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《生物技术通报》 2003年06期
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应用生物信息学技术对植物表达序列标签(EST)的大规模分析

汤继凤  曹永生  黎裕  
【摘要】:目前 ,一些基因组较小的植物 (如拟南芥 ,水稻等 )的全基因组已经基本完成测序 ,较大基因组的测序工作则主要集中在基因组中表达基因的测序上 ,表达序列标签 (EST)计划由此产生。研究表明 ,对EST进行大规模研究已成为功能基因组学研究的最佳途经之一。本文着重介绍和讨论应用生物信息学技术对植物EST数据的大规模分析。

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【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 宋宪亮;异源四倍体棉花栽培种分子遗传图谱的构建及部分性状QTL标记定位[D];山东农业大学;2004年
2 张永红;小麦条锈菌cDNA文库构建和表达序列标签(ESTs)分析[D];西北农林科技大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张巧利;中华蜜蜂(Apis cerana)毒腺cDNA文库构建和表达序列标签(EST)分析[D];山东农业大学;2006年
2 高琪;日本七鳃鳗(Lampetra japonica)口腔腺表达序列标签(EST)分析[D];辽宁师范大学;2006年
3 耿婉如;人大肠癌相关EST-2的分子克隆及初步分析[D];中国人民解放军军医进修学院;2007年
4 尤春源;棉花陆海杂交F_2群体连锁图谱构建及纤维品质与产量性状QTL定位[D];新疆农业大学;2007年
5 张鹏;芝麻种质资源遗传多样性研究[D];南京农业大学;2007年
6 于健;棉花品种的抗旱遗传多样性分析及抗旱性评价[D];新疆农业大学;2008年
7 林绍艳;海7124纤维/胚珠cDNA文库的构建、测序及EST分析[D];南京农业大学;2008年
8 杨伟秋;褐飞虱若虫均一化全长cDNA文库的构建及EST分析[D];华中农业大学;2009年
9 吕再萍;不同环境对褐飞虱翅型分化影响及褐飞虱成虫全长cDNA文库构建[D];华中农业大学;2009年
10 李冬花;紫阳1号茶树新梢cDNA文库构建及EST序列分析[D];西北农林科技大学;2009年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郭苗莉,朱江波,陈蓉芳,张天宝;应用基因表达谱芯片研究MNNG诱致小鼠胚胎畸形肢体基因表达的变化[J];癌变.畸变.突变;2005年02期
2 王朝霞;生物信息学:一门前沿交叉学科[J];安徽教育学院学报;2002年06期
3 赵传志;李爱芹;李长生;刘波;夏晗;王兴军;贾文斌;;山羊EST资源的SSR分析[J];山东农业科学;2009年06期
4 郭大龙;;植物微卫星引物开发方法[J];安徽农业科学;2007年18期
5 张树林;何德;朱高浦;刘杰;莫鹏巧;;生物信息学在农业上的应用[J];安徽农业科学;2007年22期
6 吉冬梅;;酵母基因表达调控关系的构建及其统计特性分析[J];安徽农业科学;2009年10期
7 程小毛;宗媛媛;黄晓霞;;挪威云杉EST资源的SSR信息分析[J];现代农业科技;2011年08期
8 杨华;陈琪;韦朝领;史成颖;方从兵;宛晓春;;茶树转录组中SSR位点的信息分析[J];安徽农业大学学报;2011年06期
9 李显勇;李燕雏;尹卫华;张凌燕;;“仿生内控”治疗晚期癌症的临床应用报告[J];癌症进展;2008年03期
10 匡刚桥;刘臻;鲁双庆;刘红玉;张建社;肖调义;;GenBank数据库中鳜鱼微卫星位点的筛选及特征分析[J];动物学报;2007年01期
中国重要会议论文全文数据库 前6条
1 庄绪静;曹雅忠;李克斌;尹姣;;同源建模和分子对接方法的应用与发展[A];植保科技创新与病虫防控专业化——中国植物保护学会2011年学术年会论文集[C];2011年
2 栾德琴;常国斌;陈国宏;;隐性白鸡不同时期肌肉组织生长相关基因的表达谱分析[A];安全优质的家禽生产——第十五次全国家禽学术讨论会论文集[C];2011年
3 谢潮添;陈昌生;纪德华;徐燕;;坛紫菜EST-SSR分子标记的开发及应用(英文)[A];经济发展方式转变与自主创新——第十二届中国科学技术协会年会(第三卷)[C];2010年
4 乔婷婷;马春雷;周炎花;姚明哲;陈亮;;浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析[A];中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会论文集[C];2009年
5 忻雅;王伟科;阮松林;王世恒;马华升;;基于RAPD和EST-SSR标记的秀珍菇菌株聚类分析[A];第二届全国食用菌中青年专家学术交流会论文集[C];2008年
6 忻雅;王伟科;阮松林;王世恒;马华升;;基于RAPD和EST-SSR标记的秀珍菇菌株聚类分析[A];中国菌物学会第四届会员代表大会暨全国第七届菌物学学术讨论会论文集[C];2008年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 贺厚光;双调控溶瘤腺病毒携带超抗原SEA基因治疗前列腺癌基础研究[D];苏州大学;2010年
2 郭新军;拟黑多刺蚁肌细胞增强因子2与肌钙蛋白Ⅰ亚基基因的克隆及其在发育中的表达研究[D];陕西师范大学;2010年
3 顾全;基于集成智能的膜蛋白受体结构与功能研究[D];东华大学;2010年
4 周晖;自由搜索算法及其在传感器网络中的应用[D];东华大学;2010年
5 刘怀华;玉米异交不亲和基因Ga1-S的遗传定位及其过程的转录组和蛋白质组分析[D];山东农业大学;2011年
6 刘冬云;野生山丹种质资源遗传多样性及利用研究[D];北京林业大学;2011年
7 马鸿艳;甜瓜白粉病抗性遗传分析及相关基因SSR标记[D];东北林业大学;2011年
8 张俊成;小麦抗白粉病基因PmY2280遗传作图和52-kb线粒体插入分析[D];中国农业科学院;2011年
9 林小涵;银杏和木兰属植物的转录组、叶绿体基因组及其相关研究[D];北京协和医学院;2011年
10 陈美霞;红麻遗传连锁图谱构建及重要性状基因定位与SCAR标记的开发[D];福建农林大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 杜连莹;实践八号搭载8个苜蓿品种生物学效应研究[D];哈尔滨师范大学;2010年
2 罗素娟;家蚕细胞周期依赖性蛋白激酶家族(CDK)的研究[D];浙江理工大学;2010年
3 郑碧;家蚕小热休克蛋白22.6的克隆表达与功能初步分析[D];浙江理工大学;2010年
4 庄文华;家蚕ras oncogene (Bras2)的表达、纯化以及特性分析[D];浙江理工大学;2010年
5 马良;家蚕BmIBP基因的原核表达及其亚细胞定位研究[D];浙江理工大学;2010年
6 李婷婷;家蚕BmNADHb5的表达分析及其亚细胞定位[D];浙江理工大学;2010年
7 刘靓珏;家蚕RPA43相关基因(BmRPA43 N)的克隆表达及定位分析[D];浙江理工大学;2010年
8 王亚男;与棕色棉纤维颜色性状紧密连锁的分子标记研究[D];安徽农业大学;2010年
9 刘春滟;双孢蘑菇褐化相关PPO基因的研究及香菇EST-SSR标记的建立[D];安徽农业大学;2010年
10 仲彩萍;重离子辐照玉米品质分析与蛋白质多态性研究[D];甘肃农业大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王朝霞;江昌俊;蔡海云;;茶树β-1,3-葡聚糖酶基因cDNA片段的克隆与序列分析[J];安徽教育学院学报;2006年03期
2 易成新,潘泽义,刘文秀;棉花纤维品质指标及其提高问题[J];安徽农学通报;2001年04期
3 盛良全,郑晓云,闫向阳,肖厚荣,厦炳乐,刘少民;生命体中的超氧化物歧化酶(综述)[J];安徽卫生职业技术学院学报;2002年02期
4 潘錫康;褐稻虱翅型分化因子的初步研究[J];安徽农学院学报;1982年02期
5 丁克坚,黄义德,汪振华,李桂亭,檀根甲;氮肥、密度对水稻产量及纹枯病、褐飞虱发生程度的影响[J];安徽农业大学学报;1998年04期
6 石耀华,刘军,夏建红,桂建芳;银鲫肌酸激酶M3-CK cDNA的克隆及其表达特征[J];动物学报;2003年05期
7 李太武,相建海,刘瑞玉;中国对虾cDNA文库的构建[J];动物学报;1998年02期
8 章良,吴梧桐;蛇毒抗肿瘤组分的研究进展[J];动物学杂志;2003年06期
9 张广辉,梁月荣,吴颖;咖啡因生物合成研究进展及在茶树育种中的应用[J];茶叶;2005年01期
10 吴颖,梁月荣;S-腺苷甲硫氨酸在茶树生理代谢中的研究现状[J];茶叶;2005年02期
中国博士学位论文全文数据库 前8条
1 袁有禄;棉花优质纤维特性的遗传及分子标记研究[D];南京农业大学;2000年
2 弗洛朗(Florent J-B.Quenum);芝麻种质资源种子特性、生化和分子标记的分析研究[D];浙江大学;2002年
3 丁胜利;一个新的锌指蛋白作为稻瘟菌的致病力因子[D];中国农业大学;2004年
4 金骏培;陆地棉数量性状遗传分析和产量性状轮回选择的研究[D];南京农业大学;2003年
5 桂仁意;银杏主要栽培品种指纹图谱构建及遗传图谱构建研究[D];南京林业大学;2004年
6 雷一东;大花红景天的ISSR遗传多样性与精油化学成分多样性研究[D];复旦大学;2004年
7 肖海华;苹果属山定子Mb.nramp1基因克隆及其功能的初步研究[D];中国农业大学;2005年
8 韩志国;棉纤维发育相关EST-SSR的特征、功能及其定位[D];南京农业大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 孙志民;冰草属植物的收集与遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2000年
2 张蕴哲;毛白杨杂交群体AFLP遗传图谱的构建[D];中国林业科学研究院;2001年
3 李雪峰;薏苡遗传图谱的构建及重要性状QTL定位的研究[D];华中农业大学;2003年
4 葛海燕;棉花黄萎病抗性的遗传及分子标记研究[D];南京农业大学;2003年
5 曹敏;禾谷缢管蚜翅型分化相关基因的cDNA克隆及分析[D];中国农业大学;2004年
6 黄乃泰;湘杂棉2号杂种优势表现及其遗传机理研究[D];南京农业大学;2003年
7 张成桂;菌核病菌诱导甘蓝型油菜抗病基因表达差异的初步分析[D];华中农业大学;2005年
8 张丽;早美酥×红香酥F_1代群体分子遗传图谱的构建[D];河北农业大学;2006年
9 王强;花生的SRAP分子遗传连锁图谱构建[D];华中农业大学;2006年
10 王长彪;与棉纤维发育相关的EST生物信息学分析[D];南京农业大学;2007年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前4条
1 闫建勋;刘念;黄邦海;;姜黄属SRAP反应体系的优化与建立[J];广东农业科学;2011年01期
2 李志博;章杰;魏亦农;喻娟;郗忠玲;张小均;;覆膜高密度下棉花抗旱性产量和品质指标的特征分析[J];核农学报;2011年03期
3 邱文武;孙伟生;窦美安;;基于PCR的新型分子标记──SRAP研究进展[J];江西农业学报;2007年08期
4 邹朗云;曹广春;张谦;张彦;梁革梅;吴孔明;郭予元;;棉铃虫中肠cDNA文库的构建及EST分析[J];昆虫学报;2011年07期
中国博士学位论文全文数据库 前9条
1 邓红;文冠果种仁品质及其油脂和蛋白质资源利用研究[D];陕西师范大学;2011年
2 王晓敏;小麦与条锈菌互作过程中活性氧和防御基因的防御反应及抗病相关基因的鉴定与功能验证[D];西北农林科技大学;2010年
3 韩志国;棉纤维发育相关EST-SSR的特征、功能及其定位[D];南京农业大学;2006年
4 栾明宝;海岛棉特定染色体的遗传效应及主要性状的QTL定位[D];中国农业科学院;2008年
5 姚立新;不同产地冬枣对比试验及冬枣标准化栽培研究[D];北京林业大学;2010年
6 钱能;陆地棉遗传多样性与育种目标性状基因(QTL)的关联分析[D];南京农业大学;2009年
7 蔡彩平;四倍体栽培棉种高密度遗传图谱的构建及应用[D];南京农业大学;2009年
8 姜翠翠;(木奈)均一化全长cDNA文库的构建及果实褐变相关基因的分离与表达分析[D];福建农林大学;2012年
9 曾亮;豌豆种质资源遗传多样性分析及白粉病抗性评价[D];甘肃农业大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 田芳;甘蓝型油菜A8连锁群含油量QTLs及其遗传累赘分析[D];华中农业大学;2009年
2 邓晓艳;利用cDNA-AFLP技术分析棉花耐旱相关基因的表达[D];石河子大学;2010年
3 王俊娟;陆地棉种质资源的抗旱性评价及遗传研究[D];中国农业科学院;2011年
4 周忠丽;我国保存亚洲棉的遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2011年
5 邹朗云;棉铃虫中肠cDNA文库的构建、V-ATP酶亚基B基因的克隆与功能研究[D];中国农业科学院;2011年
6 李金荣;海岛棉纤维品质性状的QTLs定位[D];石河子大学;2009年
7 宋立君;萝卜遗传连锁图谱构建与主要品质性状QTLs分析[D];南京农业大学;2009年
8 郭丽英;广西扁柑及部分地方柑橘种质资源调查和亲缘关系分析[D];广西大学;2011年
9 张保才;AB-QTL法定位海岛棉优异纤维品质基因和抗黄萎病基因[D];中国农业科学院;2006年
10 张先亮;陆地棉重要农艺性状的QTL定位[D];中国农业科学院;2007年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 万海伟,杜立新;表达序列标签(EST)在基因组学研究中的应用[J];生物技术通报;2004年01期
2 吴旻;发展基因组学和生物信息学刻不容缓[J];中国科技月报;1999年12期
3 刘晓,施锐,张士璀,戴桂林;生物信息学与生物经济[J];生物学杂志;2004年04期
4 郑伟国,郭英,常春艳;生物信息学的现状与未来[J];口岸卫生控制;2004年05期
5 ;科学出版社生命科学编辑部新书推介[J];中国生物工程杂志;2005年04期
6 崔向军;;生物信息学在DNA局域结构研究中的应用[J];内蒙古科技与经济;2006年24期
7 李强;胡志东;;蛋白质组学技术研究[J];医学综述;2007年11期
8 ;生物信息学试题答案(2)[J];外科理论与实践;2007年04期
9 张小慧,李桂源;基因组生物信息学在大规模测序中的应用[J];医学与社会;2000年01期
10 朱佳鸣,郭勇,唐权,祖云霞;国内外生物信息学WWW服务器及数据库[J];微生物学通报;2002年01期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李媛;崔尚金;李建伟;于康震;;分子生态学与生物信息学[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十一次学术研讨会论文集[C];2002年
2 陆文聪;钮冰;;基于数据挖掘的生物信息学研究进展[A];中国化学会第27届学术年会第15分会场摘要集[C];2010年
3 陈婷婷;郭婷婷;李林;安冬;;基于生物信息学的功能蛋白基因序列分类研究[A];2011年全国通信安全学术会议论文集[C];2011年
4 卢学春;杨波;朱宏丽;姚善谦;;采用生物信息学方法优化依硫磷酸联合方案治疗MDS的应用研究[A];中国科协海峡两岸学术研讨会——2008血液肿瘤论坛会议会编[C];2008年
5 阮林;何颖;邹泽红;傅意玲;陈惠芳;陶爱林;;外源蛋白过敏原性生物信息学评价[A];中华医学会2010年全国变态反应学术会议暨中欧变态反应高峰论坛参会指南/论文汇编[C];2010年
6 冯文龙;赵清杰;;基于遗传算法的DNA多序列比对问题[A];2007年中国智能自动化会议论文集[C];2007年
7 康晓东;;生物信息学及其研究对象[A];2003年全国医学影像技术学术会议论文汇编[C];2003年
8 王智宇;童强松;曾甫清;刘媛;顾朝辉;郑丽端;蔡嘉斌;蒋国松;;小鼠睾丸特异性基因TSEG-4的克隆及表达分析[A];第十五届全国泌尿外科学术会议论文集[C];2008年
9 朱云平;刘湘军;魏丽萍;李亦学;;肝脏蛋白质组的生物信息学研究[A];中国蛋白质组学第三届学术大会论文摘要[C];2005年
10 孙琳琳;蒋继志;;生物信息学及其在作物抗性基因研究中的应用[A];中国植物病理学会2006年学术年会论文集[C];2006年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 李恩青;生物信息学:促动BT与IT双赢[N];中国高新技术产业导报;2001年
2 刘义;生物信息学产业浮出水面[N];中国高新技术产业导报;2000年
3 英潮;生物信息学演绎“变脸”[N];中药报;2002年
4 中科院院士 强伯勤;生物信息学蕴有巨大效益[N];光明日报;2002年
5 白毅;加强生物信息学建设推动人类基因组研究[N];中国医药报;2002年
6 周颖;李梢:生物信息学为证候研究提供新视角[N];中国中医药报;2006年
7 中国科学院院士 张春霆 郝柏林;生物信息学孕育大产业[N];经济日报;2000年
8 刘丽丽;高性能计算为生物信息学加速[N];计算机世界;2007年
9 严飞;生物信息学 新世纪的新科学[N];大众科技报;2002年
10 张亚东;“交点”上的舞蹈[N];计算机世界;2002年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张敏;生物信息学中多序列比对等算法的研究[D];大连理工大学;2005年
2 曾智勇;猪呼肠孤病毒SC-A株的分离鉴定及全基因组cDNA文库的构建和分子遗传特征分析[D];四川农业大学;2006年
3 肖庆;硬粒小麦硒蛋白的生物信息学研究[D];华中科技大学;2008年
4 张革新;α-淀粉酶性能与结构关系的生物信息学研究[D];江南大学;2005年
5 李艳芸;HLA-DRB1基因编码区SNPs的分析及其与宫颈癌的相关性研究[D];天津医科大学;2006年
6 童庆;面向基因预测的信息处理方法研究[D];中国科学技术大学;2006年
7 刘立芳;生物信息学中的多序列比对与模体识别问题研究[D];西安电子科技大学;2006年
8 郭雨珍;蛋白质结构预测和比较的优化研究[D];大连理工大学;2007年
9 熊赟;生物序列模式挖掘与聚类研究[D];复旦大学;2007年
10 张晓丽;几种舌苔蛋白组学初步研究[D];湖北中医学院;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 詹超;支持向量机在基因表达数据分类中的研究[D];武汉理工大学;2006年
2 郭俊恩;蚁群遗传算法在序列比对中的应用[D];江南大学;2008年
3 潘志宏;植物化感作用代谢途径模拟预测系统的构建与应用[D];福建农林大学;2009年
4 郭洪峰;特异上调HO-1基因表达的人工转录因子构建[D];第三军医大学;2009年
5 乐东海;耐辐射球菌DNA连接酶的研究[D];浙江大学;2005年
6 黄志华;水稻基因组中的假基因研究[D];浙江大学;2005年
7 朱贤芳;生物序列的比对算法比较研究[D];南京理工大学;2005年
8 王树青;基于生物信息学的SARS冠状病毒主蛋白酶抑制剂的设计[D];天津师范大学;2005年
9 曲华;一种双聚类算法的实现与改进[D];吉林大学;2005年
10 黄辉;Armillariella tabescens(E-20)cDNA文库部分克隆随机测序及阿拉伯糖苷酶全长cDNA的克隆与表达[D];暨南大学;2005年
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