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《数学的实践与认识》 2010年12期
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基于FCM算法的小脑基因模糊聚类分析

唐世星  陈军  柯凤琴  
【摘要】:探讨基因表达数据的聚类分析方法,结合一种聚类结果的评判准则,应用于胎儿小脑基因表达数据,得到了最优的聚类结果,并做出了生物学解释.利用Matlab软件进行了仿真,利用模糊聚类Xie-Beni指数得到了最优聚类数,并把每一类对应的基因标号输出到txt文件,最后进行生物学解释.得到的小脑基因最优聚类数为3类,与生物学意义比较吻合,各类中的基因功能接近.基于FCM算法的基因模糊聚类是有效的,结果具有一定生物学意义,能对生物学基因聚类有一定指导作用.

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前3条
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【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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10 张莉,孙钢,郭军;基于K-均值聚类的无监督的特征选择方法[J];计算机应用研究;2005年03期
中国重要会议论文全文数据库 前4条
1 李丹丹;;基于遗传模糊聚类的电子商务推荐算法[A];2007北京地区高校研究生学术交流会通信与信息技术会议论文集(上册)[C];2008年
2 杨德武;李霞;朱明珠;王靖;肖雪;;离子通道基因表达谱及其亚型一致性的研究[A];中国生物医学工程进展——2007中国生物医学工程联合学术年会论文集(下册)[C];2007年
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中国博士学位论文全文数据库 前8条
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 黄利文;基于几何概率的聚类分析[D];福州大学;2006年
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6 邓庆山;聚类分析及其在基因表达数据中的应用研究[D];华中科技大学;2004年
7 张白妮;基因数据聚类分析研究[D];湖南大学;2005年
8 涂建东;尺度维条件下空间数据的可视化聚类挖掘研究与应用[D];福州大学;2005年
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10 梁栋;高炉炉况智能化判断方法的研究[D];重庆大学;2005年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前6条
1 余序芬;应用微机图像处理技术测试织物悬垂性研究——悬垂性评价指标的分析与优化[J];东华大学学报(自然科学版);1999年02期
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中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 郑晓亮;基于改进FCM算法的无字典中文文本聚类方法研究[D];浙江大学;2007年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 于剑,程乾生;模糊划分的一个新定义及其应用[J];北京大学学报(自然科学版);2000年05期
2 郑岩,黄荣怀,战晓苏,周春光;基于遗传算法的动态模糊聚类[J];北京邮电大学学报;2005年01期
3 于剑;论模糊C均值算法的模糊指标[J];计算机学报;2003年08期
4 刘宜平,沈毅,刘志言;一种FCM聚类算法的改进与优化[J];系统工程与电子技术;2000年04期
5 胡玉兰,潘福成,梁英,辛彦秋;基于种群规模可变的粗粒度并行遗传算法[J];小型微型计算机系统;2003年03期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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3 高倩倩;须文波;孙俊;;量子行为粒子群算法在基因聚类中的应用[J];计算机工程与应用;2010年21期
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8 孙喜晨;贺仁亚;封举富;;一种新的分类方法——属性均值聚类属性支持向量机(AMC-ASVM)[J];北京大学学报(自然科学版)网络版(预印本);2006年02期
9 蔡瑞初;王美华;郝志峰;温雯;;基于最大间隔的基因表达规则筛选[J];计算机工程与应用;2011年26期
10 骆嘉伟;李仁发;张白妮;;基于多维伪F统计量的基因表达动态聚类分析方法研究[J];系统仿真学报;2006年03期
中国重要会议论文全文数据库 前2条
1 李鹏;阮晓钢;;一种预测多骨髓瘤的神经网络方法[A];第二十二届中国控制会议论文集(下)[C];2003年
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中国博士学位论文全文数据库 前7条
1 陆慧娟;基于基因表达数据的肿瘤分类算法研究[D];中国矿业大学;2012年
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4 王淑琴;机器学习方法及其在生物信息学领域中的应用[D];吉林大学;2009年
5 王开军;基于数据几何特性的概率推理和统计学习研究[D];西安电子科技大学;2008年
6 刘军万;微阵列基因表达数据双聚类的多目标进化计算技术研究[D];国防科学技术大学;2009年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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2 杨小涛;支持向量机算法研究及在基因表达数据分析中的应用[D];华中科技大学;2004年
3 马煜;微阵列数据的聚类算法研究[D];西北大学;2006年
4 王勇;聚类方法在生物数据中的研究与应用[D];江南大学;2008年
5 李建飞;基因表达数据的聚类算法研究[D];燕山大学;2009年
6 王晗;整合变化量与变化趋势的共调控基因相似性度量[D];吉林大学;2008年
7 张小丹;基于支持向量机的基因表达数据特征选取方法研究[D];苏州大学;2008年
8 于攀;基于基因表达数据的肿瘤分类方法研究[D];重庆大学;2012年
9 张帆;基于基因芯片数据的拟南芥抗旱基因预测研究[D];吉林大学;2012年
10 张培;半消极学习及其在生物信息学中的应用[D];华南理工大学;2012年
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