地方鸡种群体遗传结构分析的研究[D];扬州大学;2005年
4 徐日福;中国部分地方鸡种MHC B-LBⅡ、B-G基因变异及其群体遗传结构研究[D];华中农业大学;2005年
5 仲大莲;禽类Ii基因的克隆、表达及其功能的初步研究[D];中国科学技术大学;2005年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 胡团军;鹅MHC classⅠcDNA克隆、基因组结构、等位基因多态性分析[D];中国农业大学;2004年
2 林常有;鸭MHCⅠ类分子cDNA克隆及其基因组结构[D];中国农业大学;2004年
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5 邓雪娟;固始鸡不同品系及部分外来鸡种之间遗传多样性的微卫星[D];河南农业大学;2005年
6 邓呈逊;利用微卫星标记对六个湖北省地方鸡群遗传多样性的研究[D];华中农业大学;2005年
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8 韦信贤;广西三黄鸡抗马立克氏病相关分子遗传学标记的筛选研究[D];广西大学;2007年
9 彭林泽;多浪羊和中国美利奴(新疆军垦型)羊MHC-DRB、DQB基因PCR-RFLP多态性分析[D];石河子大学;2007年
10 邱莫寒;鸡MHC-B-F基因外显子2、3的群体遗传结构和系统发育关系分析[D];四川农业大学;2007年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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2 潘星华,傅继梁;MHC DQA基因的分子进化研究——Ⅱ.基于核苷酸替换和SCU偏移的系统发育的分析[J];遗传学报;1997年05期
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6 占秀安,钱利纯,李卫芬;甜菜碱对中华鳖肌肉和裙边食用品质指标的影响[J];水产科学;2001年04期
7 朱汉炎;苏淑贞;李风伶;付春江;陈令蒲;;鹌鹑肌肉中肌苷酸含量的分析[J];河北农业大学学报;1988年04期
8 周童,马建民,顾万君,孙啸,陆祖宏;哺乳动物MHC密码子使用概率的聚类分析[J];东南大学学报(自然科学版);2001年02期
9 史燕,吴孝兵,晏鹏,陈壁辉;扬子鳄MHCⅡ类B基因第二外元的克隆及序列分析[J];动物学研究;2004年05期
10 马吉飞,陈万芳,陈萍;鸡主要组织相容性复合体的研究进展[J];动物医学进展;1998年04期
中国博士学位论文全文数据库 前7条
1 叶满红;鸡脂肪酸结合蛋白基因的克隆及其与肌内脂肪含量关系的研究[D];中国农业科学院;2003年
2 陈继兰;鸡肉肌苷酸和肌内脂肪含量遗传规律及相关候选基因的研究[D];中国农业大学;2004年
3 李慧锋;鸡脂肪代谢相关基因的表达与网络分析[D];中国农业大学;2005年
4 季从亮;鸡肉IMP含量相关候选基因SNP筛查及其用于地方鸡种群体遗传结构分析的研究[D];扬州大学;2005年
5 杨烨;优质鸡肌内脂肪代谢调控及其与肉质性状关系的研究[D];中国农业科学院;2005年
6 徐日福;中国部分地方鸡种MHC B-LBⅡ、B-G基因变异及其群体遗传结构研究[D];华中农业大学;2005年
7 姜俊芳;脂肪细胞分化相关因子基因表达在猪生长过程中的变化规律研究[D];浙江大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前5条
1 李婧;民猪产仔数候选基因研究[D];东北农业大学;2003年
2 柴丽娟;鸡AMPD1基因多态性及其与肌苷酸含量关系的研究[D];山西农业大学;2003年
3 李长龙;猪ADD1基因的克隆及其与肉质性状关系的研究[D];东北农业大学;2004年
4 刘长青;山东省地方鸡种风味特性候选基因ADSL与ATIC的研究[D];曲阜师范大学;2005年
5 尚友国;山东地方绵羊DRB3基因遗传多态性及其序列分析[D];山东农业大学;2005年
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3 白婧;许崇波;张强;高凤山;;托佩克猪SLA-2基因克隆及功能区生物信息学分析[J];生物技术通报;2011年08期
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7 顾亚玲;马建宁;;固原鸡不同群体ADSL基因遗传特性的研究[J];黑龙江畜牧兽医;2011年13期
8 王慧华;王金玉;施会强;侯启瑞;李源;张跟喜;;京海黄鸡IGF-Ⅰ基因TaiⅠ位点多态性及其与部分生产性能的相关性[J];畜牧与兽医;2011年03期
9 黄玉兰;黄大鹏;李祥辉;;三江白猪脂肪型脂肪酸结合蛋白基因多态性及多态性片段的序列分析[J];中国生物制品学杂志;2011年07期
10 印崇;孙博兴;赵志辉;白春艳;杨润军;邢沈阳;;军牧1号白猪、杜洛克猪和藏猪的H-FABP和LPIN1基因多态性分布[J];中国畜牧兽医;2011年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 郭涛;黄兵;董辉;韩红玉;赵其平;姜连连;李洋;平宪卿;;连锁群选育法:一种新型的遗传学鉴定基因方法[A];中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第六次代表大会暨第十次学术研讨会论文集[C];2009年
2 张海燕;尹靖东;王强;;CLIC5等位基因与PIC猪胴体品质和肉质的关系[A];中国畜牧兽医学会2009学术年会论文集(下册)[C];2009年
3 栾德琴;白云峰;包文斌;常国斌;陈国宏;;基于Web的中国地方鸡种生物信息查询系统的设计[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
4 曲鲁江;李显耀;徐桂芳;陈宽维;杨红杰;张龙超;吴桂琴;侯卓成;徐桂云;杨宁;;利用微卫星标记对中国地方鸡种遗传多样性的评估(英文)[A];全国畜禽遗传资源保护与利用学术研讨会论文集[C];2005年
5 黄艳艳;胡北侠;徐栋;路希山;张秀美;;鸡源H9N2亚型禽流感病毒NS基因的分子进化分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十四次学术研讨会论文集[C];2008年
6 黄庆国;徐虎;;昆明犬毛色遗传的研究浅析[A];第十三次全国养犬学术研讨会论文集[C];2009年
7 张争锋;陈宏;李秋玲;雷初朝;张春雷;薛恺;王轶敏;王新庄;;南阳牛DGAT2基因多态性及其与生长性状相关性研究[A];中国遗传学会功能基因组学研讨会论文集[C];2006年
8 常怀普;欧江涛;钟金城;王希龙;郭春华;宾石玉;马志杰;;五指山猪IGF2基因5'调控区的单核苷酸多态性分析[A];中国遗传学会功能基因组学研讨会论文集[C];2006年
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1 曲鲁江;中国地方鸡种分子遗传多样性研究[D];中国农业大学;2004年
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6 赵文明;鹅GH、PRL基因序列及其多态性与早期生长发育及屠宰性状的关联分析[D];扬州大学;2008年
7 吴健;猪生产性状QTL区域5个候选基因的分离、鉴定及功能初步研究[D];华中农业大学;2007年
8 黄京书;猪四个候选基因的分离、鉴定及分子标记与杂种优势的关联分析[D];华中农业大学;2007年
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1 胡团军;鹅MHC classⅠcDNA克隆、基因组结构、等位基因多态性分析[D];中国农业大学;2004年
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3 李红梅;六个驴品种血清蛋白多态性的研究[D];山西农业大学;2004年
4 周波;SLA-DQB和DRB基因外显子2的PCR-RFLP分析及一个新SLA-DQB等位基因的发现[D];南京农业大学;2003年
5 李世军;利用微卫星标记评估10个中国地方猪品种的遗传多样性[D];华中农业大学;2004年
6 郭秀丽;河北柴鸡MC1R基因变异研究[D];河北农业大学;2009年
7 杨雪梅;六品种小型猪SLA-DQB、DRB基因外显子2的群体分子遗传结构分析[D];四川农业大学;2007年
8 李波;猪SLA抗原递呈相关新基因的克隆及功能分析[D];四川农业大学;2006年
9 于灵芝;猪myostatin 5’调控区和GDF11内含子的克隆及多态性研究[D];山东农业大学;2007年
10 肖兵兵;利用微卫星DNA技术对SPF种禽的分子遗传学的研究[D];中国农业科学院;2008年
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