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《生命科学研究》 2006年04期
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用生物信息学方法处理基因芯片结果

李辉  张宏波  杨旭宇  王磊  周文  任彩萍  
【摘要】:基因芯片是一种能够同时检测大量基因在同一组织中表达情况的有力工具.利用前期工作筛选的2210个鼻咽癌差异表达基因和Biocarta信号通路资源库,构建了一个基于信号通路的基因相互作用网络.通过统计学分析,进一步筛选出一批对该基因相互作用网络具有重大影响的基因(特别是RAN、CEL、RELA).随后,采用RT-PCR方法检测候选基因在鼻咽癌活检组织中的表达,发现RAN和CEL基因在高达80%的鼻咽癌组织中高表达.进一步将网络分析结果和ArrayXPath软件分析的结果比较,共计有40%(32/80)基因结果吻合,这验证了网络分析方法的有效性和可行性.最终探索建立了新的分析基因芯片的方法.

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【参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 李虹,韩为农,张玲,谢鹭410078长沙,姚开泰;人鼻咽与鼻咽癌组织p53调节基因差异表达的研究[J];中华肿瘤杂志;2001年06期
2 韩为农,李虹,谢鹭,许亮国,张玲,姚开泰;人鼻咽与鼻咽癌cDNA阵谱中DNA修复相关基因表达差异的初步研究[J];中华肿瘤杂志;2002年02期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 王槐高,黄培春;细胞周期调控因子与鼻咽癌的研究进展[J];现代肿瘤医学;2005年05期
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 李力力;EB病毒致瘤蛋白LMP1调节p53功能活性的研究[D];中南大学;2007年
2 周小军;鼻咽癌高危人群体质特征及其发病学意义的临床与实验研究[D];湖南中医学院;2002年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 何志巍,许亮国,任彩萍,谢鹭,甘润良,姚开泰;人鼻咽与鼻咽癌及肺癌基因表达谱差异的研究[J];生物化学与生物物理进展;1999年05期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 黄迪,潘启超,罗惠玲,焦晓蓉,陈剑经,陈丽珍;EB病毒诱导DNA酶的检定用于鼻咽癌早期发现的初步研究[J];科学通报;1982年06期
2 张思仲,高秀坤,曾毅;人体低分化鼻咽癌上皮样细胞株CNE-2的细胞遗传学研究[J];遗传学报;1983年06期
3 希;;早期发现鼻咽癌的新技术[J];世界科学;1983年06期
4 蔡伟明;胡郁华;张宏兴;徐国镇;秦德兴;吴雪林;严洁华;谷铣之;;活血化瘀中药并用放射治疗鼻咽癌前瞻性对照试验观察的报告[J];中医杂志;1983年09期
5 姚志仁;谢富生;王理章;叶其生;;27例鼻咽癌B淋巴细胞浸润的观察[J];海南大学学报(自然科学版);1985年04期
6 宋钦华;林育元;;皮肌炎并发鼻咽癌一例报告[J];海南大学学报(自然科学版);1986年01期
7 宗永生;;活检组织中所见的鼻咽粘膜上皮[J];汕头大学学报(自然科学版);1986年01期
8 ;中国的咸鱼与癌症的关系[J];生物学通报;1986年04期
9 皮国华,曾毅,叶树清,方仲;用改进的测定Epstein-Barr病毒早期抗原IgA的方法为2054人检查鼻咽癌[J];病毒学报;1987年03期
10 宗永生;李晴雪;;鼻咽癌旁原位癌的病理学研究[J];汕头大学学报(自然科学版);1987年01期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 杨兴龙;申洪;宗永生;;鼻咽癌及癌旁组织超微结构的形态定量研究[A];首届粤港生物物理学术研讨会论文集[C];1999年
2 王晓希;李惠明;刘载道;周健;卢志军;;放射治疗对鼻咽癌病人味觉功能的影响[A];中国营养学会第六届临床营养学术会议论文摘要汇编[C];1997年
3 邹雨荷;郑作深;;鼻咽癌脑转移[A];第八届全国中西医结合肿瘤学术会议论文集[C];2000年
4 斯琴;金武龙;;鼻咽癌在口腔颌面外科的临床特点与诊断分析[A];2000国际暨第六届全国头颈肿瘤外科学术会议论文集[C];2000年
5 张湘民;郭洁波;甘嘉裕;李宁炜;江广理;苏振忠;文卫平;;鼻咽癌微血管畸变的观察研究[A];2000国际暨第六届全国头颈肿瘤外科学术会议论文集[C];2000年
6 黄成林;;鼻咽癌误诊原因分析(附21例报告)[A];2000国际暨第六届全国头颈肿瘤外科学术会议论文集[C];2000年
7 周光华;尹时生;张洁;张瑞芝;田喜顺;;鼻咽癌578例单纯外照射效果分析[A];2000全国肿瘤学术大会论文集[C];2000年
8 李家瑾;;鼻咽癌对耳功能的影响[A];中西医结合“四种耳病”学术会汇编[C];2001年
9 祝小林;刘少英;刘红兵;;鼻咽癌中bc1-2及P53蛋白的检测[A];中西医结合“四种耳病”学术会汇编[C];2001年
10 张穗娥;;浅谈鼻咽癌的中医药营养食疗[A];中国营养学会第八届临床营养学术会议暨第三届营养与肿瘤会议论文摘要汇编[C];2001年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 中山三院心理咨询科 黄铎香 副教授;无病呻吟疑病症[N];广东科技报;2000年
2 许敏谦 宁习源;南方医院创新手术治愈鼻咽癌后遗症[N];广东科技报;2000年
3 陈辉霖;转移性骨肿瘤不再肆虐[N];健康报;2000年
4 通讯员 顾晓兰 记者 杨丽加;八成癌症可预防[N];健康报;2000年
5 本报记者 陈荷英;抗癌明星谈抗癌[N];江西日报;2000年
6 记者 白剑峰;我国癌症发病率呈上升趋势[N];人民日报;2000年
7 戴廷荣;中年耳鸣莫大意[N];山东科技报;2000年
8 刘涛先;FHIT基因 可能为与鼻咽癌相关的抑癌基因[N];中国医学论坛报;2000年
9 李明;鼻炎——并非鼻咽癌的前兆[N];大众科技报;2001年
10 湘雅二医院耳鼻喉科教授 曾益慈;如何早期发现鼻咽癌[N];大众卫生报;2001年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 周小军;鼻咽癌高危人群体质特征及其发病学意义的临床与实验研究[D];湖南中医学院;2002年
2 彭宏;染色体3p21-22区域鼻咽癌相关基因的筛选及其功能的初步研究[D];第一军医大学;2002年
3 李步洪;鼻咽癌的光热特性及其光活检技术研究[D];浙江大学;2003年
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5 唐瑶云;鼻咽癌的基因—放射治疗实验研究[D];中南大学;2003年
6 韩为农;鼻咽低分化鳞状细胞癌的分子分类[D];中南大学;2003年
7 熊炜;鼻咽癌遗传易感性及其易感基因的初步研究[D];中南大学;2003年
8 贺修胜;染色体3p21区域鼻咽癌相关新基因的克隆及其功能研究[D];中南大学;2003年
9 林曰增;MR脑灌注成像在鼻咽癌放疗后放射性脑损伤中的应用研究[D];中国人民解放军第一军医大学;2003年
10 江培洲;EBV与TPA分别及协同处理CNE2细胞诱导基因表达差异的蛋白质组学研究[D];中国人民解放军第一军医大学;2003年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 钟兴;鼻咽癌周围深层蔓延CT影像及其与PCNA表达的相关性研究[D];暨南大学;2001年
2 陈志坚;鼻咽癌鼠移植瘤建立及鼻咽癌病人免疫状况研究[D];汕头大学;2001年
3 马薇;Bcl-2和Bax蛋白在鼻咽癌及癌旁粘膜的表达及意义[D];广西医科大学;2001年
4 冯海燕;基质金属蛋白酶-2、9及组织基质金属蛋白酶抑制剂-1、2在鼻咽癌浸润与转移中的机制研究[D];广西医科大学;2002年
5 崔朝阳;抑癌基因PTEN、P21waf1在鼻咽癌中的表达及其临床意义[D];福建医科大学;2002年
6 杨忠;鼻咽癌MRI表现与P53蛋白的关系[D];暨南大学;2002年
7 何小鹃;鼻咽癌人源抗独特型抗体的制备及筛选[D];中南大学;2003年
8 李旋;基质金属蛋白酶9在鼻咽癌中的表达及其与EB病毒感染的相关性研究[D];浙江大学;2003年
9 王志鹏;湖南汉族人群HLA-DR位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性研究[D];中南大学;2003年
10 张娜;Cyclin D1及PCNA的表达与鼻咽癌放射敏感性的相关性研究[D];中国医科大学;2003年
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